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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
28/11/2019 |
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Data da última atualização: |
28/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MARCIANO, C. M. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, C. B. do; FERNANDES, L. T.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
CAROLINE M. MARINHO MARCIANO, UDESC/Chapecó; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; IGOR R. SAVOLDI, UDESC/Chapecó; UNC/Concórdia; CEDISA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Stable reference genes for expression studies in breast muscle of normal and white striping-affected chickens. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, 2019. |
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DOI: |
10.1007/s11033-019-05103-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The normalization with proper reference genes is a crucial step to obtain accurate mRNA expression levels in quantitative PCR (qPCR) studies. Therefore, in this study, 10 reference candidate genes were evaluated to determine their stability in normal pectoralis major muscle of broilers and those counterparts afected with White Striping (WS) myopathy at 42 days age. Four diferent tools were used for ranking the most stable genes: GeNorm, NormFinder, BestKeeper and Comparative Ct (ΔCt), and a general ranking was performed using the RankAggreg tool to select the best reference genes among all tools. From the 10 genes evaluated in the breast muscle of broilers, 8 were amplifed. Most of the algorithms/tools indicated the same two genes, RPL30 and RPL5, as the most stable in the broilers breast muscle. In addition, there was agreement among the tools for the least stable genes: MRPS27, GAPDH and RPLP1 in the broilers breast muscle. Therefore, it is interesting to note that even with diferent tools for evaluating gene expression, there was consensus on the most and least stable genes. These results indicate that the Ribosomal protein L30 (RPL30) and Ribosomal protein L5 (RPL5) can be recommended for accurate normalization in qPCR studies with chicken pectoralis major muscle afected with White Striping and other myopathies |
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Thesagro: |
Frango de Corte; Melhoramento Genético Animal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02063naa a2200229 a 4500
001 2115458
005 2019-11-28
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024 7 $a10.1007/s11033-019-05103-z$2DOI
100 1 $aMARCIANO, C. M. M.
245 $aStable reference genes for expression studies in breast muscle of normal and white striping-affected chickens.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aAbstract: The normalization with proper reference genes is a crucial step to obtain accurate mRNA expression levels in quantitative PCR (qPCR) studies. Therefore, in this study, 10 reference candidate genes were evaluated to determine their stability in normal pectoralis major muscle of broilers and those counterparts afected with White Striping (WS) myopathy at 42 days age. Four diferent tools were used for ranking the most stable genes: GeNorm, NormFinder, BestKeeper and Comparative Ct (ΔCt), and a general ranking was performed using the RankAggreg tool to select the best reference genes among all tools. From the 10 genes evaluated in the breast muscle of broilers, 8 were amplifed. Most of the algorithms/tools indicated the same two genes, RPL30 and RPL5, as the most stable in the broilers breast muscle. In addition, there was agreement among the tools for the least stable genes: MRPS27, GAPDH and RPLP1 in the broilers breast muscle. Therefore, it is interesting to note that even with diferent tools for evaluating gene expression, there was consensus on the most and least stable genes. These results indicate that the Ribosomal protein L30 (RPL30) and Ribosomal protein L5 (RPL5) can be recommended for accurate normalization in qPCR studies with chicken pectoralis major muscle afected with White Striping and other myopathies
650 $aFrango de Corte
650 $aMelhoramento Genético Animal
700 1 $aIBELLI, A. M. G.
700 1 $aPEIXOTO, J. de O.
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700 1 $aLEDUR, M. C.
773 $tMolecular Biology Reports, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 2. |  | SILVA, J. P. da; ROMANI, L. A. S.; VASCONCELLOS, E. B. de C.; MARIN, F. R. Processo de automação de planilhas para cálculo de balanço hídrico em escalas mensal, decendial e diária. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa, ITAL, 2012. Não paginado. CIIC 2012. No 12618.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 3. | | LIMA, V. T. A. de; CAMPECHE, D. F. B.; PAULINO, R. V.; SANTOS JÚNIOR, D. D. dos; VASCONCELLOS, E. B. de C. Efeito da temperatura e do oxigênio dissolvido em água salobra no cultivo de tilápia. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 6., 2011, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2011. p. 415-421, (Embrapa Semiárido. Documentos, 238).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 4. | | VASCONCELLOS, E. B. de C.; ROMANI, L. A.; SILVA, J. P.; PÂNTANO, A. P.; CAMARGO, M. B. P.; MEIRELES, E. J. L. Validação de um modelo agrometeorológico de estimativa de produtividade do café no município de São Sebastião do Paraíso (MG). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE METEOROLOGIA, 17.; ENCONTRO DE METEOROLOGIA DOS PAÍSES DO MERCOSUL E ASSOCIADOS, 1.; ENCONTRO SUL AMERICANO DE APLICAÇÕES DO SISTEMA EUMETCast PARA O MONITORAMENTO METEOROLÓGICO E AMBIENTAL, 4.; ENCONTRO DE METEOROLOGIA OPERACIONAL, 2., 2012, Gramado. Anais: programa. Gramado: UFRGS, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 5. | | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; HAREN, J. van; HOVLAND, L.; WOODCOCK, T.; SILVA, R. de N. P. da; VASCONCELLOS, E. B. de C.; FERREIRA, M. L.; PEREIRA, A. L.; METCALFE, D. B.; CATTANIO, J. H.; COSTA, A. C. L. da; FERREIRA, L. V.; SALESKA, S.; CAMARGO, P. B. de. Soil CO2, CH4 and N2O fluxes from Eastern Amazonia indicate surprising controls on n-cycling in a drought experiment and terra preta soils. In: LISBOA, P. L. B. (Org.). Caxiuanã: paraíso ainda preservado. Belém, PA: MPEG, 2013. p. 147-158.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| Registros recuperados : 5 | |
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