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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
06/11/2020 |
Data da última atualização: |
06/11/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RODRIGUES, G. R.; PINTO, O. H. B.; SCHROEDER, L. F.; FERNANDES, G. da R.; COSTA, O. Y. A.; QUIRINO, B. F.; KURAMAE, E. E.; BARRETO, C. C. |
Afiliação: |
Gisele Regina Rodrigues, Universidade Católica de Brasília; Otávio Henrique Bezerra Pinto, Universidade Católica de Brasília; Luís Felipe Schroeder, Universidade Católica de Brasília; Gabriel da Rocha Fernandes, Fundação Oswaldo Cruz; Ohana Yonara Assis Costa, Netherlands Institute of Ecology; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; Eiko Eurya Kuramae, Netherlands Institute of Ecology; Cristine Chaves Barreto, Universidade Católica de Brasília. |
Título: |
Unraveling the xylanolytic potential of Acidobacteria bacterium AB60 from Cerrado soils. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
FEMS Microbiology Letters, v. 367, Issue 18, fnaa149, Sept. 2020. |
Volume: |
367 |
DOI: |
https://doi.org/10.1093/femsle/fnaa149 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The presence of genes for glycosyl hydrolases in many Acidobacteria genomes indicates an important role in the degradation of plant cell wall material. Acidobacteria bacterium AB60 was obtained from Cerrado oligotrophic soil in Brazil, where this phylum is abundant. The 16S rRNA gene analyses showed that AB60 was closely related to the genera Occallatibacter and Telmatobacter. However, AB60 grew on xylan as carbon source, which was not observed in Occallatibacter species; but growth was not detected on medium containing carboxymethyl cellulose, as observed in Telmatobacter. Nevertheless, the genome analysis of AB60 revealed genes for the enzymes involved in cellulose as well as xylan degradation. In addition to enzymes involved in xylan degradation, α-L-rhamnosidase was detected in the cultures of AB60. Functional screening of a small-insert genomic library did not identify any clones capable of carboxymethyl cellulose degradation, but open reading frames coding α-L-arabinofuranosidase and α-L-rhamnosidase were present in clones showing xylan degradation halos. Both enzymes act on the lateral chains of heteropolymers such as pectin and some hemicelluloses. These results indicate that the hydrolysis of α-linked sugars may offer a metabolic niche for slow-growing Acidobacteria, allowing them to co-exist with other plant-degrading microbes that hydrolyze β-linked sugars from cellulose or hemicellulose backbones. |
Palavras-Chave: |
AB60; Acidobacteria bacterium. |
Thesagro: |
Bactéria; Bacteriologia do Solo; Cerrado; Genoma. |
Thesaurus Nal: |
Acidobacteria; Alpha-L-rhamnosidase; Cellulases; Genomics; Xylanases. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 21 | |
2. |  | TEIXEIRA, A. L.; PRADO, P. E. R.; DIAS, K. O. das G.; MALTA, M. R.; GONÇALVES, F. M. A. Avaliação do teor de cafeína em folhas e grãos de acessos de café arábica. Separata de: Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 43, n. 1, p. 129-137, jan-mar, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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3. |  | ROSA, J. R. B. F.; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; DIAS, K. O. das G.; SILVA, L. da C. e; PASTINA, M. M. Aplicação da associação genômica no melhoramento de plantas. In: PEIXOTO, L. de A.; BHERING, L. L.; CRUZ, C. D. (ed.). Seleção genômica aplicada ao melhoramento genético. Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2022. p. 47-71.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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4. |  | DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARAES, C. T.; NODA, R. W.; SOUZA, J. C. de; PASTINA, M. M.; GUIMARAES, L. J. M. Seleção genômica para tolerância ao déficit hídrico em milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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5. |  | DIAS, K. O. das G.; GONÇALVES, F. M. A.; SOUZA SOBRINHO, F. de; BENITES, F. R. G.; TEIXEIRA, D. H. L.; NUNES, J. A. R. Número de repetições para avaliação de progênies de Brachiaria ruziziensis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 1110-1111Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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8. |  | ELIZEU, A. M.; PEIXOTO, M. A.; EVANGELISTA, J. S. P. C.; CHAVES, S. F. da S.; NASCIMENTO, E. F.; BENITES, F. R. G.; TEODORO, P. E.; DIAS, K. O. das G.; BHERING, L. L. Applications of linear mixed models in Cynodon spp. breeding. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 24, n. 3, e48592432, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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9. |  | EVANGELISTA, J. S. P. C.; CHAVES, S. F. da S.; BHERING, E. L.; QUEIROZ, V. A. V.; SILVA, D. D. da; GUIMARAES, L. J. M.; DIAS, K. O. das G.; PASTINA, M. M. Seleção de genótipos de milho tropical com menor incidência de fumonisinas em grãos e alta produtividade via predição genômica. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2023. 17 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular Técnica, 284).Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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10. |  | DIAS, K. O. das G.; GONÇALVES, F. M. A.; SOUZA SOBRINHO, F. de; NUNES, J. A. R.; TEIXEIRA, D. H. L.; MORAES, B. F. X. de; BENITES, F. R. G. Tamanho de parcela e efeito de bordadura no melhoramento de Urochloa ruziziensis. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 48, n. 11, p. 1426-1431, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Unidades Centrais. |
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11. |  | PASTINA, M. M.; SILVA, R. R.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, C. T.; DIAS, K. O. das G.; SILVA, L. da C. e; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; GARCIA, A. A. F. Modelos GBLUP univariados e multivariados para seleção genômica para tolerância ao déficit hídrico em milho. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2016. 12 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular Técnica, 223).Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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12. |  | FERREIRA, R. A. D. C.; PESSOA, T. V. de S.; SILVA, F. F. e; DIAS, K. O. das G.; CARNEIRO, P. C. S.; CRUZ, C. D.; MACHADO, J. C. A diallel model with repeatability information applied in an elephant grass breeding program. Scientia Agricola, v. 81, e20230045, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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13. |  | BARRETO, C. A. V.; DIAS, K. O. das G.; SOUSA, I. C. de; AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T.; PASTINA, M. M.; NASCIMENTO, M. Genomic prediction in multi-environment trials in maize using statistical and machine learning methods. Scientific Reports, v. 14, 1062, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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14. |  | SOUZA, V. F. de; RIBEIRO, P. C. de O.; VIEIRA JÚNIOR, I. C.; OLIVEIRA, I. C. M.; DAMASCENO, C. M. B.; SCHAFFERT, R. E.; PARRELLA, R. A. da C.; DIAS, K. O. das G.; PASTINA, M. M. Exploring genotype x environment interaction in sweet sorghum under tropical environments. Agronomy Journal, v. 113, p. 3005-3018, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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15. |  | KRAUSE, M. D.; DIAS, K. O. das G.; SANTOS, J. P. R. dos; OLIVEIRA, A. A. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F. Boosting predictive ability of tropical maize hybrids via genotype-by-environment interaction under multivariate GBLUP models. Crop Science, v. 60, n. 6, p. 3049-3065, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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16. |  | DIAS, K. O. das G.; PASTINA, M. M.; GUIMARAES, P. E. de O.; SANTOS, J. R. P. dos; KRAUSE, M. D.; FERRÃO, L. F. V.; GARCIA, A. A. F. Application of multi-environment bayesian models to study genotype-by-environment interaction in maize. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 149.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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17. |  | EVANGELISTA, J. S. P. C.; PEIXOTO, M. A.; COELHO, I. F.; FERREIRA, F. M.; MARÇAL, T. de S.; ALVES, R. S.; CHAVES, S. F. da S.; RODRIGUES, E. V.; LAVIOLA, B. G.; RESENDE, M. D. V. de; DIAS, K. O. das G.; BHERING, L. L. Modeling covariance structures and optimizing jatropha curcas breeding. Tree Genetics & Genomes, v. 19, 21, 2023. 11 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Café. |
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18. |  | PADUA, J. M. V.; DIAS, K. O. das G.; PASTINA, M. M.; SOUZA, J. C. de; QUEIROZ, V. A. V.; COSTA, R. V. da; SILVA, M. B. P. da; RIBEIRO, C. A. G.; GUIMARAES, C. T.; GEZAN, S. A.; GUIMARAES, L. J. M. A multi-environment trials diallel analysis provides insights on the inheritance of fumonisin contamination resistance in tropical maize. Euphytica, Dordrecht, v. 211, n. 3, p. 277-285, 2016Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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19. |  | DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, P. E. de O.; CARNEIRO, N. P.; PORTUGAL, A. F.; BASTOS, E. A.; CARDOSO, M. J.; ANONI, C. de O.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. Estimating genotype X environment interaction for and genetic correlations among drought tolerance traits in maize via factor analytic multiplicative mixed models. Crop Science, Madison, v. 58, p. 72-83, Jan. 2018. Publicado online em 30 out. 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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20. |  | SILVA, K. J.; GUIMARÃES, C. T.; GUILHEN, J. H. S.; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; TRINDADE, R. dos S.; OLIVEIRA, A. A. de; BERNARDINO, K. da C.; PINTO, M. de O.; DIAS, K. O. das G.; BERNARDES, C. de O.; DIAS, L. A. dos S.; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. High-density SNP-based genetic diversity and heterotic patterns of tropical maize breeding lines. Crop Science, v. 60, p. 779-787, 2020Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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