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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
05/11/2019 |
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Data da última atualização: |
05/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
BARBOSA, H. R. |
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Título: |
Análise do Transcritoma dos principais estágios de desenvolvimento da broca-do-café (Hypothenemus hampei) e avaliação de potenciais genes alvos aplicados ao seu controle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
2019. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, RS. Orientador: Maria Fátima Grossi de Sá, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Conteúdo: |
A produção de café (Coffea spp.) possui uma importância crucial na economia mundial estimada em cerca de US$ 173 bilhões por ano. Neste cenário, o Brasil segue como o maior produtor de café, com colheita de 60 milhões de sacas/ano. Um dos principais desafios para os produtores é o manejo da broca-do-café (CBB), Hypothenemus hampei, que é o principal inseto praga das plantações em todo o mundo. Várias estratégias de controle, incluindo o uso de agentes de controle biológico, inseticidas microbianos e uma variedade de práticas de saneamento pós-colheita, têm sido usadas para diminuir os danos causados por esse inseto em todos os países produtores que são afetados. Devido ao comportamento endofítico da broca do café, os atuais métodos de manejo aplicados são considerados ineficientes. Alternativas biotecnológicas, como RNA interferente (RNAi), têm sido propostas nos últimos anos para controlar os danos causados por pragas nas plantações. No entanto, uma compreensão completa da genética dessas pragas é indispensável para o sucesso da aplicação de tecnologias emergentes. Neste trabalho, foi utilizada a tecnologia RNA-seq para obter a sequência do transcritoma de três estágios de desenvolvimento da broca do café (larvas, fêmeas e machos), o que contribuiu para aumentar a compreensão das características moleculares do ciclo de vida do inseto. O sequenciamento foi executado usando uma plataforma Illumina, e um conjunto de dados foi gerado através da metodologia De novo. Análises de expressão diferencial foram realizadas para comparar os perfis de expressão nos estágios de desenvolvimento. A montagem final produziu mais de 50.000 transcritos agrupados em aproximadamente 29.000 unigenes, dos quais 4.664 transcritos foram diferencialmente expressos. Dentre os potenciais alvos biotecnológicos, foram identificados genes relacionados com processos fisiológicos fundamentais do inseto, como determinação sexual, funções quimiossensoriais, detoxificação, metabolismo de celulose, transporte de moléculas, proteínas cuticulares e enzimas envolvidas no metabolismo de quitina, entre outros. Além disso, alguns desses genes relacionados a funções cruciais demonstraram forte regulação entre as fases reprodutiva e não reprodutiva da broca-do-café. Da mesma forma, elementos transponíveis parecem ser induzidos nos machos. Juntos, esses dados sugerem o papel importante de vários genes como elementos reguladores no desenvolvimento desse inseto, podendo ser alvo de estratégias biotecnológicas de controle da broca do café. MenosA produção de café (Coffea spp.) possui uma importância crucial na economia mundial estimada em cerca de US$ 173 bilhões por ano. Neste cenário, o Brasil segue como o maior produtor de café, com colheita de 60 milhões de sacas/ano. Um dos principais desafios para os produtores é o manejo da broca-do-café (CBB), Hypothenemus hampei, que é o principal inseto praga das plantações em todo o mundo. Várias estratégias de controle, incluindo o uso de agentes de controle biológico, inseticidas microbianos e uma variedade de práticas de saneamento pós-colheita, têm sido usadas para diminuir os danos causados por esse inseto em todos os países produtores que são afetados. Devido ao comportamento endofítico da broca do café, os atuais métodos de manejo aplicados são considerados ineficientes. Alternativas biotecnológicas, como RNA interferente (RNAi), têm sido propostas nos últimos anos para controlar os danos causados por pragas nas plantações. No entanto, uma compreensão completa da genética dessas pragas é indispensável para o sucesso da aplicação de tecnologias emergentes. Neste trabalho, foi utilizada a tecnologia RNA-seq para obter a sequência do transcritoma de três estágios de desenvolvimento da broca do café (larvas, fêmeas e machos), o que contribuiu para aumentar a compreensão das características moleculares do ciclo de vida do inseto. O sequenciamento foi executado usando uma plataforma Illumina, e um conjunto de dados foi gerado através da metodologia De novo. Análises de ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Broca do café; Coffea spp; RNA-seq. |
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Thesagro: |
Café; Hypothenemus Hampei. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aA produção de café (Coffea spp.) possui uma importância crucial na economia mundial estimada em cerca de US$ 173 bilhões por ano. Neste cenário, o Brasil segue como o maior produtor de café, com colheita de 60 milhões de sacas/ano. Um dos principais desafios para os produtores é o manejo da broca-do-café (CBB), Hypothenemus hampei, que é o principal inseto praga das plantações em todo o mundo. Várias estratégias de controle, incluindo o uso de agentes de controle biológico, inseticidas microbianos e uma variedade de práticas de saneamento pós-colheita, têm sido usadas para diminuir os danos causados por esse inseto em todos os países produtores que são afetados. Devido ao comportamento endofítico da broca do café, os atuais métodos de manejo aplicados são considerados ineficientes. Alternativas biotecnológicas, como RNA interferente (RNAi), têm sido propostas nos últimos anos para controlar os danos causados por pragas nas plantações. No entanto, uma compreensão completa da genética dessas pragas é indispensável para o sucesso da aplicação de tecnologias emergentes. Neste trabalho, foi utilizada a tecnologia RNA-seq para obter a sequência do transcritoma de três estágios de desenvolvimento da broca do café (larvas, fêmeas e machos), o que contribuiu para aumentar a compreensão das características moleculares do ciclo de vida do inseto. O sequenciamento foi executado usando uma plataforma Illumina, e um conjunto de dados foi gerado através da metodologia De novo. Análises de expressão diferencial foram realizadas para comparar os perfis de expressão nos estágios de desenvolvimento. A montagem final produziu mais de 50.000 transcritos agrupados em aproximadamente 29.000 unigenes, dos quais 4.664 transcritos foram diferencialmente expressos. Dentre os potenciais alvos biotecnológicos, foram identificados genes relacionados com processos fisiológicos fundamentais do inseto, como determinação sexual, funções quimiossensoriais, detoxificação, metabolismo de celulose, transporte de moléculas, proteínas cuticulares e enzimas envolvidas no metabolismo de quitina, entre outros. Além disso, alguns desses genes relacionados a funções cruciais demonstraram forte regulação entre as fases reprodutiva e não reprodutiva da broca-do-café. Da mesma forma, elementos transponíveis parecem ser induzidos nos machos. Juntos, esses dados sugerem o papel importante de vários genes como elementos reguladores no desenvolvimento desse inseto, podendo ser alvo de estratégias biotecnológicas de controle da broca do café.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 3 | |
| 2. |  | SILVA, W. R.; BARBOSA, H. R.; SILVA, A. P. da; CARVALHO, C. W. P.; ASCHERI, D. P. R. Extração e caracterização do amido e elaboração de filmes biodegradáveis de amido de sementes de jaca. In: CONGRESO ARGENTINO DE INGENIERÍA RURAL, 10.; MERCOSUR, 2., 2009, Rosario. El compromisso de la ingeniería rural con el desarrollo territorial. Actas... Rosario: Universidad Nacional de Rosario, 2009. p. 2241-2248.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| 3. | | NORIEGA, D. D.; ARIAS, P. L.; BARBOSA, H. R.; ARRAES, F. B. M.; OSSA, G. A.; VILLEGAS, B.; COELHO, R. R.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; WANG, H.; VÉLEZ, A. M.; ARBOLEDA, J. W.; GROSSI-DE-SA, M. F.; SILVA, M. C. M.; VALENCIA-JIMÉNEZ, A. Transcriptome and gene expression analysis of three developmental stages of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. Scientific Reports, v.9, n. 1, article 12804, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 3 | |
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