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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
09/12/2019 |
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Data da última atualização: |
09/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. |
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Afiliação: |
SULIMARY O. GOMES; ISIS G. B. SOUZA; MICHELLI F. SANTOS; GEICE R. SILVA; MARC ALBRECHT; ALAN S. MCKINLEY; PAUL BENTZEN; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
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Título: |
Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019. |
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DOI: |
doi:10.1093/jcbiol/ruy115 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean |
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Palavras-Chave: |
Blue land crab; Caranguejo azul; Cardisoma guanhumi; Conservation; Diversidade genética; Molecular markers; NGS technology. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Caranguejo; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Crabs; Florida; Genetic markers; Molecular genetics; Population dynamics; Population genetics; Population structure; Puerto Rico. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02398naa a2200433 a 4500
001 2116375
005 2019-12-09
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adoi:10.1093/jcbiol/ruy115$2DOI
100 1 $aGOMES, S. O.
245 $aDiscovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda$bBrachyura: Gecarcinidae).$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aAbstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean
650 $aCrabs
650 $aFlorida
650 $aGenetic markers
650 $aMolecular genetics
650 $aPopulation dynamics
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653 $aNGS technology
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700 1 $aMCKINLEY, A. S.
700 1 $aBENTZEN, P.
700 1 $aDINIZ, F. M.
773 $tJournal of Crustacean Biology$gv. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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URL |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 3. |  | RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 4. | | SANTOS, M. F.; SOUZA, I. G. B.; GOMES, S. O.; SILVA, G. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of microsatellite markers in the spiny lobster, Panulirus echinatus Smith, 1869 (Decapoda: Palinuridae) by Illumina MiSeq sequencing. Journal of Genetics, v. 97, Online resources, p. e25-e30, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 5. | | SANTOS, M. F. dos; SOUZA, I. G. B. de; ARAÚJO, E. C. E.; SOUZA, V. A. B. de; SITTOLIN, I. M.; LIMA, P. S. da C. Análise de similaridade de genótipos de babaçu (Orbignya phalerata Mart) com base no marcador RAPD. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 4 p. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | SOUZA, I. G. B.; VALENTE, S. E. S.; BRITTO, F. B.; SOUZA, V. A. B. de; LIMA, P. S. da C. RAPD analysis of the genetic diversity of mango (Mangifera indica) germplasm in Brazil. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 10, n. 4, p. 3080-3089, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 9. | | SANTOS, M. F. dos; SOUZA, I. G. B. de; LIMA, P. S. da C.; NASCIMENTO, M. P. S. B. C. do. Seleção de primers RAPD para análise de diversidade genética em canafístula (Senna spectabilis). In: SIMPOSIO INTERNACIONAL SOBRE MELHORAMENTO DE FORRAGEIRAS, 2., 2009, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. ref. B05. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 10. | | SOUZA, I. G. B. de; KRAEMER, J. E. G.; DINIZ, F. M.; SOUZA, V. A. B. de; BRITTO, F. B.; LIMA, P. S. da C. Seleção de primers para o uso de RAPD na análise de diversidade genética em manga (Mangifera indica L.). In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 7.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 4.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 5.; SEMINÁRIO DE EXTENSÃO, 1., 2007, Teresina. Produção científica na realidade comtemporânea: anais. Teresina: UESPI-PROP, 2007. 6 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 11. | | GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 13. | | SOUZA, I. G. B.; PATERSON, I.; McBRIDE, M. C.; SOUZA, B. A.; PEREIRA, F. M.; LOPES, M. T. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of 23 microsatellite loci in the stingless bee Melipona subnitida using next-generation sequencing. Conservation Genetics Resources, v. 7, n. 1, p. 239-241, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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