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Biblioteca(s):  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja.
Data corrente:  14/10/2024
Data da última atualização:  14/10/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ROSA, J. da; VIANA, A. J. C.; FERREIRA, F. R. A.; KOLTUN, A.; MERTZ-HENNING, L. M.; MARIN, S. R. R.; RECH FILHO, E. L.; NEPOMUCENO, A. L.
Afiliação:  JULIANA DA ROSA, LONDRINA STATE UNIVERSITY; AMÉRICO JOSÉ CARVALHO VIANA; FERNANDO RAFAEL ALVES FERREIRA; ALESSANDRA KOLTUN; LILIANE MARCIA MERTZ HENNING, CNPSO; SILVANA REGINA ROCKENBACH MARIN, CNPSO; ELIBIO LEOPOLDO RECH FILHO, CENARGEN; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO.
Título:  Optimizing dsRNA engineering strategies and production in E. coli HT115 (DE3).
Ano de publicação:  2024
Fonte/Imprenta:  Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, v. 51, kuae028, 2024.
DOI:  https://doi.org/10.1093/jimb/kuae028
Idioma:  Inglês
Notas:  Na publicação: Elibio Leopoldo Rech.
Conteúdo:  Producing double-stranded RNA (dsRNA) represents a bottleneck for the adoption of RNA interference technology in agriculture, and the main hurdles are related to increases in dsRNA yield, production efficiency, and purity. Therefore, this study aimed to optimize dsRNA production in E. coli HT115 (DE3) using an in vivo system. To this end, we designed a new vector, pCloneVR_2, which resulted in the efficient production of dsRNA in E. coli HT115 (DE3). We performed optimizations in the culture medium and expression inducer in the fermentation of E. coli HT115 (DE3) for the production of dsRNA. Notably, the variable that had the greatest effect on dsRNA yield was cultivation in TB medium, which resulted in a 118% increase in yield. Furthermore, lactose induction (6 g/L) yielded 10 times more than IPTG. Additionally, our optimized up-scaled protocol of the TRIzol™ extraction method was efficient for obtaining high-quality and pure dsRNA. Finally, our optimized protocol achieved an average yield of 53.3 µg/mL after the production and purification of different dsRNAs, reducing production costs by 72%.
Palavras-Chave:  Bacterial dsRNA production; Lactose induction; RNAi.
Thesaurus Nal:  Double-stranded RNA.
Categoria do assunto:  --
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CENARGEN39508 - 1UPCAP - DD
CNPSO41305 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, E. W. A. Desenvolvimento de espécies arbóreas nativas e competição com Brachiaria humidicola em área de restauração de floresta fluvial. 2011. 68 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Florestal) - Universidade Federal do Paraná, Curitiba. Orientador: Gustavo Ribas Curcio. Co-orientador: Alexandre Uhlmann.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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2.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, E.; CURCIO, G. R. Desenvolvimento de espécies nativas sob neossolo flúvico em área de restauração de ambiente fluvial. In: REUNIÃO PARANAENSE DE CIÊNCIA DO SOLO, 2., 2011, Curitiba. Resumos. Curitiba: Universidade Federal do Paraná; Sociedade Paranaense de Ciência do Solo, 2011. p. 83
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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3.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, E. W. A.; CURCIO, G. R.; UHLMANN, A. Inundações e a sobrevivência de espécies nativas em restauração de ambientes fluviais. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 63., 2012, Joinville. Botânica frente às mudanças globais: anais. [S.l.]: Sociedade botânica do Brasil, 2012. Disponível online.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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4.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, E. W. A.; CURCIO, G. R.; UHLMANN, A. Influência competitiva de gramíneas exóticas no desenvolvimento de espécies arbóreas nativas. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 63., 2012, Joinville. Botânica frente às mudanças globais: anais. [S.l.]: Sociedade botânica do Brasil, 2012. Disponível online.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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5.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, E. W. A.; PESCADOR, R. P.; UHLMANN, A. Alocação de recursos (carboidratos) no desenvolvimento inicial de plântulas de Schizolobium parahyba (Vell.) S. F. Blake (Fabaceae - Caesalpinioideae). Revista Árvore, Viçosa, v. 34, n. 4, p. 627-635, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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6.Imagem marcado/desmarcadoSIMÕES, L. H. P; GUILLEMOT, J.; RONQUIM, C. C.; WEIDLICH.; BRANCALION, P. Native regeneration under tropical tree monocultures: a global synthesis. In: ANNUAL MEETING OF THE ASSOCIATION FOR TROPICAL BIOLOGY AND CONSERVATION, 58., 2016, Cartagena. Conserving tropical biodiversity and achieving socio-ecological resilience in the anthropocene: opportunities and challenges. [S.l.]: ATBC, 2022.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
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7.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, E. W. A.; AMARAL, W.; LENGEFELD, E.; REIS, B. P.; GARBOWSKI, M.; MARTELLI, E.; MORAES, L. F. D. de; MURPHY, S. D. The role of emerging scientists in restoration ecology: insights from a SER2023 conference workshop. Restoration Ecology, v. 33, n. 3, e14318, 2025.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoWEIDLICH, W. E. W. A.; AMARAL, V.; LENGEFELD, E.; REIS, B. P.; GARBOWSKI, M.; MARTELLI, E.; MORAES, L. F. D. de; MURPHY, S. The role of emerging scientists in restoration ecology: insights from a SER2023 conference workshop. Restoration Ecology, 8 October, 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSIMÕES, L. H. P.; GUILLEMOT, J.; RONQUIM, C. C.; WEIDLICH, E. W. A.; MUYS, B.; FUZA, M. S.; LIMA, R. A.; BRANCALION, P. H. S. Green deserts, but not always: a global synthesis of native woody species regeneration under tropical tree monocultures. Global Change Biology, v. 30, n. 4, e17269, 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
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10.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, L. C. de; DALL'AGNOL, R.; ETHUR, E. M.; WEIDLICH, L.; KAUFFMANN, C.; SAUTER, I. P.; MUNIZ, A. W.; LOHMANN, P. M.; BOUCHACOURT, O.; GERMANI, J. C.; VAN DER SAND, S. T. Avaliação da atividade antimicrobiana de extrato aquoso e etanólico de Acanthospermum australe. Caderno Pedagógico, Lajeado, v. 9, n. 2, p. 153-161, 2012
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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11.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, L. C.; SAUTER, I. P.; ETHUR, E. M.; KAUFFMANN, C.; DALL'AGNOL, R.; SOUZA, J.; CIBULSKI, S. P.; MUNIZ, A. W.; WEIDLICH, L.; LOHMANN, P. M.; ROEHE, P. M.; GERMANI, J. C.; ROTT, M. B.; VAND DER SAND, S. T. In vitro effect of Acanthospermum australe (Asteraceae) extracts on Acanthamoeba polyphaga trophozoites. Revista Brasileira de Plantas Medicinais, Campinas, v. 15, n. 4, p. 589-594, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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