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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
01/08/2023 |
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Data da última atualização: |
03/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KOLTUN, A.; SILVA, N. V. e; ANGELOTTI-MENDONÇA, J.; MARIN, S. R. R.; GONÇALVES, L. S. A.; NEPOMUCENO, A. L.; MERTZ-HENNING, L. M. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA KOLTUN, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ; NATHALIA VOLPI E SILVA, EMBRAPA SOJA; JÉSSIKA ANGELOTTI-MENDONÇA, EMBRAPA SOJA; SILVANA REGINA ROCKENBACH MARIN, CNPSO; LEANDRO SIMÕES AZEREDO GONÇALVES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; LILIANE MARCIA MERTZ HENNING, CNPSO. |
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Título: |
CRISPR-transient expression in soybean for simplified gRNA screening in planta. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03000, 2023. |
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DOI: |
https://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03000 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Expressão transiente de CRISPR em soja para triagem simplificada de gRNA na planta. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to develop a method to create and validate CRISPR-Cas systems and different gRNAs in soybean (Glycine max) embryos. Two model genes were used for simple mutation with one gRNA or partial gene deletion with two guides. The gRNAs were inserted into the CRISPR transformation vectors by a type IIS restriction enzyme or by subcloning and inserting the promoter + gRNA2 in the final transformation vector using the classic restriction enzyme cloning method. The vectors were successfully constructed for one and two gRNAs. Agrobacterium-mediated transient transformation in soybean was carried out to test the quality of gRNAs and of the system itself (expression cassette). Simple mutation and gene deletion were detected in the embryos transformed after DNA enrichment by enzyme digestion followed by polymerase chain reaction and sequencing, which indicates that the CRISPR-Cas system and guides were working. This protocol can be used to accelerate CRISPR-based genome editing strategies for genetic transformation in soybean. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi desenvolver um método para criar e validar sistemas CRISPR-Cas e diferentes gRNAs em embriões de soja (Glycine max). Dois genes modelo foram usados para mutação simples com um gRNA ou deleção parcial do gene com dois guias. Os gRNAs foram inseridos nos vetores de transformação CRISPR por uma enzima de restrição do tipo IIS ou por subclonagem e inserção do promotor + gRNA2 no vetor de transformação final, com uso do método clássico de clonagem por enzimas de restrição. Os vetores foram construídos com sucesso para um e dois gRNAs. A transformação transiente de soja por Agrobacterium foi realizada para testar a qualidade dos gRNAs e do próprio sistema (cassete de expressão). Detectaram-se mutação simples e deleção gênica nos embriões transformados após o enriquecimento do DNA por digestão seguida de reação em cadeia da polimerase e sequenciamento, o que indica que o sistema CRISPR-Cas e os guias estavam funcionando. Este protocolo pode ser usado para acelerar as estratégias de edição de genoma baseadas em CRISPR, para transformação genética em soja. MenosABSTRACT - The objective of this work was to develop a method to create and validate CRISPR-Cas systems and different gRNAs in soybean (Glycine max) embryos. Two model genes were used for simple mutation with one gRNA or partial gene deletion with two guides. The gRNAs were inserted into the CRISPR transformation vectors by a type IIS restriction enzyme or by subcloning and inserting the promoter + gRNA2 in the final transformation vector using the classic restriction enzyme cloning method. The vectors were successfully constructed for one and two gRNAs. Agrobacterium-mediated transient transformation in soybean was carried out to test the quality of gRNAs and of the system itself (expression cassette). Simple mutation and gene deletion were detected in the embryos transformed after DNA enrichment by enzyme digestion followed by polymerase chain reaction and sequencing, which indicates that the CRISPR-Cas system and guides were working. This protocol can be used to accelerate CRISPR-based genome editing strategies for genetic transformation in soybean. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi desenvolver um método para criar e validar sistemas CRISPR-Cas e diferentes gRNAs em embriões de soja (Glycine max). Dois genes modelo foram usados para mutação simples com um gRNA ou deleção parcial do gene com dois guias. Os gRNAs foram inseridos nos vetores de transformação CRISPR por uma enzima de restrição do tipo IIS ou por subclonagem e inserção do promotor + gRNA2 no vetor de tran... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genoma; Glycine Max; RNA; Soja; Vetor. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic vectors; Genome; Mutation; Polymerase chain reaction; RNA editing; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155549/1/CRISPR-transient-expression-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Florestas. Para informações adicionais entre em contato com cnpf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
13/12/2013 |
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Data da última atualização: |
18/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
BAYER, C.; GOMES, J.; VIEIRA, F. C. B.; ZANATTA, J. A.; PICCOLO, M. de C.; DIECKOW, J. |
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Afiliação: |
Cimélio Bayer, UFRGS; Juliana Gomes, UFRGS; Frederico Costa Beber Vieira, UNIPAMPA; JOSILEIA ACORDI ZANATTA, CNPF; Marisa de Cássia Piccolo, USP; Jeferson Dieckow, UFPR. |
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Título: |
Soil methane oxidation in a long-term no-tillage system in Southern Brazil. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 34, n. 4, p. 1695-1706, jul./ago. 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Conservation management systems are usually suggested as alternative to restore the soil methane (CH4) oxidation capacity of degraded soils; however, little information is available on tropical and subtropical soils. Our objective was to evaluate the long-term (19 years) effect of no-tillage (NT) versus conventional tillage (CT) management systems on CH4 fluxes in a formerly degraded Acrisol in Southern Brazil. Annual CH4 fluxes of two cropping systems [O/M-black oat (Avena strigosa)/maize and V/M-vetch (Vigna sativa)/maize] were measured in NT and CT soils. Static chambers were used for air sampling, while chromatography was used for CH4 analysis. Analysis of the historical dataset at this experimental site indicated improvements in soil quality under the NT system, especially in legumebased cropping system (V/M) that exhibited the highest annual biomass input. CH4 fluxes ranged from ?42 ± 2 to 38 ± 16 ?g C m-2 h-1, and annual CH4 emissions ranged from ?825 ± 117 (CT V/M) to 453 ± 185 g C ha-1 (NT O/M). Thus, the annual CH4 oxidation capacity of the soil was not related to the soil quality produced by the soil management systems. On the basis of our results and published literature, we postulate that conservation management systems improve the methane oxidation and soil quality in distinct soil layers, which result in a slow effect of these management systems on the methane oxidation capacity. |
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Palavras-Chave: |
Aquecimento global; Preparo; Sistema de cultura. |
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Thesagro: |
Solo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02087naa a2200229 a 4500
001 1973787
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100 1 $aBAYER, C.
245 $aSoil methane oxidation in a long-term no-tillage system in Southern Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2013
520 $aConservation management systems are usually suggested as alternative to restore the soil methane (CH4) oxidation capacity of degraded soils; however, little information is available on tropical and subtropical soils. Our objective was to evaluate the long-term (19 years) effect of no-tillage (NT) versus conventional tillage (CT) management systems on CH4 fluxes in a formerly degraded Acrisol in Southern Brazil. Annual CH4 fluxes of two cropping systems [O/M-black oat (Avena strigosa)/maize and V/M-vetch (Vigna sativa)/maize] were measured in NT and CT soils. Static chambers were used for air sampling, while chromatography was used for CH4 analysis. Analysis of the historical dataset at this experimental site indicated improvements in soil quality under the NT system, especially in legumebased cropping system (V/M) that exhibited the highest annual biomass input. CH4 fluxes ranged from ?42 ± 2 to 38 ± 16 ?g C m-2 h-1, and annual CH4 emissions ranged from ?825 ± 117 (CT V/M) to 453 ± 185 g C ha-1 (NT O/M). Thus, the annual CH4 oxidation capacity of the soil was not related to the soil quality produced by the soil management systems. On the basis of our results and published literature, we postulate that conservation management systems improve the methane oxidation and soil quality in distinct soil layers, which result in a slow effect of these management systems on the methane oxidation capacity.
650 $aSolo
653 $aAquecimento global
653 $aPreparo
653 $aSistema de cultura
700 1 $aGOMES, J.
700 1 $aVIEIRA, F. C. B.
700 1 $aZANATTA, J. A.
700 1 $aPICCOLO, M. de C.
700 1 $aDIECKOW, J.
773 $tSemina: Ciências Agrárias, Londrina$gv. 34, n. 4, p. 1695-1706, jul./ago. 2013.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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