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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Soja; Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
28/08/2024 |
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Data da última atualização: |
28/08/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BALDANI, J. I.; FERREIRA, N. dos S.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; SOARES, L. H. de B.; ARAUJO, J. L. S. de; DOURADO, F. dos S.; BACH, e.; CAMACHO, N. N.; OLIVEIRA, A. M. de; ALVES, B. J. R.; SILVA, A. L.; ROSSI, C. N.; OLIVEIRA JUNIOR, A. F. de; ZILLI, J. E. |
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Afiliação: |
JOSE IVO BALDANI, CNPAB; NATALIA DOS SANTOS FERREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; STEFAN SCHWAB, CNPAB; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; LUIS HENRIQUE DE BARROS SOARES, CPACT; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; FERNANDA DOS SANTOS DOURADO, CNPAB; EVELISE BACH, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL; NATALIA NEUTZLING CAMACHO, CNPS; AMANDA MAURA DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; BRUNO JOSE RODRIGUES ALVES, CNPAB; ANDREIA LOVIANE SILVA, CNPAB; CAROLINA NACHI ROSSI, CNPSO; ALBERTO FERNANDES DE OLIVEIRA JUNIOR, CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB. |
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Título: |
Nitrospirillum viridazoti sp. nov., an efficient nitrogen-fixing species Isolated from grasses. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Current Microbiology , v. 81, n. 6, p. 144-166, 2024. |
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ISSN: |
1432-0991 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A group of Gram-negative plant-associated diazotrophic bacteria belonging to the genus Nitrospirillum was investigated,including both previously characterized and newly isolated strains from diverse regions and biomes, predominantly in Brazil. Phylogenetic analysis of 16S rRNA and recA genes revealed the formation of a distinct clade consisting of thirteen strains, separate from the formally recognized species N. amazonense (the closest species) and N. iridis. Comprehensive taxonomic analyses using the whole genomes of four strains (BR 11140T=AM 18T=Y-2T=DSM 2788T=ATCC 35120T, BR 11142T=AM 14T=Y-1T=DSM 2787T=ATCC 35119T, BR 11145=CBAmC, and BR 12005) supported the division of these strains into two species: N. amazonense (BR 11142 T and BR 12005) and a newly proposed species (BR 11140 T and BR 11145), distinct from N. iridis. The phylogenomic analysis further confrmed the presence of the new Nitrospirillum species. Additionally, MALDI-TOF MS analysis of whole-cell mass spectra provided further evidence for the diferentiation of the proposed Nitrospirillum species, separate from N. amazonense. Analysis of chemotaxonomy markers (i.e., genes involved in fatty acid synthesis, metabolism and elongation, phospholipid synthesis, and quinone synthesis) revealed that the new species highlights high similarity and evolutionary convergence with other Nitrospirillum species. This new species exhibited nitrogen fxation ability in vitro, it has similar NifHDK protein phylogeny position with the closest species, lacked denitrifcation capability, but possessed the nosZ gene, enabling N2O reduction, distinguishing it from the closest species. Despite being isolated from diverse geographic regions, soil types, and ecological niches, no signifcant phenotypic or physiological diferences were observed between the proposed new species and N. amazonense. Based on these fndings, a new species, Nitrospirillum viridazoti sp. nov., was classifed, with the strain BR 11140T (DSM 2788T, ATCC 35120T) designated as the type strain. MenosA group of Gram-negative plant-associated diazotrophic bacteria belonging to the genus Nitrospirillum was investigated,including both previously characterized and newly isolated strains from diverse regions and biomes, predominantly in Brazil. Phylogenetic analysis of 16S rRNA and recA genes revealed the formation of a distinct clade consisting of thirteen strains, separate from the formally recognized species N. amazonense (the closest species) and N. iridis. Comprehensive taxonomic analyses using the whole genomes of four strains (BR 11140T=AM 18T=Y-2T=DSM 2788T=ATCC 35120T, BR 11142T=AM 14T=Y-1T=DSM 2787T=ATCC 35119T, BR 11145=CBAmC, and BR 12005) supported the division of these strains into two species: N. amazonense (BR 11142 T and BR 12005) and a newly proposed species (BR 11140 T and BR 11145), distinct from N. iridis. The phylogenomic analysis further confrmed the presence of the new Nitrospirillum species. Additionally, MALDI-TOF MS analysis of whole-cell mass spectra provided further evidence for the diferentiation of the proposed Nitrospirillum species, separate from N. amazonense. Analysis of chemotaxonomy markers (i.e., genes involved in fatty acid synthesis, metabolism and elongation, phospholipid synthesis, and quinone synthesis) revealed that the new species highlights high similarity and evolutionary convergence with other Nitrospirillum species. This new species exhibited nitrogen fxation ability in vitro, it has similar NifHDK protein phylogeny position wi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análise filogenética; Análises taxonômicas; BR 11140; Nitrospirillum viridazoti sp; Phylogenetic analysis; Taxonomic analyses. |
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Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio; Gramínea; Taxonomia Vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Grasses; Nitrogen fixation. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 1. |  | BORELLA, J.; DURIGON, M. A.; AMARANTE, L. do; EMYGDIO, B. M. Fermentative enzymes activity in soybean roots and nodules under hypoxia and post-hypoxia conditions. Ciência Rural, Santa Maria, v. 43, n. 6, p.970-977, jun, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 2. | | MARAFON, A. C.; CITADIN, I.; AMARANTE, L. do; HERTER, F. G.; HAWERROTH, F. J. Chilling privation during dormancy period and carbohydrate mobilization in Japanese pear trees. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 68, n. 4, p. 462-468, jul./ago. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 3. | | MARAFON, A. C.; CITADIN, I.; AMARANTE, L. do; HERTER, F. G.; HAWERROTH, F. J. Chilling privation during dormancy period and carbohydrate mobilization in Japanese pear trees. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 68, n. 4, p. 462-468, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 4. | | BASHIR, I.; NICOLAO, R.; SHIMOIA, E. P.; AMARANTE, L. do; CASTRO, C. M.; HEIDEN, G. A methodological approach for evaluating the genotypic variation for physiological adaptation of potato wild relatives for heat tolerance breeding. Plants, v. 14, n. 19, 3096, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | DURIGON, M. A.; BORELLA, J.; AMARANTE, L. do; COLARES, D. dos S.; EMYGDIO, B. M.; OLIVEIRA, A. C. B. de. Avaliação de parâmetros fisiológicos em cultivares de soja submetidos a ciclos de inundação e drenagem do sistema de cultivo. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO SUL, 38., 2010, Cruz Alta. Atas e resumos. Cruz Alta: FUNDACEP FECOTRIGO, 2010. p. 94-97.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 7. | | BORELLA, J.; DURIGON, M. A.; AMARANTE, L. do; COLARES, D. dos S.; EMYGDIO, B. M.; OLIVEIRA, A. C. B. de. Características de crescimento e teor de pigmentos fotossintéticos de três genótipos de soja submetidos a períodos intermitentes de hipoxia do sistema radicular. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO SUL, 38., 2010, Cruz Alta. Atas e resumos. Cruz Alta: FUNDACEP FECOTRIGO, 2010. p. 98-101.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | SEVERO, T. M.; BUENO JUNIOR, A. A. A.; ZENZEN, I. L.; XAVIER, C.; MITTELMANN, A.; AMARANTE, L. do. Efeito do alagamento sobre o crescimento de plantas noduladas de soja. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 9., 2007, Pelotas. Pesquisa e responsabilidade ambiental: resumos expandidos ... Pelotas: UFPel: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, 2007. 01 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | SEVERO, T. M.; BUENO JUNIOR, A. A. A.; ZENZEN, I. L.; XAVIER, C.; MITTELMANN, A.; AMARANTE, L. do. Efeito do alagamento sobre o crescimento de plantas noduladas de soja. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPEL, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | DURIGON, M. A.; LANGARO, A. C.; AMARANTE, L do; ROSA, G. G. da; LIMA, M. C.; SCHNEIDER, L.; BADINELLI, P. G.; VERNETTI JUNIOR, F. de J. Análises de crescimento de genótipos exóticos de soja nodulada submetidos ao alagamento. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18., MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 8., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: UCPel, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | SILVA, R. S. da; OLIVEIRA, F. K. de; OLIVEIRA, A. C. B. de; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L.; AMARANTE, L. do. Enzimatic antioxidant activity in nodules of two soybean genotypes submitted to hypoxia. In: REUNIÓN ARGENTINA, 32.; CONGRESO LATINOAMERICANO DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 16., 2018, Córdoba, Argentina. Conocimiento para el desarrollo sustentable, equitativo y soberano: libro de resumenes... Córdoba, Argentina: SAFV, 2018. p. 158.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | LEITZKE, S.; COCCO, K. L. T.; MARTINS, A. C.; OLIVEIRA, D. dos S. C. de; OLIVEIRA, A. C. B. de; AMARANTE, L. do. Estresse oxidativo em raízes de soja submetidas à deficiência de oxigênio e influência do nitrato. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 25.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 2., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 15. | | MARTINS, A. C.; AMARANTE, L. DO; LARRÉ, C. F.; EICHHOLZ, R. F.; BORELLA JÚNIOR; DELIAS, D. DOS S.; COCCO, K. L. T.; LEITZKE, S.; BORTOLINI, F. Photosynthetic pigment levels in Macroptilium lathyroides L under water deficit. In: REUNIÓN ARGENTINA DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 31., 2016, Corrientes. Enfrentando el cambio climático haciendo sostenible Ia productividad agro-forestal. Corrientes, Argentina, SAFV, 2016. p. 157. Título em espanhol: Contenido de pigmentos fotosinteticos Macroptilium lathyroides L en condiciones de sequia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | SEVERO, T. M.; BUENO JUNIOR, A. A.; ZENZEN, I. L.; AMARANTE, L. do; NASCIMENTO, J. S.; VERNETTI JUNIOR, F. de J. Efeito da deficiência de O2 no solo sobre o vigor, diâmetro do caule e estatura de planta em genótipos de soja associados simbióticamente com Bradyrhizobium. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 9., 2007, Pelotas. Pesquisa e responsabilidade ambiental: resumos... Pelotas : UFPel: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, 2007. 01 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 17. | | POSSO, D. A.; SILVA, C. J. da; SHIMÓIA, E. P.; LUCAS, D. G. R.; AGUALONGO, D. A. P.; OLIVEIRA, A. C. B. de; AMARANTE, L. do. Leaf gas exchange in two soybean genotypes under flooding condition. In: BRAZILIAN CONGRESS OF PLANT PHYSIOLOGY, 17., 2019, Cuiabá. [Anais]. [Rio Claro: SBFV], 2019. p. 197| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | MARTINS, T. S.; DA-SILVA, C. J.; SHABALA, S.; STRIKER, G. G.; CARVALHO, I. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; AMARANTE, L. do. Understanding plant responses to saline waterlogging: insights from halophytes and implications for crop tolerance. Planta, v. 259, n. 1, p. 0032-0935, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 19. | | SHIMOIA, E. P.; POSSO, D. A.; DA-SILVA, C. J.; BESTER, A. U.; BERNARDI, N. D. C.; CARVALHO, I. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; AVILA, L. A. de; AMARANTE, L. do. Co-Inoculation of Soybean Seeds with Azospirillum and/or Rhizophagus Mitigates the Deleterious Effects of Waterlogging in Plants under Enhanced CO2 Concentrations Nitrogen, v. 5, n. 4, p. 941-976, p. 2504-3129, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 20. | | OLIVEIRA, F. K.; POMAGUALLI, D.; GARCIA, N. da S.; SILVA, R. S. da; SILVA, J. V. L.; AMARANTE, L. do; OLIVEIRA, A. C. B.; BRITO, G. G.; NEPOMUCENO, A. L.; MERTZ-HENNING, L. M. Photosynthetic traits for the evaluation of flooding in soybean GM line. In: REUNIÓN ARGENTINA, 32.; CONGRESO LATINOAMERICANO DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 16., 2018, Córdoba, Argentina. Conocimiento para el desarrollo sustentable, equitativo y soberano: libro de resumenes... Córdoba, Argentina: SAFV, 2018. p. 170-171.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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