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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
01/11/2019 |
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Data da última atualização: |
01/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HAACH, V.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; FRANCO, A. C. |
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Afiliação: |
VANESSA HAACH, UFRGS; DANIELLE GAVA, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ANA CLÁUDIA FRANCO, UFRGS. |
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Título: |
One-step multiplex RT-qPCR for the detection and subtyping of influenza A virus in swine in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Virological Methods, v. 269, p. 43-48, 2019. |
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DOI: |
10.1016/j.jviromet.2019.04.005 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Pandemic H1N1, human-like H1N2 and H3N2 influenza A (IAV) viruses are co-circulating in swine herds in Brazil. The genetic analysis of the Brazilian IAVs has shown that they are genetically distinct from viruses found in swine in other countries; therefore, an update of the diagnostic assays for IAV detection and subtyping is needed. This study describes the development and validation of a TaqMan based ? one-step multiplex RT-qPCR to discriminate the hemagglutinin and neuraminidase genes of the three major IAV ubtypes circulating in pigs in Brazil. The RT-qPCR assays presented 100% (95.7?100, CI 95%) of diagnostic sensitivity in the analysis of 85 IAVs, previously characterized by sequencing. The limits of detection ranged from 5.09 × 101 to 5.09 × 103 viral RNA copies/μL. For the analytical specificity, 73 pig samples collected during 2017 and 2018 were analyzed, resulting in the identification of the subtype in 74.0% (62.9?82.7, CI 95%) of samples. From these, 46.3% were H3N2, 33.3% were H1N1, 11.1% were H1N2 and 3.7% were HxN1. Mixed viral infections (3.7%) and reassortant viruses (1.9%) were also detected by the test. This multiplex RT-qPCR assay provides a fast and specific diagnostic tool for identification of different subtypes and lineages of IAV in pigs, contributing to the monitoring of influenza in swine. |
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Palavras-Chave: |
Diagnóstico rápido; Multiplex RT-qPCR; Rapid diagnosis; RT-qPCR multiplex; Subtipagem; Subtyping; Vírus da gripe A. |
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Thesagro: |
Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Influenza A virus; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | MONTEIRO NETTO, M.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; COSENTINO, I. O.; BALARO, M. F. A.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Dinâmica ovariana folicular e luteal em cabras leiteiras induzidas e sincronizadas por programa de luz e d-cloprostenol na contra-estação reprodutiva. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 552, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 2. | | MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; COSENTINO, I. O.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Indução e sincronização do estro por programa de luz e d-cloprostenol em cabras leiteiras na contra-estação reprodutiva. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 539, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | COSTA, P. R. da; RODRIGUES, J. N. D.; MONTEIRO NETTO, M.; RANGEL, P. S. C.; OLIVEIRA, M. E. F.; FONSECA, J. F. da. Inseminação artificial em tempo fixo em cabras com estro sincronizado com cloprostenol associado à gonodrofina coriônica equina. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 10., 2021, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2022. p. 39-40.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 4. | | COSTA, P. R. da; RODRIGUES, J. N. D.; MONTEIRO NETTO, M.; RANGEL, P. S. C.; OLIVEIRA, M. E. F.; FONSECA, J. F. da. Inseminação artificial em tempo fixo (IATF) em cabras leiteiras cíclicas com estro sincronizado com cloprostenol associado à gonadotrofina coriônica equina (eCG). In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 11., 2022, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2023. p. 36-37. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Eventos técnicos & científicos).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | SANTOS, J. D. R.; BATISTA, R. I. T. P.; TAIRA, A. R.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; BRAIR, V. L.; MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Cervical relaxation protocol in sheep decreases Oct-4 and Nanog gene expression temporarily. Animal Reproduction, v. 17, n. 3, 2020. Edição dos Abstracts of the 34nd Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE), 2020 (online).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; COSENTINO, I. O.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; OLIVEIRA, R. V. de; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Use of two cloprostenol administrations 11.5 days apart efficiently synchronizes oestrus in photostimulated multiparous dairy goats in the non-breeding season. Reproduction in Domestic Animals, v. 55, n. 8, p. 965-973, Aug. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Registros recuperados : 6 | |
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