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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
01/07/2021 |
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Data da última atualização: |
01/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SOUZA, D. D. de. |
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Afiliação: |
DANIELA DOMINGOS DE SOUZA. |
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Título: |
Caracterização molecular de dois isolados de Rice stripe necrosis virus. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
2021. |
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Páginas: |
51 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia. Orientador: Érico de Campos Dianese; Coorientadora: Raquel Neves de Mello, CNPAF. |
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Conteúdo: |
Rice stripe necrosis virus (RSNV) é um benyvirus transmitido pelo plasmodioforomiceto Polymyxa graminis Ledingham e que causa a doença conhecida como encarquilhamento do arroz. O genoma do RSNV é composto por dois segmentos de RNA de fita simples, poliadenilados e de sentido positivo que são encapsidados individualmente em partículas em formato de bastonete. A reemergência do vírus na África e na América do Sul e sua recente disseminação para além da região Sul do Brasil indicam a necessidade de entender sua variabilidade genética a fim de gerar informações que auxiliem na diagnose e controle da virose. Assim, os objetivos deste trabalho foram caracterizar molecularmente dois isolados de RSNV obtidos de arroz no estado de Goiás e analisar a variabilidade genética deste vírus. Para tanto, amostras de duas plantas sintomáticas, coletadas em experimentos da Embrapa Arroz e Feijão em Goianira e Santo Antônio de Goiás, GO, foram submetidas a extração de RNA total, enriquecimento de dsRNA e sequenciamento de alto desempenho (HTS), resultando em 27 e 66 milhões de leituras de cada amostra. Após montagem com o programa Tadpole, dez contigs foram obtidos, correspondendo a dois genomas virais, cada um composto por dois segmentos de RNA (RNA1 e RNA2). A organização genômica e tamanho do genoma dos isolados estudados foram similares àqueles de outros seis isolados de RSNV previamente caracterizados. As sequências de aminoácidos das proteínas do capsídeo dos dois isolados apresentaram identidade superior a 95% com outras sequências de RSNV e a identidade geral das sequências de nucleotídeos dos RNA1 e RNA2 foi igual ou superior a 95%. Análises executadas com o programa RDP4 não detectaram eventos de recombinação nos isolados estudados. Árvores filogenéticas baseadas nas sequências completas dos RNA1 e RNA2 e da região codificadora do motivo helicase revelaram estreita relação filogenética entre os isolados de RSNV caracterizados neste trabalho e aqueles previamente caracterizados e indicaram um padrão de agrupamento de acordo com a origem geográfica dos isolados. Estes resultados colaboram para ampliar o entendimento da diversidade molecular de isolados de RSNV e, assim, contribuir para o seu controle. MenosRice stripe necrosis virus (RSNV) é um benyvirus transmitido pelo plasmodioforomiceto Polymyxa graminis Ledingham e que causa a doença conhecida como encarquilhamento do arroz. O genoma do RSNV é composto por dois segmentos de RNA de fita simples, poliadenilados e de sentido positivo que são encapsidados individualmente em partículas em formato de bastonete. A reemergência do vírus na África e na América do Sul e sua recente disseminação para além da região Sul do Brasil indicam a necessidade de entender sua variabilidade genética a fim de gerar informações que auxiliem na diagnose e controle da virose. Assim, os objetivos deste trabalho foram caracterizar molecularmente dois isolados de RSNV obtidos de arroz no estado de Goiás e analisar a variabilidade genética deste vírus. Para tanto, amostras de duas plantas sintomáticas, coletadas em experimentos da Embrapa Arroz e Feijão em Goianira e Santo Antônio de Goiás, GO, foram submetidas a extração de RNA total, enriquecimento de dsRNA e sequenciamento de alto desempenho (HTS), resultando em 27 e 66 milhões de leituras de cada amostra. Após montagem com o programa Tadpole, dez contigs foram obtidos, correspondendo a dois genomas virais, cada um composto por dois segmentos de RNA (RNA1 e RNA2). A organização genômica e tamanho do genoma dos isolados estudados foram similares àqueles de outros seis isolados de RSNV previamente caracterizados. As sequências de aminoácidos das proteínas do capsídeo dos dois isolados apresentaram id... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Rice stripe necrosis virus. |
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Thesagro: |
Arroz; Doença de Planta; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Polymyxa Graminis; RNA. |
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Thesaurus Nal: |
Benyvirus; Rice. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 29 | |
| 9. |  | COSTA, R. G.; ALMEIDA, C. C. de; PIMENTA FILHO, E. C.; HOLANDA JUNIOR, E. V.; SANTOS, N. M. dos. Caracterização do sistema de produção caprino e ovino na região semi-árida do estado da Paraíba, Brasil. Archivos de Zootecnia, v. 57, n. 218, p. 195-205, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 10. | | DAL MONTE, H. L. B.; COSTA, R. G.; PIMENTA FILHO, E. C.; HOLANDA JÚNIOR, E. V.; RODRIGES, A. Mensuração dos custos e avaliação de rendas em diferentes sistemas de produção de leite caprino nos cariris paraibanos. In: XIMENES, L. J. F.; MARTINS, G. A.; NASCISO SOBRINHO, J.; CARVALHO, J. M. M. de (Org.). As ações do Banco do Nordeste do Brasil em P&D na arte da pecuária de caprinos e ovinos no Nordeste brasileiro. Fortaleza: Banco do Nordeste do Brasil, 2009. Cap. 3, p. 94-128. (BNB Ciencia e Tecnologia, 3).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 11. | | HOLANDA JUNIOR, E. V.; MEDEIROS, H. R. de; DAL MONTE, H. L. B.; COSTA, R. G.; PIMENTA FILHO, E. C. Custo de produção de leite de cabra na região Nordeste. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 18.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 10.; SIMPÓSIO PARAIBANO DE ZOOTECNIA, 6.; FORÚM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 4.; FORÚM DE ESTUDANTES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 4.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 14.; FORÚM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 31.; MOSTRA DE RAÇAS DE CAPRINOS E OVINOS NATIVOS, 3.; SEMANA DA CAPRINOCULTURA E DA OVINOCULTURA BRASILEIRAS, 6., 2008, João Pessoa. Anais... João Pessoa: ABZ: Embrapa Caprinos: UFPB, 2008. 13 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 12. | | SILVA FILHA, O. L.; ALVES, D. N. M.; SOUZA, J. F.; SERENO, J. R. B.; PIMENTA FILHO, E. C.; SILVA, G. da L. da P.; CASTRO, G. Caracterização socioeconômica dos criadores de suínos locais da Paraíba, Brasil. In: SIMPÓSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 6., 2005, Chiapas, México. Anais. Chiapas, México: CYTED: Universidad Autónoma de Chiapas, 2005. p.299-301.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 13. | | NÓBREGA, S. M. D. da; PIMENTA FILHO, E. C.; CRUZ, G. R. B. da; ALMEIDA, M. J. de O.; COSTA, T. P. da; MOURA, R. S. de. Caracterização morfológica de equinos da raça Cavalo Nordestino criados na grande região de Campo Maior-Piauí: medidas lineares. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 14. | | NÓBREGA, S. M. D. da; PIMENTA FILHO, E. C.; CRUZ, G. R. B. da; ALMEIDA, M. J. de O.; COSTA, T. P. da; MOURA, R. S. de. Caracterização morfológica de equinos da raça Cavalo Nordestino criados na grande região de Campo Maior-Piauí: proporções corporais e índices de conformação. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 15. | | COSTA, M. da S.; ALMEIDA, M. J. de O.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PIMENTA FILHO, E. C.; RIBEIRO, M. N. Caracterização morfométrica de caprinos Marota do núcleo de conservação In situ. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 16. | | SILVA FILHA, O. L.; SOUZA, J. F.; OLIVEIRA, A. S.; PIMENTA FILHO, E. C.; SERENO, J. R. B.; SILVA, L. P. G. da; OLIVEIRA, R. J. F. Caracterização das explorações suinícolas locais do município de cuité-PB, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 17. | | DAL MONTE, H. L. B.; COSTA, R. G.; HOLANDA JUNIOR, E. V.; PIMENTA FILHO, E. C.; CRUZ, G. R. B. da; MENEZES, M. P. C. Mensuração dos custos e avaliação de rendas em sistemas de produção de leite caprino nos Cariris Paraibanos. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 39, n. 11, p. 2535-2544, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 18. | | AZEVÊDO, D. M. M.; MARTINS FILHO, R.; LOBO, R. N. B.; LOBO, R. B.; MOURA, A. de A. A. N.; PIMENTA FILHO, E. C.; MALHADO, C. H. M. Produtividade acumulada (PAC) das matrizes em rebanhos Nelore do norte e nordeste do Brasil. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 34, n. 1, p. 54-59, jan./fev. 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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