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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
03/11/2020 |
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Data da última atualização: |
03/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; LORENZETTI, W. R.; WEBER, T.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; MORÉS, N.; PEDROSA, V. B.; COUTINHO. L. L.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
GABRIELI DE SOUZA ROMANO, UFBA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; WILLIAN RAPHAEL LORENZETTI, UNICENTRO; TOMÁS WEBER, BRF; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; NELSON MORÉS, CNPSA; VICTOR BRENO PEDROSA, UEPG; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Inguinal ring RNA sequencing reveals downregulation of muscular genes related to scrotal hernia in pigs. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Genes, v. 11, n. 117, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/genes11020117 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Scrotal hernias (SH) are common congenital defects in commercial pigs, characterized by the presence of abdominal contents in the scrotal sac, leading to considerable production and animal welfare losses. Since the etiology of SH remains obscure, we aimed to identify the biological and genetic mechanisms involved in its occurrence through the whole transcriptome analysis of SH affected and unaffected pigs? inguinal rings. From the 22,452 genes annotated in the pig reference genome, 13,498 were expressed in the inguinal canal tissue. Of those, 703 genes were differentially expressed (DE, FDR < 0.05) between the two groups analyzed being, respectively, 209 genes upregulated and 494 downregulated in the SH-affected group. Thirty-seven significantly overrepresented GO terms related to SH were enriched, and the most relevant biological processes were muscular system, cell differentiation, sarcome reorganization, and myofibril assembly. The calcium signaling, hypertrophic cardiomyopathy, dilated cardiomyopathy, and cardiac muscle contraction were the major pathways possibly involved in the occurrence of the scrotal hernias. The expression profile of the DE genes was associated with the reduction of smooth muscle dierentiation, followed by low calcium content in the cell, which could lead to a decreased apoptosis ratio and diminished muscle contraction of the inguinal canal region. We have demonstrated that genes involved with musculature are closely linked to the physiological imbalance predisposing to scrotal hernia. According to our study, the genes MYBPC1, BOK, SLC25A4, SLC8A3, DES, TPM2, MAP1CL3C, and FGF1 were considered strong candidates for future evaluation. MenosAbstract: Scrotal hernias (SH) are common congenital defects in commercial pigs, characterized by the presence of abdominal contents in the scrotal sac, leading to considerable production and animal welfare losses. Since the etiology of SH remains obscure, we aimed to identify the biological and genetic mechanisms involved in its occurrence through the whole transcriptome analysis of SH affected and unaffected pigs? inguinal rings. From the 22,452 genes annotated in the pig reference genome, 13,498 were expressed in the inguinal canal tissue. Of those, 703 genes were differentially expressed (DE, FDR < 0.05) between the two groups analyzed being, respectively, 209 genes upregulated and 494 downregulated in the SH-affected group. Thirty-seven significantly overrepresented GO terms related to SH were enriched, and the most relevant biological processes were muscular system, cell differentiation, sarcome reorganization, and myofibril assembly. The calcium signaling, hypertrophic cardiomyopathy, dilated cardiomyopathy, and cardiac muscle contraction were the major pathways possibly involved in the occurrence of the scrotal hernias. The expression profile of the DE genes was associated with the reduction of smooth muscle dierentiation, followed by low calcium content in the cell, which could lead to a decreased apoptosis ratio and diminished muscle contraction of the inguinal canal region. We have demonstrated that genes involved with musculature are closely linked to the physiol... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Congenital disease; Differentially expressed genes; Doença congênita; Genes expressos diferencialmente; Hérnia escrotal; Sequenciamento do RNA; Transcriptoma. |
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Thesagro: |
Genética Animal; Porco; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetics; Swine; Swine diseases; Transcriptome. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 24 | |
| 3. |  | CARVALHO FILHO, J.; CARVALHO, C. H. S. de; FERREIRA, I. B.; REIS, A. M.; DOMINGUETI, T. C.; BARTELEGA, L. Avaliação de resistência de novas cultivares de café arábica à ferrugem (Hemileia vastatrix) provenientes do Programa de Melhoramento Genético da Fundação Procafé. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 41., 2015, Poços de Caldas. Com mais tecnologia, o melhor café se aprecia: trabalhos apresentados. Varginha: Fundação Procafé, 2015 417 p. p. 45-47| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 5. | | OLIVEIRA, A. E. S. de; SANTOS, C. A. F.; LUZ, L. N. da; OLIVEIRA, V. R.; CANDEIA, J. A.; CARVALHO FILHO, J. L. S. de. Genetic gain of Valenciana onion populations developed in the Brazilian Semi-Arid region. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 17, n. 2, p. 168-174, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 6. | | SANTOS, M. F.; MENDONÇA, M. da C.; CARVALHO FILHO, J. L. S.; DANTAS, I. B.; SILVA MANN, R.; BLANK, A. F. Esterco bovino e biofertilizante no cultivo de erva-cidreira-verdadeira. Revista Brasileira de Plantas Medicinais, Botucatu, v. 11, n. 4, p. 355-359, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 7. | | ALBUQUERQUE, K. A. D.; SILVA, P. de A.; OLIVEIRA, J. A. de; CARVALHO FILHO, J. L. S. de; BOTELHO, F. J. E. Desenvolvimento de mudas de alface a partir de sementes armazenadas e enriquecidas com micronutrientes e reguladores de crescimento. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 25, n. 5, p. 56-65, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 8. | | COSTA CARVALHO, R. R.; LARANJEIRA, D.; WARWICK, D. R. N.; CARVALHO FILHO, J. L. S.; ALVES, P. B.; JESUS, H. C. R. Atividade antifúngica de timol e carvacrol no controle in vitro de Thielaviopsis paradoxa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento., 2012 1 CD-ROM. Edição dos resumos do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 45., Manaus, AM, ago. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 9. | | PADUA, T. R. P. de; GOMES, L. A. A.; MALUF, W. R.; CARVALHO FILHO, J. L. S. de; GONÇALVES NETO, A. C.; ANDRADE, M. C. Capacidade combinatória de híbridos de tomateiro de crescimento determinado, resistentes a Begomovirus e Tospovirus. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 8, p. 818-825, ago. 2010 Título em inglês: Combining ability of determinate?growth?habit tomato hybrids resistant to Begomovirus and Tospovirus.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 10. | | SILVA, R. R.; GOMES, L. A. A.; MONTEIRO, A. B.; MALUF, W. R.; CARVALHO FILHO, J. L. S. de; MASSAROTO, J. A. Linhagens de alface-crespa para o verão resistentes ao Meloidogyne javanica e ao vírus mosaico-da-alface. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 10, p. 1349-1356, out. 2008. Título em inglês: Lineages of crisp-leaf lettuce for summer cropping resistant to Meloidogyne javanica and to Lettuce mosaic virus.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | COSTA E CARVALHO, R. R. da; SOUZA, P. E. de; WARWICK, D. R. N.; POZZA, E. A.; CARVALHO FILHO, J. L. S. de. Spatial and temporal analysis of stem bleeding disease in coconut palm in the state of sergipe, Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 85, n. 4, p. 1567-1576, April, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | OLIVEIRA, T. R. A. de; CARVALHO, H. W. L. de; OLIVEIRA, G. H. F.; COSTA, E. F. N.; GRAVINA, G. de A.; SANTOS, R. D. dos; CARVALHO FILHO, J. L. S. de. Hybrid maize selection through GGE biplot analysis. Bragantia, v. 78, n. 2, p. 166-174, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 14. | | OLIVEIRA, T. R. A.; CARVALHO, H. W. L. de; NASCIMENTO, M.; COSTA, E. F. N.; OLIVEIRA, G. H. F.; GRAVINA, G. A.; AMARAL JUNIOR, A. T.; CARVALHO FILHO, J. L. Adaptability and stability evaluation of maize hybrids using Bayesian segmented regression models. Plos One, v. 30, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 15. | | OLIVEIRA, A. E. S. de; SANTOS, C. A. F.; LUZ, L. N. da; OLIVEIRA, V. R.; CANDEIA, J. A.; CARVALHO FILHO, J. L. S. de; SILVA, D. O. M. da. Adaptability and stability of Valenciana onion populations in the Brazilian Tropical Semi-Arid. Australian Journal of Crop Science, v. 10, n. 8, p. 1182-1187, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | SOUZA, J. R. de; FERREIRA, E.; CHAGAS, E. F. das; MACIEL, A. A. S.; SARDINHA, D. H. da S.; MACHADO, K. K. G.; CARVALHO FILHO, J. A.; MARTINS, J. da S. Avaliação de resistência de cultivares de arroz no estado do Maranhão a Tibraca limbativentris Stal, 1860 (Heteroptera: pentatomidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 21., 2006, Recife. Entomologia: da academia à transferência de tecnologia: resumos. Recife: SEB: UFRPE, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 17. | | OLIVEIRA, T. R. A. de; CARVALHO, H. W. L. de; NASCIMENTO, M.; COSTA, E. F. N.; AMARAL JUNIOR, A. T. do; GRAVINA, G. de A.; CARVALHO FILHO, J. L. S. de. The Eberhart and Russel's Bayesian method used as an instrument to select maize hybrids. Euphytica, 214, 64, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 18. | | SOUZA, J. R. de; FERREIRA, E.; CARGNELUTTI FILHO, A.; CHAGAS, E. F. das; MASSARO, R. A. M.; MACIEL, A. A. S.; SARDINHA, D. H. S.; TORRES, E. R. S.; MACHADO, K. K. G.; CARVALHO FILHO, J. A. Dissimilaridade genética de fontes de resistência de Oryza sativa a Tibraca limbativentris Stal, 1860 (Heteroptera: Pentatomidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 19. | | SOUZA, J. R. de; FERREIRA, E.; CHAGAS, E. F. das; MONDEGO, J. M.; MACIEL, A. A. S.; SARDINHA, D. H. S.; GONÇALVES, K. K. M.; CARVALHO FILHO, J. A. Resistência do tipo antibiose a ninfas de Tibraca limbativentris (Stal, 1860) (Heteroptera: Pentatomidae) em variedades de arroz. Arquivos do Instituto Biológico, v. 75, n. 3, p. 321-325, jul./set. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 20. | | SOUZA, J. R. de; FERREIRA, E.; CHAGAS, E. F. das; BARRIGOSSI, J. A. F.; MACIEL, A. A. S.; SILVA, D. H. S. da; MACHADO, K. K. G.; CARVALHO FILHO, J. A.; MARTINS, J. da S. Resistência do tipo não-preferência em cultivares de arroz no estado do Maranhão à Tibraca limbativentris Stal, 1860 (Heteroptera : pentatomidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 21., 2006, Recife. Entomologia: da academia à transferência de tecnologia: resumos. Recife: Sociedade Entomológica do Brasil, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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