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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
26/07/2023 |
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Data da última atualização: |
02/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MORAIS JUNIOR, O. P.; MÜLLER, B. S. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
ODILON PEIXOTO MORAIS JUNIOR, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; BÁRBARA S. F. MÜLLER, UNIVERSITY OF FLORIDA, Gainesville, FL; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Genomic prediction for drought tolerance using multienvironment data in a common bean (Phaseolus vulgaris) breeding program. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 63, n. 4, p. 2145-2161, July/Aug. 2023. |
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ISSN: |
0011-183X |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/csc2.21000 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This work evaluated the efficiency of different genomic prediction (GP) methods in a diverse Mesoamerican panel of 339 common bean accessions, genotyped with 3398 SNP markers. Field experiments were carried out for three consecutive years, with adequate water supply (non-stress?NS) and water restriction imposition (water-stress?WS), analyzing seed weight (SW) and grain yield (GY). Two methods to predict the accuracies (r?g) were adopted (GBLUP and Bayes) and also considered the environmental variation (GBLUP-based reaction norm model). Similar accuracies were observed for both methods. For GY, the highest r?g were detected under NS (rgg = 0.49) in 2016 (r?g = 0.49) and in the joint analysis for the WS condition (rgg = 0.33), both for models using local landraces. For SW under NS, the rgg was higher for the elite lines (rgg = 0.72), whereas for WS, the rgg dropped considerably, ranging from 0.45 to 0.61 for the joint analysis, considering the landraces and all samples, respectively. For GY and SW, under NS, the rgg using both models increased with increasing number of SNPs, until reaching a plateau of 800 and 300 SNPs, respectively. Increasing the training population (TP) size resulted in greater accuracy. Taking in account the Genotype × Environment, the multienvironment model performed better especially for more complex traits (GY/NS: rgg = 0.32). The GP approach has great potential to help commercial bean breeding programs improving the performance of target quantitative traits. MenosThis work evaluated the efficiency of different genomic prediction (GP) methods in a diverse Mesoamerican panel of 339 common bean accessions, genotyped with 3398 SNP markers. Field experiments were carried out for three consecutive years, with adequate water supply (non-stress?NS) and water restriction imposition (water-stress?WS), analyzing seed weight (SW) and grain yield (GY). Two methods to predict the accuracies (r?g) were adopted (GBLUP and Bayes) and also considered the environmental variation (GBLUP-based reaction norm model). Similar accuracies were observed for both methods. For GY, the highest r?g were detected under NS (rgg = 0.49) in 2016 (r?g = 0.49) and in the joint analysis for the WS condition (rgg = 0.33), both for models using local landraces. For SW under NS, the rgg was higher for the elite lines (rgg = 0.72), whereas for WS, the rgg dropped considerably, ranging from 0.45 to 0.61 for the joint analysis, considering the landraces and all samples, respectively. For GY and SW, under NS, the rgg using both models increased with increasing number of SNPs, until reaching a plateau of 800 and 300 SNPs, respectively. Increasing the training population (TP) size resulted in greater accuracy. Taking in account the Genotype × Environment, the multienvironment model performed better especially for more complex traits (GY/NS: rgg = 0.32). The GP approach has great potential to help commercial bean breeding programs improving the performance of target quantitative t... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Feijão; Melhoramento Genético Vegetal; Phaseolus Vulgaris; Resistência a Seca. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Breeding and Genetic Improvement; Drought tolerance; Genomics. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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650 $aBeans
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
18/10/2013 |
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Data da última atualização: |
16/10/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. A. de; JONSSON, C. M.; CLEMENTE, Z.; CASTRO, V. L. S. S. de. |
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Afiliação: |
ELIANE ALVES DE OLIVEIRA, PUCCAMP; CLAUDIO MARTIN JONSSON, CNPMA; ZAIRA CLEMENTE, IB-UNICAMP; VERA LUCIA SCHERHOLZ S DE CASTRO, CNPMA. |
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Título: |
Toxicidade subcrônica de dois fungicidas e sua mistura na atividade de algumas enzimas de pacu. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 7., 2013, Campinas. Anais... Campinas: ITAL, 2013. 1 CD ROM. n. 13421. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: Estudou-se o efeito sobre a atividade de enzimas hepáticas do metabolismo intermediário, de conjugação e antioxidantes, decorrente da exposição do peixe pacu (Piaractus mesopotamicus) por 14 dias aos fungicidas epoxiconazol, piraclostrobina e à mistura dos mesmos. As atividades da fosfatase ácida (Pac) e superóxido dismutase (SOD) foram aumentadas significativamente (p<0,05) em relação ao controle nas exposições ao epoxiconazol na concentração de 22,8 g.L-1. Esta é equivalente a 1/100 da concentração letal media (CL50-96h) determinada em peixes. Com relação aos efeitos da piraclostrobina e à mistura epoxiconazol+piraclostrobina, não se observou decréscimo ou incremento das atividades das enzimas avaliadas. Atribuíram-se valores de 1,8 e 2,0 micrograma.L-1, respectivamente para piraclostrobina e a mistura epoxiconazol+piraclostrobina, como concentrações de efeito não observado (CENO). O valor deste parâmetro para o epoxiconazol seria equivalente a 2,28 micrograma.L-1, já que observou-se efeito na concentração imediatamente superior a esta. Os dados são relevantes na identificação de possíveis biomarcadores e no direcionamento de políticas publicas quanto ao estabelecimento de níveis máximos de poluentes na água para a proteção da biota aquática. Abstract: We studied the effect on the activity of hepatic enzymes that acts in the intermediary metabolism, conjugation of xenobiotics and as antioxidants, due to the exposure (14 days) of the pacu fish (Piaractus mesopotamicus) to the fungicides epoxiconazole, pyraclostrobin and its mixture. In the epoxiconazole exposure at 22.8 microgramg L-1, the activities of acid phosphatase (Pac) and superoxide dismutase (SOD) were increased significantly (p<0.05) compared to the control. This concentration is equivalent to 1/100 the median lethal concentration (LC50-96h) determined in fishes. There was no significant decrease or increase in the enzyme activities in fishes exposed to pyraclostrobin or pyraclostrobin+epoxiconazole mixture. We assigned values equivalent to 1.8 and 2.0 microgram L-1, respectively for pyraclostrobin and pyraclostrobin+epoxiconazole mixture, which would be regarded as the no observed effect concentration (NOEC). The value of this parameter to the epoxiconazole would be equivalent to 2.28 microgram L-1. Data are relevant in the identification of candidate biomarkers and in guiding public policies regarding the setting of maximum levels of pollutants in the water for protection of the aquatic biota. MenosResumo: Estudou-se o efeito sobre a atividade de enzimas hepáticas do metabolismo intermediário, de conjugação e antioxidantes, decorrente da exposição do peixe pacu (Piaractus mesopotamicus) por 14 dias aos fungicidas epoxiconazol, piraclostrobina e à mistura dos mesmos. As atividades da fosfatase ácida (Pac) e superóxido dismutase (SOD) foram aumentadas significativamente (p<0,05) em relação ao controle nas exposições ao epoxiconazol na concentração de 22,8 g.L-1. Esta é equivalente a 1/100 da concentração letal media (CL50-96h) determinada em peixes. Com relação aos efeitos da piraclostrobina e à mistura epoxiconazol+piraclostrobina, não se observou decréscimo ou incremento das atividades das enzimas avaliadas. Atribuíram-se valores de 1,8 e 2,0 micrograma.L-1, respectivamente para piraclostrobina e a mistura epoxiconazol+piraclostrobina, como concentrações de efeito não observado (CENO). O valor deste parâmetro para o epoxiconazol seria equivalente a 2,28 micrograma.L-1, já que observou-se efeito na concentração imediatamente superior a esta. Os dados são relevantes na identificação de possíveis biomarcadores e no direcionamento de políticas publicas quanto ao estabelecimento de níveis máximos de poluentes na água para a proteção da biota aquática. Abstract: We studied the effect on the activity of hepatic enzymes that acts in the intermediary metabolism, conjugation of xenobiotics and as antioxidants, due to the exposure (14 days) of the pacu fish (Piaractus mesopotamic... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Agrochemical mixture; Enzyme; Fungicide. |
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Thesagro: |
Agrotóxico; Enzima; Fungicida; Pacu; Peixe; Substância tóxica; Toxidez. |
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Thesaurus NAL: |
Ecotoxicology; Fish; Piaractus mesopotamicus; toxicity. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/91157/1/2013AA64.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 7., 2013, Campinas. Anais... Campinas: ITAL, 2013. 1 CD ROM. n. 13421.$c2013
520 $aResumo: Estudou-se o efeito sobre a atividade de enzimas hepáticas do metabolismo intermediário, de conjugação e antioxidantes, decorrente da exposição do peixe pacu (Piaractus mesopotamicus) por 14 dias aos fungicidas epoxiconazol, piraclostrobina e à mistura dos mesmos. As atividades da fosfatase ácida (Pac) e superóxido dismutase (SOD) foram aumentadas significativamente (p<0,05) em relação ao controle nas exposições ao epoxiconazol na concentração de 22,8 g.L-1. Esta é equivalente a 1/100 da concentração letal media (CL50-96h) determinada em peixes. Com relação aos efeitos da piraclostrobina e à mistura epoxiconazol+piraclostrobina, não se observou decréscimo ou incremento das atividades das enzimas avaliadas. Atribuíram-se valores de 1,8 e 2,0 micrograma.L-1, respectivamente para piraclostrobina e a mistura epoxiconazol+piraclostrobina, como concentrações de efeito não observado (CENO). O valor deste parâmetro para o epoxiconazol seria equivalente a 2,28 micrograma.L-1, já que observou-se efeito na concentração imediatamente superior a esta. Os dados são relevantes na identificação de possíveis biomarcadores e no direcionamento de políticas publicas quanto ao estabelecimento de níveis máximos de poluentes na água para a proteção da biota aquática. Abstract: We studied the effect on the activity of hepatic enzymes that acts in the intermediary metabolism, conjugation of xenobiotics and as antioxidants, due to the exposure (14 days) of the pacu fish (Piaractus mesopotamicus) to the fungicides epoxiconazole, pyraclostrobin and its mixture. In the epoxiconazole exposure at 22.8 microgramg L-1, the activities of acid phosphatase (Pac) and superoxide dismutase (SOD) were increased significantly (p<0.05) compared to the control. This concentration is equivalent to 1/100 the median lethal concentration (LC50-96h) determined in fishes. There was no significant decrease or increase in the enzyme activities in fishes exposed to pyraclostrobin or pyraclostrobin+epoxiconazole mixture. We assigned values equivalent to 1.8 and 2.0 microgram L-1, respectively for pyraclostrobin and pyraclostrobin+epoxiconazole mixture, which would be regarded as the no observed effect concentration (NOEC). The value of this parameter to the epoxiconazole would be equivalent to 2.28 microgram L-1. Data are relevant in the identification of candidate biomarkers and in guiding public policies regarding the setting of maximum levels of pollutants in the water for protection of the aquatic biota.
650 $aEcotoxicology
650 $aFish
650 $aPiaractus mesopotamicus
650 $atoxicity
650 $aAgrotóxico
650 $aEnzima
650 $aFungicida
650 $aPacu
650 $aPeixe
650 $aSubstância tóxica
650 $aToxidez
653 $aAgrochemical mixture
653 $aEnzyme
653 $aFungicide
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700 1 $aCLEMENTE, Z.
700 1 $aCASTRO, V. L. S. S. de
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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