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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
23/01/2023 |
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Data da última atualização: |
24/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SANSALONI, C. P. |
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Título: |
Desenvolvimento, caracterização e mapeamento de microssatélites de tetra e pentanucleotídeos em Eucalyptus spp. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
2008. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular) - Universidade de Brasília, DF. Orientador: Dario Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Conteúdo: |
Marcadores microssatélites permitem o gerenciamento de variabilidade genética, proteção varietal e identificação individual em populações de melhoramento e produção de Eucalyptus. A análise de locos microssatélites em sistemas ?multiplex? (i.e. vários locos analisados simultaneamente) vem sendo realizada tradicionalmente com microssatélites dinucleotídeos cujos alelos diferem em apenas dois pares de bases. Entretanto o padrão de qualidade recomendado internacionalmente para a investigação genética forense estabeleceu a utilização exclusiva de microssatélites baseados em repetições de tetra ou pentanucleotídeos. A maior diferença de tamanho entre os alelos e a minimização de artefatos de amplificação permitem uma interpretação significativamente mais robusta de genótipos em comparação a dinucleotídeos e conseqüentemente uma fácil e confiável comparação de perfis genotípicos entre laboratórios. O objetivo deste trabalho foi, portanto, o desenvolvimento, caracterização e mapeamento genético de uma nova categoria de microssatélites para espécies de Eucalyptus, baseados em repetições de tetra e pentanucleotídeos. Um banco de dados de 18.510 mil seqüências genômicas derivadas de clones de cromossomos artificiais de bactérias (BAC) de E. grandis totalizando 9,6 mega pares de bases foram mineradas para repetições de tetra e pentanucleotídeos e pares de iniciadores desenhados automaticamente para flanquear repetições totalizando dez ou mais pb. Dos 304 e 196 pares de iniciadores desenhados para a amplificação de locos tetra e pentanucleotídeos perfeitos, respectivamente, foram selecionados 80 locos de tetra e 30 de pentanucleotídeos para estudos detalhados. Após uma triagem em eletroforese de alta resolução foram selecionados 22 locos tetra e 10 pentanucleotídeos os quais foram geneticamente mapeados e caracterizados para número de alelos, heterozigosidade esperada (He) e observada (Ho), probabilidade de identidade (PI), probabilidade de exclusão de paternidade (PE) e conteúdo de informação polimórfica (PIC) em amostras populacionais de seis procedências das três principais espécies plantadas de Eucalyptus no mundo (E. grandis, E. globulus e E. urophylla). Os locos tetra e pentanucleotídeos selecionados revelaram um conteúdo informativo inferior àquele de dinucleotídeos, embora adequado para discriminar indivíduos e determinar parentesco com elevada precisão. Ao avaliar a capacidade efetiva de discriminação individual em um grupo de 46 clones elite plantados comercialmente 5 locos tetra ou pentanucleotídeos foram suficientes para identificar unicamente todos os clones. A herança mendeliana de todos os 32 locos selecionados foi confirmada. Destes, 23 locos apresentaram uma configuração de segregação que permitiu o seu mapeamento genético em 8 dos 11 grupos de ligação com base em mapas de referência de duas famílias de E. grandis x E. urophylla. Dois sistemas multiplex, cada um com 7 locos selecionados foram testados com sucesso disponibilizando assim os primeiros sistemas de análise genética de alta precisão para espécies de Eucalyptus, passíveis de adoção em escala internacional para a análise genética de clones e populações. MenosMarcadores microssatélites permitem o gerenciamento de variabilidade genética, proteção varietal e identificação individual em populações de melhoramento e produção de Eucalyptus. A análise de locos microssatélites em sistemas ?multiplex? (i.e. vários locos analisados simultaneamente) vem sendo realizada tradicionalmente com microssatélites dinucleotídeos cujos alelos diferem em apenas dois pares de bases. Entretanto o padrão de qualidade recomendado internacionalmente para a investigação genética forense estabeleceu a utilização exclusiva de microssatélites baseados em repetições de tetra ou pentanucleotídeos. A maior diferença de tamanho entre os alelos e a minimização de artefatos de amplificação permitem uma interpretação significativamente mais robusta de genótipos em comparação a dinucleotídeos e conseqüentemente uma fácil e confiável comparação de perfis genotípicos entre laboratórios. O objetivo deste trabalho foi, portanto, o desenvolvimento, caracterização e mapeamento genético de uma nova categoria de microssatélites para espécies de Eucalyptus, baseados em repetições de tetra e pentanucleotídeos. Um banco de dados de 18.510 mil seqüências genômicas derivadas de clones de cromossomos artificiais de bactérias (BAC) de E. grandis totalizando 9,6 mega pares de bases foram mineradas para repetições de tetra e pentanucleotídeos e pares de iniciadores desenhados automaticamente para flanquear repetições totalizando dez ou mais pb. Dos 304 e 196 pares de iniciadores dese... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Eucalyptus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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650 $aEucalyptus
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
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| Registros recuperados : 9 | |
| 1. |  | FEITOSA JÚNIOR, F. R.; REIS, D. A.; PORTELLA, R. B.; SANTOS, J. R. S.; PERINA, F. J.; BOGIANI, J. C. Sistemas de manejo e parâmetros da matéria orgânica de um solo do cerrado baiano, Brasil. Revista Ibero Americana de Ciências Ambientais, v. 10, n. 3, p. 298-312, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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| 2. | | REIS, D. A.; PORTELLA, R. B.; FAGUNDES, M. O.; FEITOSA JÚNIOR, F. R.; SANTOS, J. R. S.; BOGIANI, J. C.; PERINA, F. J. Grau de dispersão, biomassa microbiana e carbono orgânico de um latossolo cultivado com soja sob plantio convencional e direto no cerrado (savana) do oeste da Bahia, Brasil. Revista Ibero Americana de Ciências Ambientais, v. 10, n. 1, p. 363-375, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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| 3. | | SILVA, L. C. A. da; PESSOA, D. A. do N.; LOPES, J. R. G.; SANTOS, J. R. S. dos; OLINA, R. G.; RIET-CORREA, F. Embryonic death and abortion in goats caused by ingestion of Amorimia septentrionalis. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 37, n. 12, p. 1401-1404, dezembro. 2017. Título em português: Mortalidade embrionária e abortos em cabras causados pela ingestão de Amorimia septentrionalis.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | SANTOS, J. R. S. dos; LOPES, J. R. G.; MEDEIROS, M. A.; CAMPOS, E. M.; MEDEIROS, R. M. T.; RIET-CORREA, F. Embryonic mortality and abortion in goats caused by ingestion of Poincianella pyramidalis. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 7, p. 1259-1263, julho 2018 Título em inglês: Mortalidade embrionária e aborto em caprinos causados pela ingestão de Poincianella pyramidalis.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | NOGUEIRA, M. S. R.; FREIRE FILHO, F. R.; PEREIRA, R. C.; SANTOS, J. R. S.; FIGUEIREDO, D. V.; BRIOSO, P. S. T. Resistência ao Cowpea severe mosaic virus sorotipo I em linhagens de feijão-caupi, oriundas do Piauí. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 1.; REUNIÃO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 6., 2006, Teresina. Tecnologias para o agronegócio: anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 121).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 6. | | RODRIGUES, R. T. G. A.; SANTOS, J. R. S.; AZERÊDO, L. M. S.; ROCHA, E. F.; CARVALHO, M. A. M.; PORTAL, M. J. I. D.; SOUSA, O. B.; MENEZES, D. J. A. Influence of scrotal bipartition on spermatogenesis yield and sertoli cell efficiency in sheep. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 36, n. 4, p. 258-262, abr. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | SOUZA, Y. B.; FREITAS, A. C. R. de; SILVA, R. S. da; PASSOS, H. S.; SANTOS, J. R. S.; LUZ, V. B.; CARNEIRO, P. C. F.; MARIA, A. N.; AZEVEDO, H. C. Reconcentração do sêmen congelado de carneiros por centrifugação da palheta após a descongelação: efeito sobre a ocorrência de refluxo da dose inseminante e a fertilidade à inseminação artificial cervical. In: CONGRESSO BRASILEIRO, 11.; CONGRESSO LATINOAMERICANO DE BUIATRIA, 17., 2015, São Paulo. Anais... 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 8. | | FALCÃO, B. M. R.; SANTOS, J. R. S.; SALLES, A. Y. F. de La; CARREIRO, A. N.; DINIZ, J. A. R. A.; DIAS, R. F. F.; MENEZES, D. J. A.; MEDEIROS, G. X. Origem dos nervos do plexo braquial de sagui-de-tufos brancos (Callithrix jacchus Linnaeus, 1758). Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 37, n. 11, p. 1341-1344, novembro. 2017. Título em inglês: Origin of brachial plexus nerves for common marmoset (Callithrix jacchus Linnaeus, 1758).| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 9. | | GUIMARAES, A. F.; QUERIDO, L. C. de A.; ROCHA, T.; RODRIGUES, D. de J.; VIANA, P. L.; BERGALLO, H. de G.; FERNANDES, G. W.; TOMA, T. S. P.; STREIT, H.; OVERBECK, G. E.; SOUZA, A. Q. S. de; LIMA, A. P.; ROSA, C. A. da; GRELLE, C. E. de V.; LOPES, A. M.; CURCINO, A.; PAULA, A. S. de; ANDRIOLO, A.; DIAS, A. dos S.; SANTOS, A. T.; BERNARDES, A. A.; OLIVEIRA, A. B. da S.; BARROS, A. A. M. de; SILVA, A. C. B. L. e; CRUZ, A. C. R. da; HOLANDA, A. S. S. de; BUENO, A. S.; NUNES-FREITAS, A. F.; YVES, A.; ALENCAR, A. da S.; SCABIN, A. B.; MANZATTO, A. G.; LIMA, A. C. S.; PONTES, A. R. M.; CASTRO, A. B.; GOMES, A. M.; BANHOS, A.; ROSADO, B. H.; BATISTA, C. A. dos S.; SIQUEIRA, C. C.; FONTANA, C. S.; ROCHA, C. F. D. da; BROCARDO, C. R.; DORIA, C. R. da C.; CASTILHO, C. V. de; PESSANHA, C.; CORDEIRO, C. A.; CRONEMBERGER, C.; ANDRETTI, C. B.; CORNELIUS, C.; CAMPOS, C.; BORGES-MATOS, C.; BARROS, C. F.; KELLER, C.; CAVALCANTE, C. de O.; DAMBROS, C. de S.; MACHADO, D. N. da S.; TASSINARI, D.; VILLELA, D. M.; CHIARANIV, E.; GEISLER, E. de F.; VELEZ-MARTIN, E.; CARVALHO-JUNIOR, E. A. R.; DRECHSLER-SANTOS, E. R.; LOURENCO, E. C.; FRANKLIN, E.; HIGASHIKAWA, E. M.; PEZZINI, F.; ROQUE, F. de O.; BACCARO, F. B.; BECKER, F. G.; CABECEIRA, F. G.; FLORENCIO, F. do P.; BARBOSA, F. R.; ZUQUIM, G.; FERREIRA, G. B.; VARGAS, G. K. de; MOURAO, G.; ROUSSEAU, G. X.; LIMA, H. C. de; FARIAS, H. L. S.; KAEFER, I. L.; GHIZONI, I. R.; NORONHA, J. da C. de; OLIVEIRA, J. L. de; SANTOS, J. R. S.; JARENKOW, J. A.; MELO-JUNIOR, J. C. F. de; SANTOS, J. V. C. dos; OLIVEIRA, J. de; SOUZA, J. L. P. de; BAUMGRATZ, J. F. A.; MORAIS, J. W. de; SILVA, J. de M.; SILVA, J. de G.; WINGERT, J. M.; MENGER, J.; FERRER, J.; DAYRELL, J. S.; SILVA-GONCALVES, K. C. da; TORRALVO, K.; CRUZ, K. da S.; SYLVESTRE, L. da S.; RIBAS, L. de A.; BATTIROLA, L. D.; RAMOS, L.; CAIRES, L. R.; CARVALHO, L. C. da S.; STEGMANN, L. F.; CARVALHO, L. N.; MENEZES, L. da S.; COSTA, L. M.; PODGAISKI, L. R.; SILVEIRA, L. F.; MALABARBA, L. R.; FRANGIPANI, M. A.; TABARELLI, M.; NASCIMENTO, M. T.; MARQUES, M. C. M.; SPIES, M. R.; SANTOS, M. A. de O. dos; ANAICY, M.; VITAL, M. J. S.; SILVEIRA, M.; VIEIRA, M. V.; ARAUJO, M. A. de M.; SILVEIRA, M. A. P. de A.; BARROS, M. F.; FAITANIN, M. A.; IGUATEMY, M.; CUNHA, M. S. da; MURAKAMI, M. M. da S.; MESSIAS, M. R.; MARTINS, M. B.; CAMANA, M.; CORREA, N. de M.; FONSECA, N. C.; PRIETO-BENAVIDES, O. O.; RODRIGUES, P. J. P.; ANDRADE, P. L. de; PEQUENO, P. A. C. L.; GANANCA, P. H. S.; FERREIRA, P. P. da S.; ANDRADE, P. C. R. de; AZARAK, P. A.; FRAGA, R. de; RABELO, R. M.; SANTOS, R. de L.; BARBOSA, R. I.; DALA-CORTE, R. B.; VICENTE, R. E.; PERDIZ, R. de O.; ARAUJO, R. P. da C.; ANDRADE, R. T. G. de; PORTELA, R. de C. Q.; FADINI, R.; FEITOSA, R. M.; SANTA-BRIGIDA, R.; CERQUEIRA, R.; MULLER, S. C.; SANTORELLI, S.; SANTOS, S. B. dos; CECHIN, S. Z.; AVILLA, S. S.; PANSINI, S.; ARAGON, S.; FIGUEIREDO, T. da S.; SOBROZA, T. V.; GUIMARAES, T. de F. R.; SANTOS, T. F. dos; EMILIO, T.; AMORIM, T. de A.; IZZO, T.; SOGRAL, T.; SANTOS, T. G. dos; VINCENT, T. L.; ROCHA, T. de L.; PILLAR, V. D.; MESQUITA, V. P.; SILVA, V. D.; CYRINO, V. M. E.; BORGES-JUNIOR, V. N. T.; LAYME, V. M. G.; MOTA, W. G.; SANTOS, W. N.; DROSE, W.; SILVA, W. R.; MAGNUSSON, W. E. Disentangling the veil line for Brazilian biodiversity: An overview from two long-term research programs reveals huge gaps in ecological data reporting Science of The Total Environment, v. 950, p.174880, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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