| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agroenergia. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
|
Data corrente: |
20/11/2023 |
|
Data da última atualização: |
20/11/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
|
Autoria: |
BALESTRINI, V. P. |
|
Afiliação: |
VITÓRIA PINHEIRO BALESTRINI, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
|
Título: |
Análise de metagenome-assembled genomes de uma comunidade microbiana enriquecida com lignina. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
2022. |
|
Páginas: |
84 f. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Dissertação (Mestrado) - Universidade de Brasília. Coorientadora: Dra. Betânia Ferraz Quirino - Embrapa Agroenergia. |
|
Conteúdo: |
A desconstrução da lignina por bactérias é um ramo recente nas pesquisas e possui diversas vantagens frente aos fungos, como a maior especificidade das reações e a facilidade de manipulação genética. Nesse estudo, foi analisada a diversidade microbiana de três consórcios enriquecidos para microrganismos capazes de degradar lignina com foco nas bactérias. Os consórcios foram obtidos a partir de três tipos de solo, sendo dois comerciais e um solo de compostagem jardim, cultivados a 30˚C e enriquecidos por meio de sucessivas passagens em meio de cultura na qual a lignina extraída por método alcalino foi usada como única fonte de carbono. Foi extraído o DNA metagenômico da terceira passagem do enriquecimento, sendo feito o sequenciamento pelo Joint Genome Institute. A partir desse sequenciamento foi recuperado 232 genomas montados, destacando-se 39 genomas após critérios de qualidade de completude de pelo menos 70% e contaminação menor ou igual a 10%. Desses 39 genomas, os filos mais abundantes nos três consórcios foram de Proteobacteria, Bacteroidetes e Actinobacteria, com somente dois genomas com taxonomia a nível de espécie. Os consórcios apresentaram funções condizentes com o local de isolamento, no caso o solo, além de possíveis metabolismos relacionados à degradação da lignina. Foram escolhidos 4 genomas, com base na taxonomia somente, por terem chegado apenas em nível de classe, para análises mais profundas de degradação de lignina focada nos monolignóis. Os genomas de Actinobacteria BY 70_11 e Actinobacteria BY 2_71_9 e Alphaproteobacteria MG 62_16 e Alphaproteobacteria MG 3_66_13, além de não representarem a mesma espécie, mostraram diferentes vias metabólicas relacionadas à degradação dos monolignóis, de acordo com anotação metabólica realizada. Desses, a Actinobacteria BY 70_11 apresentou a maior quantidade de genes associados à degradação de lignina. Entretanto, não se pode afirmar inequivocamente sobre a capacidade ou não de degradação da lignina codificada nesses 4 genomas pela falta de literatura sobre essas vias específicas. Apesar disso, ambos genomas de Actinobacteria apresentaram a via do ácido cafeico, um dos mais importantes compostos fenólicos, apresentando diversas propriedades biológicas, como antimicrobiana e antioxidante, via nunca reportada antes nessa classe de bactérias. Além dos 4 genomas apresentaram diferentes genes relacionados à degradação da lignina. MenosA desconstrução da lignina por bactérias é um ramo recente nas pesquisas e possui diversas vantagens frente aos fungos, como a maior especificidade das reações e a facilidade de manipulação genética. Nesse estudo, foi analisada a diversidade microbiana de três consórcios enriquecidos para microrganismos capazes de degradar lignina com foco nas bactérias. Os consórcios foram obtidos a partir de três tipos de solo, sendo dois comerciais e um solo de compostagem jardim, cultivados a 30˚C e enriquecidos por meio de sucessivas passagens em meio de cultura na qual a lignina extraída por método alcalino foi usada como única fonte de carbono. Foi extraído o DNA metagenômico da terceira passagem do enriquecimento, sendo feito o sequenciamento pelo Joint Genome Institute. A partir desse sequenciamento foi recuperado 232 genomas montados, destacando-se 39 genomas após critérios de qualidade de completude de pelo menos 70% e contaminação menor ou igual a 10%. Desses 39 genomas, os filos mais abundantes nos três consórcios foram de Proteobacteria, Bacteroidetes e Actinobacteria, com somente dois genomas com taxonomia a nível de espécie. Os consórcios apresentaram funções condizentes com o local de isolamento, no caso o solo, além de possíveis metabolismos relacionados à degradação da lignina. Foram escolhidos 4 genomas, com base na taxonomia somente, por terem chegado apenas em nível de classe, para análises mais profundas de degradação de lignina focada nos ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Enriquecimento de comunidades; Metagenômica. |
|
Thesagro: |
Bactéria; Lignina; Metabolismo; Solo. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 03184nam a2200205 a 4500
001 2158604
005 2023-11-20
008 2022 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aBALESTRINI, V. P.
245 $aAnálise de metagenome-assembled genomes de uma comunidade microbiana enriquecida com lignina.$h[electronic resource]
260 $a2022.$c2022
300 $a84 f.
500 $aDissertação (Mestrado) - Universidade de Brasília. Coorientadora: Dra. Betânia Ferraz Quirino - Embrapa Agroenergia.
520 $aA desconstrução da lignina por bactérias é um ramo recente nas pesquisas e possui diversas vantagens frente aos fungos, como a maior especificidade das reações e a facilidade de manipulação genética. Nesse estudo, foi analisada a diversidade microbiana de três consórcios enriquecidos para microrganismos capazes de degradar lignina com foco nas bactérias. Os consórcios foram obtidos a partir de três tipos de solo, sendo dois comerciais e um solo de compostagem jardim, cultivados a 30˚C e enriquecidos por meio de sucessivas passagens em meio de cultura na qual a lignina extraída por método alcalino foi usada como única fonte de carbono. Foi extraído o DNA metagenômico da terceira passagem do enriquecimento, sendo feito o sequenciamento pelo Joint Genome Institute. A partir desse sequenciamento foi recuperado 232 genomas montados, destacando-se 39 genomas após critérios de qualidade de completude de pelo menos 70% e contaminação menor ou igual a 10%. Desses 39 genomas, os filos mais abundantes nos três consórcios foram de Proteobacteria, Bacteroidetes e Actinobacteria, com somente dois genomas com taxonomia a nível de espécie. Os consórcios apresentaram funções condizentes com o local de isolamento, no caso o solo, além de possíveis metabolismos relacionados à degradação da lignina. Foram escolhidos 4 genomas, com base na taxonomia somente, por terem chegado apenas em nível de classe, para análises mais profundas de degradação de lignina focada nos monolignóis. Os genomas de Actinobacteria BY 70_11 e Actinobacteria BY 2_71_9 e Alphaproteobacteria MG 62_16 e Alphaproteobacteria MG 3_66_13, além de não representarem a mesma espécie, mostraram diferentes vias metabólicas relacionadas à degradação dos monolignóis, de acordo com anotação metabólica realizada. Desses, a Actinobacteria BY 70_11 apresentou a maior quantidade de genes associados à degradação de lignina. Entretanto, não se pode afirmar inequivocamente sobre a capacidade ou não de degradação da lignina codificada nesses 4 genomas pela falta de literatura sobre essas vias específicas. Apesar disso, ambos genomas de Actinobacteria apresentaram a via do ácido cafeico, um dos mais importantes compostos fenólicos, apresentando diversas propriedades biológicas, como antimicrobiana e antioxidante, via nunca reportada antes nessa classe de bactérias. Além dos 4 genomas apresentaram diferentes genes relacionados à degradação da lignina.
650 $aBactéria
650 $aLignina
650 $aMetabolismo
650 $aSolo
653 $aEnriquecimento de comunidades
653 $aMetagenômica
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 32 | |
| 3. |  | FRIGO, A.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Identificação de SNPs nos genes MYH2 e CLIC4 associados à hérnia umbilical em suínos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 32-33. JINC 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|    |
| 4. | | SAVOLDI, I. R.; PETRY, B.; CARMO, K. B. do; MARCIANO, C. M. M.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Seleção de genes constitutivos para estudos de expressão gênica em ossos de frangos de corte aos 35 dias de idade. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 10., 2016, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2016. p. 28-29.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 5. | | KOWACIC, R. da C.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Padronização da técnica de high resolution melting para detecção de um SNP no gene da calmodulina em galinhas. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 9., 2015, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2015. p. 135-136.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 6. | | SAVOLDI, I. R.; PETRY, B.; CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão do gene PTHLH em frangos de corte normais e afetados pela necrose da cabeça do fêmur. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 13-14. JINC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 7. | | CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Associação de um SNP no gene da calmodulina com características de integridade da tíbia em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 69-70. JINC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 8. | | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SOUZA, M. R.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO D. E. P.; TREMEA, M.; LEDUR, M. C. Reference genes for proximal femoral epiphysiolysis expression studies in broilers cartilage. Plos One, v. 15, n.8, Ed. e0238189, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|  |
| 9. | | PETRY, B.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; PEIXOTO, J. de O.; JAENISCH, F. R. F.; CUCCO, D. de C.; LEDUR, M. C. New genes involved in the Bacterial Chondronecrosis with Osteomyelitis in commercial broilers. Livestock Science, v. 208, p. 33-39, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 10. | | SAVOLDI, I. R.; PALUDO, E.; CARMO, K. B. do; PETRY, B.; IBELLI, A. M. G.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Fatores que influenciam características de integridade óssea e expressão dos genes COL1A2 e RANKL em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 67-68. JINC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 11. | | TREMEA, M.; HUL, L. M.; SAVOLDI, I. R.; ESTER, D.; AULER, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão diferencial do gene GAL1 entre frangos de corte normais e afetados com condronecrose bacteriana com osteomielite. Avicultura Industrial, Itu, ed. 1301, ano 111, n. 07, p. 42-44, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 12. | | MARCIANO, C. M. M.; SAVOLDI, I. R.; KARMO, K. B. do; CUCCO, D. de C.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão diferencial do gene MYLK2 em frangos de corte normais e afetados com White striping. In: SEMINÁRIO DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO DA UDESC OESTE, 8.; VIGÉSSIMO OITAVO SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 28.; PRIMEIRO ENCONTRO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UDESC OESTE, 2018, Chapecó. Anais... Chapecó: UDESC Oeste, 2019. 8º SEPE. 28º SIC. 1 º EPG.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 13. | | CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; PEIXOTO, J. de O.; MARCIANO, C. M. M.; LEDUR, M. C. Expressão do gene CHST-1 em frangos de corte normais e afetados pela necrose da cabeça do fêmur. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 10., 2016, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2016. p. 32-33.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 14. | | MARCELINO, D. E. P.; SOUZA, M. R.; AULER, M. E.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O. Expressão dos genes MAP1LC3C e EPYC em suínos normais e afetados com hérnia umbilical. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 34-35. JINC 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 15. | | SAVOLDI, I. R.; KOWACIC, R. da C.; IBELLI, A. M. G.; LOPES, L. dos S.; PALUDO, E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Avaliação fenotípica do fêmur e da tíbia de frangos de corte afetados ou não com problemas locomotores. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 9., 2015, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2015. p. 104-105.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 17. | | LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C. Identification of endogenous normalizing genes for expression studies in inguinal ring tissue for scrotal hernias in pigs. Plos One, v. 13, n.9, e0204348, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 18. | | IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Biological processes related to ribosome and mitochondrial functions might be involved in the osteochondrosis latens manifestation in gilts. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 19. | | LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; MORES, M. A. Z.; ROMANO, G. DE S.; CARMO, K. B. DO; LEDUR, M. C. The downregulation of genes encoding muscle proteins have a potential role in the development of scrotal hernia in pigs. Molecular Biology Reports, v. 51, n. 822, 2024. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 20. | | MARCIANO, C. M. M.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; LEDUR, M. C. Differential expression of myogenic and calcium signaling-related genes in broilers affected with white striping. Frontiers in Physiology, v. 12, n. 712464, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| Registros recuperados : 32 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
