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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
17/09/2024 |
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Data da última atualização: |
17/09/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FREITAS-ALVES, N. S.; MOREIRA-PINTO, C. E.; TÁVORA, F. T. P. K.; PAES-DE-MELO, B.; ARRAES, F. B. M.; LOURENCO, I. T.; MOURA, S. M.; OLIVEIRA, A. C.; MORGANTE, C. V.; QI, Y.; SA, M. F. G. de. |
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Afiliação: |
NAYARA SABRINA FREITAS-ALVES, FEDERAL UNIVERSITY OF PARANÁ; CLIDIA E. MOREIRA-PINTO, INCT PLANTSTRESS BIOTECH; FABIANO T. P. K. TÁVORA, INCT PLANTSTRESS BIOTECH; BRUNO PAES-DE-MELO, INCT PLANTSTRESS BIOTEC; FABRICIO B. M. ARRAES, INCT PLANTSTRESS BIOTECH; ISABELA TRISTAN LOURENCO TESSUTTI, CENARGEN; STÉFANIE M. MOURA, INCT PLANTSTRESS BIOTECH; ANTONIO C. OLIVEIRA, FEDERAL UNIVERSITY OF PELOTAS; CAROLINA VIANNA MORGANTE, CENARGEN; YIPING QI, UNIVERSITY OF MARYLAND; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN. |
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Título: |
CRISPR/Cas genome editing in soybean: challenges and new insights to overcome existing bottlenecks. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Advanced Research, 2024. |
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Descrição Física: |
On-line first. Na publicação: Isabela T. Lourenço-Tessutti; Maria Fatima Grossi-de-Sa. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.jare.2024.08.024 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soybean is a worldwide-cultivated crop due to its applications in the food, feed, and biodiesel industries. Genome editing in soybean began with ZFN and TALEN technologies; however, CRISPR/Cas has emerged and shortly became the preferable approach for soybean genome manipulation since it is more precise, easy to handle, and cost-effective. Recent reports have focused on the conventional Cas9 nuclease, Cas9 nickase (nCas9) derived base editors, and Cas12a (formally Cpf1) as the most commonly used genome editors in soybean. Nonetheless, several challenges in the complex plant genetic engineering pipeline need to be overcome to effectively edit the genome of an elite soybean cultivar. These challenges include (1) optimizing CRISPR cassette design (i.e., gRNA and Cas promoters, gRNA design and testing, number of gRNAs, and binary vector), (2) improving transformation frequency, (3) increasing the editing efficiency ratio of targeted plant cells, and (4) improving soybean crop production. |
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Palavras-Chave: |
Base editors; Cas12a; CRISPR/Cas9. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic transformation. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aSoybean is a worldwide-cultivated crop due to its applications in the food, feed, and biodiesel industries. Genome editing in soybean began with ZFN and TALEN technologies; however, CRISPR/Cas has emerged and shortly became the preferable approach for soybean genome manipulation since it is more precise, easy to handle, and cost-effective. Recent reports have focused on the conventional Cas9 nuclease, Cas9 nickase (nCas9) derived base editors, and Cas12a (formally Cpf1) as the most commonly used genome editors in soybean. Nonetheless, several challenges in the complex plant genetic engineering pipeline need to be overcome to effectively edit the genome of an elite soybean cultivar. These challenges include (1) optimizing CRISPR cassette design (i.e., gRNA and Cas promoters, gRNA design and testing, number of gRNAs, and binary vector), (2) improving transformation frequency, (3) increasing the editing efficiency ratio of targeted plant cells, and (4) improving soybean crop production.
650 $aGenetic transformation
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700 1 $aMORGANTE, C. V.
700 1 $aQI, Y.
700 1 $aSA, M. F. G. de
773 $tJournal of Advanced Research, 2024.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 10 | |
| 2. |  | JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; STANTON, D. W. G.; CONRADO, A. C.; DUPONT, L.; TAHERI, S.; SILVA, E. da; CUNHA, L.; BROWN, G. G. A neotype for Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) (Clitellata). Zootaxa, v. 4545, n. 1, p. 124-132, Jan. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 3. | | CONRADO, A. C.; ARRUDA, H.; STANTON, D. W. S.; JAMES, S. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, E.; TAHERI, S.; MORGAN, A. J.; SIMÕES, N.; RODRIGUES, A.; MONTIEL, R.; CUNHA, L. The complete mitochondrial DNA sequence of the pantropical earthworm Pontoscolex corethrurus (Rhinodrilidae, Clitellata): mitogenome characterization and phylogenetic positioning. ZooKeys, v. 688, Aug. 2017. 13 p. Publicado na PeerJ Preprints em 3 mar. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 4. | | NADOLNY, H.; SANTOS, A.; DEMETRIO, W.; FERREIRA, T.; MAIA, L. dos S.; CONRADO, A. C.; BARTZ, M.; GARRASTAZU, M. C.; SILVA, E. da; LAVELLE, P.; BARETTA, D.; PASINI, A.; VEZZANI, F.; SOUSA, J. P.; CUNHA, L.; MATHIEU, J.; ROMBKE, J.; BROWN, G. G. Recommendations for assessing earthworm populations in Brazilian ecosystems. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01006, 2020. Título em português: Recomendações para avaliação de populações de minhocas em ecossistemas brasileiros.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | CUNHA, L.; BARTZ, M.; DEMETRIO, W.; SILVA, T.; JAMES, S.; SILVA, E. da; STANTON, D.; CONRADO, A. C.; DECAENS, T.; LAVELLE, P.; SANTOS, A.; NADOLNY, H.; VELÁSQUEZ, E.; ZANGERLÉ, A.; TAPIA-CORAL, S.; FERREIRA, T.; MAIA, L.; SEGALLA, R.; CLEMENT, C.; MUNIZ, A. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G. Earthworms and Amazonian Dark Earths: improving understanding of the relationships between soil management, biodiversity and function. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 7., 2016, Paimpont. Taxonomy, phygeny and ecology of earthworm's communities. [Rennes]: Université de Rennes, [2016]. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 6. | | CUNHA, L.; BARTZ, M.; DEMETRIO, W.; SILVA, T.; JAMES, S.; SILVA, E. da; STANTON, D.; CONRADO, A. C.; DECAENS, T.; LAVELLE, P.; SANTOS, A.; NADOLNY, H.; VELÁSQUEZ, E.; ZANGERLÉ, A.; TAPIA-CORAL, S.; FERREIRA, T.; MAIA, L.; SEGALLA, R.; CLEMENT, C.; MUNIZ, A. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; TPI NETWORK. Earthworms and Amazonian Dark Earths: improving understanding of the relationships between soil management, biodiversity and function. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 7., 2016, Paimpont. Taxonomy, phygeny and ecology of earthworm's communities. [Rennes]: Université de Rennes, [2016]. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 7. | | BROWN, G. G.; SILVA, E. da; THOMAZINI, M. J.; NIVA, C. C.; DECAËNS, T.; CUNHA, L. F. N.; NADOLNY, H. S.; DEMETRIO, W. C.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; MAIA, L. S.; CONRADO, A. C.; SEGALLA, R. F.; FERREIRA, A. C.; PASINI, A.; BARTZ, M. L. C.; SAUTTER, K. D.; JAMES, S. W.; BARETTA, D.; ANTONIOLLI, Z. I.; IGLESIAS BRIONES, M. J.; SOUSA, J. P.; RÖMBKE, J.; LAVELLE, P. The role of soil fauna in soil health and delivery of ecosystem services. In: REICOSKY, D. (Ed.). Managing soil health for sustainable agriculture: v. 1: fundamentals. [S.l.]: Burleigh Dodds Science Publ., 2018. p. 1-45. (Burleigh Dodds series in agricultural science).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Florestas. |
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| 8. | | CONRADO, A. C.; DEMETRIO, W. C.; STANTON, D. W. G.; BARTZ, M. L. C.; JAMES, S. W.; SANTOS, A.; SILVA, E. da; FERREIRA, T.; ACIOLI, A. N. S.; FERREIRA, A. C.; MAIA, L. S.; SILVA, T. A. C.; LAVELLE, P.; VELASQUEZ, E.; TAPIA-CORAL, S. C.; MUNIZ, A. W.; SEGALLA, R. F.; DECAËNS, T.; NADOLNY, H. S.; PEÑA-VENEGAS, C.; PASINI, A.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; TPI NETWORK; KILLE, P.; BROWN, G. G.; CUNHA, L. Amazonian earthworm biodiversity is heavily impacted by ancient and recent human disturbance. Science of the Total Environment, v. 895, art. 165087, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Florestas. |
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| 9. | | BROWN, G. G.; DEMETRIO, W.; GABRIAC, Q.; PASINI, A.; KORASAKI, V.; OLIVEIRA, L.; FRANCHINI, J. C.; TORRES, E.; GALERANI, P. R.; GAZZIERO, D. L. P.; BENITO, N. P.; NUNES, D. H.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; NADOLNY, H. S.; BARTZ, M.; MASCHIO, W.; DUDAS, R. T.; ZAGATTO, M.; NIVA, C. C.; CLASEN, L.; SAUTTER, K.; FROUFE, L. C. M.; SEOANE, C. E. S.; MORAES, A. de; JAMES, S.; ALBERTON, O.; JÚNIOR, O. B.; SARAIVA, O. F.; GARCIA, A.; OLIVEIRA, E.; CÉSAR, R.; CORREA-FERREIRA, B. S.; BRUZ, L. S. M.; SILVA, E. da; CARDOSO, G. B. X.; LAVELLE, P.; VELÁSQUEZ, E.; CREMONESI, M.; PARRON, L. M.; BAGGIO, A. J.; NEVES, E. J. M.; HUNGRIA, M.; CAMPOS, T. A.; SILVA, V. L. da; REISSMANN, C. B.; CONRADO, A. C.; BOUILLET, J. D.; GONÇALVES, J. L. M.; BRANDANI, C. B.; VIANI, R. A. G.; PAULA, R. R.; LACLAU, J.; PEÑA-VENEGAS, C. P.; PERES, C.; DECAËNS, T.; PEY, B.; EISENHAUER, N.; COOPER, M.; MATHIEU, J. Soil macrofauna communities in Brazilian land-use systems. Biodiversity Data Journal, v. 12, e115000, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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