BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
Home Bibliotecas Itens selecionados Créditos Ajuda
 






Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br.
Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  25/04/2022
Data da última atualização:  25/04/2022
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  LEAL, T. P.; FURLAN, V. C.; GOUVEIA, M. H.; DUARTE, J. M. S.; FONSECA, P. A. S.; TOU, R.; SCLIAR, M. de O.; ARAUJO, G. S. de; COSTA, L. F.; ZOLINI, C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. dos S.; LIMA-COSTA, M. F.; GILMAN, R. H.; TARAZONA-SANTOS, E.; RODRIGUES, M. R.
Afiliação:  THIAGO PEIXOTO LEAL, Universidade Federal de Minas Gerais; VINICIUS C. FURLAN, Universidade Federal de Minas Gerais; MATEUS HENRIQUE GOUVEIA, Universidade Federal de Minas Gerais; JULIA MARIA SARAIVA DUARTE, Universidade Federal de Minas Gerais; PABLO A. S. FONSECA, Universidade Federal de Minas Gerais; RAFAEL TOU, Universidade Federal de Minas Gerais; MARILIA DE OLIVEIRA SCLIAR, Universidade de São Paulo; GILDERLANIO SANTANA DE ARAUJO, Universidade Federal do Pará; LUCAS F. COSTA, Universidade Federal de Minas Gerais; CAMILA ZOLINI, Universidade Federal de Minas Gerais; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; MARIA RAQUEL SANTOS CARVALHO, Universidade Federal de Minas Gerais; MARIA FERNANDA LIMA-COSTA, Fundação Oswaldo Cruz; ROBERT H. GILMAN, Universidad Peruana Cayetano Heredia; EDUARDO TARAZONA-SANTOS, Universidade Federal de Minas Gerais; MAÍRA RIBEIRO RODRIGUES, Universidade Federal de Minas Gerais.
Título:  NAToRA, a relatedness-pruning method to minimize the loss of dataset size in genetic and omics analyses.
Ano de publicação:  2022
Fonte/Imprenta:  Computational and Structural Biotechnology Journal, v. 20, p. 1821-1828, 2022.
DOI:  https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.04.009
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genetic and omics analyses frequently require independent observations, which is not guaranteed in real datasets. When relatedness cannot be accounted for, solutions involve removing related individuals (or observations) and, consequently, a reduction of available data. We developed a network-based relatedness-pruning method that minimizes dataset reduction while removing unwanted relationships in a dataset. It uses node degree centrality metric to identify highly connected nodes (or individuals) and implements heuristics that approximate the minimal reduction of a dataset to allow its application to complex datasets. When compared with two other popular population genetics methodologies (PLINK and KING), NAToRA shows the best combination of removing all relatives while keeping the largest possible number of individuals in all datasets tested and also, with similar effects on the allele frequency spectrum and Principal Component Analysis than PLINK and KING. NAToRA is freely available, both as a standalone tool that can be easily incorporated as part of a pipeline, and as a graphical web tool that allows visualization of the relatedness networks. NAToRA also accepts a variety of relationship metrics as input, which facilitates its use. We also release a genealogies simulator software used for different tests performed in this study.
Palavras-Chave:  Complex network theory; Genealogies simulator; Genetic kinship; Genética de populações; Parentesco genético; Simulador de genealogias; Teoria de redes complexas.
Thesagro:  Genética.
Thesaurus Nal:  Population genetics.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL25619 - 1UPCAP - DD
Voltar






Ordenar por: RelevânciaAutorTítuloAnoImprime registros no formato resumido      Imprime registros no formato resumido
Registros recuperados : 1.397
Primeira ... 123456789 ... Última
1.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. Mercado, pesquisa e extensão rural. ClicNews 2009. Disponível em: http://www.clicnews.com.br/agropecuaria/view.htm?id=104863. Acesso em: 16 dez. 2009.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
2.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, M. O nascimento da biologica molecular: revolucao, reducao e diversificacao - um ensaio sobre modelos teoricos para descrever mudanca cientifica. Cadernos de Ciencia e Tecnologia, Brasilia, v.15, n.3, p.43-82, set./dez.1998.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
3.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, S. da C. O agronegócio da agricultura familiar. In: SANTOS, M. G. B. dos. (Org). Artigos técnicos divulgados na mídia: coletânea 2007. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 244). Publicado em 16/02/2007. Disponível em: Fazendeiro, fazendeiro160207.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
4.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, C. R. Análises biológicas e moleculares de linhagens de Trichogramma pretiosum (Hymenoptera: Trichogrammatidae) coletadas no estado do Ceará. 2018 119 p. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza. Orientador: Patrik Luiz Pastori. Coorientadores: Richard Stouthamer, Nivia da Silva Dias-Pini
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
5.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. G. Construção de comunidades vegetais em restauração ativa de savana. 2018. 29 p. Dissertação (Mestrado em Ecologia) - Instituto de Ciências Biológicas - Universidade de Brasília, DF. Orientador: Daniel Luis Mascia Vieira, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
6.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. C. Monitoramento das alterações da cobertura natural em duas situações distintas da Amazônia Brasileira. Campinas: Embrapa-NMA, 1999. 5p. (Embrapa Monitoramento por Satélite. Pesquisa em Andamento, 13)
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
7.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. C. Monitoramento de áreas de cerrado através da utilização de técnicas de sensoriamento remoto e geoprocessamento. In: SIMPÓSIO SOBRE OS CERRADOS DO MEIO-NORTE, 1997, Teresina-PI. Anais: Cerrados - Sua biodiversidade é uma benção da natureza. Teresina: CPAMN, 1997. p. 17-19 folhas avulsas
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
8.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. C. Núcleo de Monitoramento Ambiental e de Recursos Naturais por Satélite. Biológico, São Paulo, v. 59, n. 2, p.101-104, jul./dez. 1997. folhas avulsas
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
9.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, R. P. Estoques de carbono e emissão de N2O no sistema solo-planta em região de Mata atlântica. Seropédica, 2009. 57p . Dissertação. (Mestrado em Ciência do Solo) - Instituto de Agronomia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Orientação de Segundo Urquiaga. Co-orientação de Cláudia Pozzi Jantalia.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
10.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, M. V. Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia realiza novos treinamentos em Sistema de Qualidade. In: SANTOS, M. G. B. dos. (Org). Artigos técnicos divulgados na mídia: coletânea 2007. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 244). Publicado em 26/07/2007. Disponível em: Boletim Pecuário, bpecuario260707; Clicnews, clicnews260707; Pets, pets260707; Hotel Virtual, hvirtual260707; Agrosoft, agrosoft260707; Página Rural; Cultivar, cultivar260707; Zoonews,...
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
11.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, M.; CAMPOS, Z. Effect of habitat and seasonality on the densities of caiman in southern Pantanal, Brazil. Journal of Tropical Ecology, v.12, n.5 p.741-747, 1996.
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
12.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. C. Condicionantes da expansão da fronteira agrícola em Mato Grosso. Revista de Política Agrícola, Brasília, DF, v. 17, n. 1, P. 80-97, 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
13.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. R. Comunicação e autopoiese: o emprendimento rural como um sistema social. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO, 7., 2007, Fortaleza. Agricultura familiar, políticas públicas e inclusão social: anais. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2007.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
14.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. L. S. Estudo por sensoriamento remoto e análise radiométrica para definição de terroir vinícola na região de Pinto Bandeira - RS, Brasil. 2008. 76 p. il., color. Dissertação (Mestrado em Sensoriamento Remoto e Geoprocessamento) - Centro Estadual de Pesquisas em Sensoriamento Remoto e Meteorologia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre. Orientado por Jorge Ricardo Ducatti, UFRGS;...
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
15.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, M. E. Biologia reprodutiva do jacare do Pantanal: ontogenia e sazonalidade na atividade gonadica de populacoes naturais. Revista Brasileira de Reproducao Animal, v.25, n.2, p.117-120, abr./jun. 2001.
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
16.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, D. N. Crescimento, estrutura e produção de dois híbridos de sorgo submetidos a duas frequências de pastejo com ovinos. 2018. 50 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia. Área de concentração: Nutrição Animal e Forragicultura) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza. Orientador: Magno José Duarte Cândido; Coorientador: Roberto Claudio Fernandes Franco Pompeu (CNPC).
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
17.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, T. C. IMMOBILIZATION OF ENZYMES OF AGROINDUSTRIAL INTEREST ON HYDROXYAPATITE NANOPARTICLES: BETA-GLUCOSIDASE, XYLASE AND PHYTASE. 2020. . Thesis (Doctor in Chemical Engineering), Federal University of São Carlos. Supervisor: Cristiane Sanchez Farinas, PhD. 163 p.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
18.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. C. Precisão posicional dos focos de queimadas no Estado de Mato Grosso. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 5 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 105).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
19.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, A. C. Padrões da distribuição espacial de queimadas no Estado de Mato Grosso. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 14., (SBSR), 2009, Natal. Anais... São José dos Campos: INPE, 2009. p. 2285-2292.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
20.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO FILHO, D. Preliminary diagnosis of a diffusion center of rubber tree technology Tomé-Açu (PA). In: SEMINÁRIO NACIONAL DA SERINGUEIRA, 4., 1984, Salvador. Resumo dos trabalhos. [S.l.]: SUDHEVEA/EMBRAPA/EMBRATER/Banco Econômico, [1984]. p. 236.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
Registros recuperados : 1.397
Primeira ... 123456789 ... Última
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada.
  
 

Embrapa
Todos os direitos reservados, conforme Lei n° 9.610
Política de Privacidade
Área Restrita
Embrapa Agricultura Digital
Av. André Tosello, 209 - Barão Geraldo
Caixa Postal 6041- 13083-886 - Campinas, SP
SAC: https://www.embrapa.br/fale-conosco

Valid HTML 4.01 Transitional