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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
15/03/2019 |
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Data da última atualização: |
06/05/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
CAMPOS, C. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; ALMEIDA, J. R. M. de; QUIRINO, B. F.; ABDELNUR, P. V. |
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Afiliação: |
Christiane Gonçalves Campos; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; JOAO RICARDO MOREIRA DE ALMEIDA, CNPAE; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE. |
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Título: |
Targeted metabolomics of Xylose-Fermenting yeasts based on mass spectrometry. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: BAIDOO E. (Eds.) Microbial metabolomics. Methods in Molecular Biology. New York, NY: Humana Press, 2019. |
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Volume: |
1859. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Mass spectrometry is a sensitive and selective analytical technique that enables detection and quantitation of low abundance compounds in a complex sample matrix. Targeted metabolomics allows for quantitative analysis of metabolites, providing kinetic information of production and consumption rates, an essential step to investigate microbial metabolism. Here, we describe a targeted metabolomics protocol for yeast samples, from sample preparation to mass spectrometry analysis, which enables the identification of metabolic fluxes after xylose consumption. Sample preparation methods were optimized for quenching of yeast metabolism followed by intracellular metabolite extraction, using cold methanol and boiling ethanol protocols. Ultrahigh performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) methods using ion pair chromatography (IPC) and hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) allowed for the quantitation of 18 metabolites involved in central carbon metabolism (glycolysis, pentose phosphate pathway, and tricarboxylic acid cycle). The protocol here described was successfully applied to quantify metabolites in Scheffersomyces stipitis, Spathaspora passalidarum, Spathaspora arborariae, and Candida tenuis samples after xylose consumption. |
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Palavras-Chave: |
Microbial metabolomics. |
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Thesaurus Nal: |
Biotechnology; Yeasts. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aMass spectrometry is a sensitive and selective analytical technique that enables detection and quantitation of low abundance compounds in a complex sample matrix. Targeted metabolomics allows for quantitative analysis of metabolites, providing kinetic information of production and consumption rates, an essential step to investigate microbial metabolism. Here, we describe a targeted metabolomics protocol for yeast samples, from sample preparation to mass spectrometry analysis, which enables the identification of metabolic fluxes after xylose consumption. Sample preparation methods were optimized for quenching of yeast metabolism followed by intracellular metabolite extraction, using cold methanol and boiling ethanol protocols. Ultrahigh performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) methods using ion pair chromatography (IPC) and hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) allowed for the quantitation of 18 metabolites involved in central carbon metabolism (glycolysis, pentose phosphate pathway, and tricarboxylic acid cycle). The protocol here described was successfully applied to quantify metabolites in Scheffersomyces stipitis, Spathaspora passalidarum, Spathaspora arborariae, and Candida tenuis samples after xylose consumption.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | SADECK, L. W. R.; LIMA, A. M. M. de; ADAMI, M. Artificial neural network for ecological-economic zoning as a tool for spatial planning. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n, 11, p. 1050-1062, novembro 2017. Título em português: Rede neural artificial para o zoneamento ecológico-econômico como instrumento de ordenamento territorial.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | OLIVEIRA, R. R. S. de; VENTURIERI, A.; SAMPAIO, S. M. N.; LIMA, A. M. M. de; ROCHA, E. J. P. da. Dinâmica de uso e cobertura da terra das regiões de integração do Araguaia e Tapajós/PA, para os anos de 2008 e 2010. Revista Brasileira de Cartografia, v. 68, n. 7, p. 1411-1424, jul./ago. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | SILVA JUNIOR, J. de A.; COSTA, A. C. L. da; SANTIAGO, A. V.; RODRIGUES, H. J. B.; COSTA, R. F. da; LIMA, A. M. M. de; MORAES, B. C. de; SOUZA, F. T. M. de. Influência do el niño nas condições de conforto térmico na cidade de Belém. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE CLIMATOLOGIA, 7., 2017, Petropólis. Anais. [S.l.]: SBMET, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | SILVA JUNIOR, J. de A.; COSTA, A. C. L. da; FERREIRA, D. B. da S.; SANTIAGO, A. V.; SOUZA, E. B. de; MORAES, B. C. de; COSTA, R. F. da; FEITOSA, J. R. P.; RODRIGUES, H. J. B.; LIMA, A. M. M. de; COSTA, J. de P. R. da; SOUZA, P. F. S. de. Análise da precipitação pluvial em três localidades na cidade de Belém, Pará no ano de 2016. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE CLIMATOLOGIA, 7., 2017, Petropólis. Anais. [S.l.]: SBMET, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| Registros recuperados : 6 | |
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