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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
30/11/2023 |
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Data da última atualização: |
30/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CRUZ, J. N.; SILVA, S. G.; PEREIRA, D. S.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; OLIVEIRA, M. S. de; LIMA, R. R.; ANDRADE, E. H. de A. |
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Afiliação: |
JORDDY NEVES CRUZ, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; SEBASTIÃO GOMES SILVA, MUSEU PARAENSE EMÍLIO GOELDI; DANIEL SANTIAGO PEREIRA, CPATU; ANTONIO PEDRO DA SILVA SOUZA FILHO, CPATU; MOZANIEL SANTANA DE OLIVEIRA, MUSEU PARAENSE EMÍLIO GOELDI; RAFAEL RODRIGUES LIMA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; ELOISA HELENA DE AGUIAR ANDRADE, MUSEU PARAENSE EMÍLIO GOELDI. |
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Título: |
In silico evaluation of the antimicrobial activity of thymol—major compounds in the essential oil of Lippia thymoides Mart. & Schauer (Verbenaceae). |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecules, v. 27, n. 15, 4768, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/molecules27154768 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In this paper, we evaluated the drug-receptor interactions responsible for the antimicrobial activity of thymol, the major compound present in the essential oil (EO) of Lippia thymoides (L. thymoides) Mart. & Schauer (Verbenaceae). It was previously reported that this EO exhibits antimicrobial activity against Candida albicans (C. albicans), Staphylococcus aureus (S. aureus), and Escherichia coli (E. coli). Therefore, we used molecular docking, molecular dynamics simulations, and free energy calculations to investigate the interaction of thymol with pharmacological receptors of interest to combat these pathogens. We found that thymol interacted favorably with the active sites of the microorganisms’ molecular targets. MolDock Score results for systems formed with CYP51 (C. albicans), Dihydrofolate reductase (S. aureus), and Dihydropteroate synthase (E. coli) were −77.85, −67.53, and −60.88, respectively. Throughout the duration of the MD simulations, thymol continued interacting with the binding pocket of the molecular target of each microorganism. The van der Waals (ΔEvdW = −24.88, −26.44, −21.71 kcal/mol, respectively) and electrostatic interaction energies (ΔEele = −3.94, −11.07, −12.43 kcal/mol, respectively) and the nonpolar solvation energies (ΔGNP = −3.37, −3.25, −2.93 kcal/mol, respectively) were mainly responsible for the formation of complexes with CYP51 (C. albicans), Dihydrofolate reductase (S. aureus), and Dihydropteroate synthase (E. coli). |
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Palavras-Chave: |
Atividade biológica; Biological activity; Interaction mechanism; Lippia thymoides; Mecanismo de interação; Modelagem molecular; Molecular modeling; Natural products; Produtos naturais; Timol. |
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Thesagro: |
Óleo. |
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Thesaurus Nal: |
Thymol. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 2. |  | SOUZA, T. T. C.; ALVES, D. M. T.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T. Sequence and transient expression of groel protein isolated from whitefly endosybiont for use of geminivirus control. Virus Reviews & Research, Florianópolis, v. 9, p. 241, 2004. Suplement 1. Resumos. Trabalho apresentado no 15º National Meeting of Virology, São Pedro, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 3. | | SOUZA, T. T.; TEIXEIRA, W. G.; STEINER, C.; LIMA, A.; ARRUDA, A.; MOREIRA, A. The enhance of soil cation exchange capacity by using charcoal in an Typic clayey Acrothoxl in the Central Amazon - Brazil. In: INTERNATIONAL BIOCHAR CONFERENCE, 3., 2010, Rio de Janeiro. Progressing from Terra Preta de Índios to the whole world: anais. Rio de Janeiro: Embrapa, 2010. p. 185-186.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 4. | | SOUZA, T. T.; TEIXEIRA, W. G.; STEINER, C.; LIMA, A.; ARRUDA, A.; MOREIRA, A. The enhance of soil cation exchange capacity by using charcoal in an Typic clayey Acrothoxl in the Central Amazon - Brazil. In: INTERNATIONAL BIOCHAR CONFERENCE, 3., 2010, Rio de Janeiro. Progressing from Terra Preta de Índios to the whole world: anais. Rio de Janeiro: Embrapa, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 5. | | MARIN, F. R.; SILVA, E. F.; GONÇALVES, A. O.; SOUZA, T. T.; SOBENKO, L. R. Improving irrigation management based on canopy-atmosphere coupling. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 20.; SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 5., 2017, Petrolina, Juazeiro. A agrometeorologia na solução de problemas multiescala: anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia; Juazeiro: UNIVASF, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 6. | | SOUZA, T. T. dos S.; LOIOLA FILHO, J. B.; MONTE, A. P. O. do; MIRANDA, M. de S.; CORDEIRO, M. F.; LOPES JÚNIOR, E. S. L. Efeito da dose de pFSH na produção in vivo de embriões de ovelhas da raça Dorper exploradas no Semiárido do Nordeste do Brasil. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 7.; JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FACEPE/UNIVASF, 1., 2012, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2012. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 248).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | COLTRI, P. P.; CORDEIRO, R. L. F.; SOUZA, T. T. de; ROMANI, L. A. S.; ZULLO JÚNIOR, J.; TRAINA JÚNIOR, C.; TRAINA, A. J. M. Classificação de áreas de café em Minas Gerais por meio do novo algoritmo QMAS em imagem espectral Geoeye-1. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 15., 2011, Curitiba. Anais... São José dos Campos: INPE, 2011. p. 0539-0546. SBSR 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 8. | | SOBENKO, L. R.; SOUZA, T. T.; GONÇALVES, A. O.; BIANCHINI, V. J. M.; SILVA, E. H. F. M.; SOUZA, L. T.; MARIN, F. R. Irrigation requirements are lower than those usually prescribed for a maize crop in Southern Brazil. Experimental Agriculture, v. 55, n. 4, p. 662-671, Aug. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 9. | | NASCIMENTO, T. V. C.; MIRANDA, M. de S.; BARROS, C. H. S. C.; SOUZA, T. T. dos S.; LOPES JÚNIOR, E. S.; VOLTOLINI, T. V.; MORAES, S. A. de; NOGUEIRA, D. M.; CORDEIRO, M. F. Return of postpartum ovarian activity in dairy goats supplemented with different levels of energy. Revista Brasileira de Saúde Produção Animal, Salvador, v. 15, n. 4, p. 1061-1071, out./dez., 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 10. | | CORDEIRO, R. L. F.; GUO, F.; HAVERKAMP, D. S.; HORNE, J. H.; HUGHES, E. K.; KIM, G.; ROMANI, L. A. S.; COLTRI, P. P.; SOUZA, T. T.; TRAINA, A. J. M.; TRAINA JÚNIOR, C.; FALOUTSOS, C. QuMinS: fast and scalable querying, mining and summarizing multi-modal databases. Information Sciences, New York, v. 164, p. 211-229, Apr. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 11. | | MONTE, A. P. O. do; LOIOLA FILHO, J. B.; SOUZA, T. T. dos S.; MIRANDA, M. de S.; MAGALHÃES, L. C.; BARROS, C. H. S. C.; SILVA, A. A. de A.; SANTOS, A. O.; GUIMARÃES, A. de S. L.; COSTA, J. M. da S.; SOUSA, P. H. F. de; NOGUEIRA, D. M.; CORDEIRO, M. F.; LOPES JÚNIOR, E. S. Addition of sucrose on cryoprotectant solution of vitrification enhances the quality of Dorper sheep embryos produced in vivo. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 36, n. 6, p. 4257-4268, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | NASCIMENTO, T. V. C.; LOPES JÚNIOR, E. S.; MIRANDA, M. de S.; SOUZA, T. T. dos S.; SILVA, A. A. de A.; LIMA, A. G. V. de O.; NOGUEIRA, D. M.; CORDEIRO, M. F.; MORAES, S. A. de; VOLTOLINI, T. V. Factors affecting postpartum ovarian activity of goats in tropical semi-arid region. Revista ded la Facultad de Ciencias Agrarias - UNcuyo, v. 53, n. 1, p. 330-345, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 13. | | MAGALHÃES, L. C.; LOPES JÚNIOR, E. S.; GUIMARÃES, A. de S. L.; MIRANDA, M. de S.; SOUZA, T. T. dos S.; MONTE, A. P. O. de; SILVA, A. A. de A.; SAMPAIO, L. S.; NASCIMENTO, T. V. C.; SOUSA, P. H. F. de; NOGUEIRA, D. M.; CORDEIRO, M. F. Comparison between Day 0 and traditional protocols for estrus synchronization and multiple ovulation in crossbred hair sheep. Journal of Applied Animal Research, v. 47, n. 1, p. 560-564, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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