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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
10/12/2018 |
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Data da última atualização: |
08/08/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
OLIVEIRA, F. A. de. |
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Afiliação: |
Fernanda Ancelmo de Oliveira, UNICAMP. |
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Título: |
Estudos genético-genômicos em gramíneas forrageiras tropicais dos gêneros Urochloa e Paspalum. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, 2017. |
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Páginas: |
212 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Co-Orientadora: Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Conteúdo: |
A pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. Esses foram anotados e relacionados à vias de fixação de carbono C4, síntese de lignocelulose e à resposta ao stress por alagamento. A busca por potenciais marcadores revelou 4.489 microssatélites (SSR) e 560.298 single nucleotide polymorphisms (SNP). Foram identificados genes únicos e diferencialmente expressos, corroborados por qPCR, entre os dois genótipos do banco de germoplasma da Embrapa utilizados para análise, o acesso apomítico BH16 ?cultivar BRS Tupi (CIAT 26149) e o único genótipo sexual da espécie, o acesso BH031 (CIAT 26146). Sugere-se, ainda, uma provável origem híbrida para o BH031. Para P. notatum, foi gerado um transcriptoma altamente representativo, a partir de dois tecidos (folha e flor) de seis genótipos com réplicas biológicas, que apresentam diferentes ploidias e modo de reprodução (sexual ou apomítico), resultando em mais de 100.000 unigenes montados com métricas robustas. Através de abordagens de expressão diferencial de genes entre sexuais e apomíticos, enriquecimento dos termos GO (Gene Ontology) e rede de coexpressão gênica, foram identificados genes candidatos a apomixia. Esses podem ser melhor investigados, visando elucidar esse intrigante mecanismo de reprodução, como também, desenvolver marcadores ligados a apomixia. Adicionalmente, no estudo de Paspalum, foram desenvolvidos marcadores SSR genômicos inéditos para P. plicatulum, e transferidos para outras espécies que compõem grupo botânico Plicatula, constituindo uma ferramenta valiosa para o estudo da variabilidade genética de acessos de banco de germoplasma das espécies estudadas. Ainda, buscando aprofundar o conhecimento sobre o complexo grupo Plicatula, obteve-se um expressivo conjunto de dados genômicos através de RAD-seq para as espécies. De modo que podem ser usados para auxiliar na classificação taxonômica e delimitação de espécies, bem como nos programas de coleta, conservação e melhoramento das espécies de Paspalum. MenosA pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Grupo Plicatula. |
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Thesagro: |
Gramínea Forrageira. |
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Thesaurus Nal: |
Paspalum; Urochloa. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Cutter |
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| Registros recuperados : 33 | |
| 4. |  | MACÊDO, J. K. A.; RODRIGUES NETO, J. C.; BARROS, J. S.; JUNGMANN, L.; ABDELNUR, P. V. Comparative protein analysis of oil palm mesocarp from Elaeis guineenses and Elaeis oleifera to investigate acidification process. In: ASMS CONFERENCE ON MASS SPECTOMETRY AND ALLIED TOPICS, 64., 2016, San Antonio, Texas. [Anais ...]. Santa Fe: ASMS, 2016. Não paginado. 1 Poster.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 6. | | RODRIGUES NETO, J. C.; TEIXEIRA, T. S.; COSTA, P. P. K. G.; ABDELNUR, P. V. Desenvolvimento de protocolo de aplicação de matriz em folha de dendê para imagem química por MALDI-MS. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 7. | | TEIXEIRA, T. S.; RODRIGUES NETO, J. C.; CONCEIÇÃO, A. A.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Interações fúngicas observadas através de imagem química por espectrometria de massas. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 159-164 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 8. | | TEIXEIRA, T. S.; RODRIGUES NETO, J. C.; SILVA, E. A.; CONCEIÇÃO, A. A.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Mass spectrometry imaging for fungal interaction analysis: Classic versus imprinting methods. Brazilian Journal of Analytical Chemistry, v. 10, n. 38, p. 71-78, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 9. | | SOUZA, M. de A.; GUIMARÃES, M. B.; RODRIGUES NETO, J. C.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Metabolômica de Schizophyllum commune cultivados em torta do caroço de algodão por espectrometria de massas. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 49-56 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 10. | | SOUTO, A. L.; RODRIGUES-NETO, J. C.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Identificação de marcadores químicos do amarelecimento fatal em Elaeis guineensis por UHPLC-MS e PCA. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 39., 2016, Goiânia, GO. Criar e empreender: anais ... São Paulo: SBQ, 2016. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 11. | | RODRIGUES NETO, J. C.; SILVA, M. E. R. da; COSTA, P. P. K. G.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Desenvolvimento de protocolo analítico para folhas de dendê utilizando imagem química por MALDI-MS. In: WORKSHOP DA PÓS-GRADUAÇÃO EM QUÍMICA, 1., 2015, Goiânia, GO. [Resumos ...] Goiânia: UFG, 2015. WSPGQ-032| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 12. | | TEIXEIRA, T. S.; RODRIGUES NETO, J. C.; CONCEIÇÃO, A. A.; COSTA, P. P. K. G.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Analysis of fungal co-culture metabolites using both classic and imprinting Mass Spectrometry Imaging. In: IBEROAMERICAN CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY, 3., 2022, Rio de Janeiro. Book of abstracts. [S/l]: Sociedade Brasileira de Espectrometria de Massas, 2022. p. 391-392| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 13. | | FREITAS, S. V. de; SOUZA, F. R. de; RODRIGUES NETO, J. C.; VASCONCELOS, G. A.; ABDELNUR, P. V.; VAZ, B. G.; HENRY, C. S.; COLTRO, W. K. T. Uncovering the formation of color gradients for glucose colorimetric assays on microfluidic paper-based analytical devices by mass spectrometry imaging. Analytical Chemistry, v. 90, n. 20, p. 11949-11954, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 14. | | RODRIGUES NETO, J. C.; CORREIA, M. V.; SOUTO, A. L.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Metabolic biomarkers discovery of fatal yellowing on Elaeis guineensis leaves using metabolomics approach. In: IBERO-AMERICAN, 1.; BrMASS CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY, 6., 2016, Rio de Janeiro. Resumos Eletrônicos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Espectrometria de Massas, 2016. p. 229-230.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 16. | | RODRIGUES-NETO, J. C.; CORREIA, M. V.; SOUTO, A. L.; RIBEIRO, J. A. de A.; VIEIRA, L. R.; SOUZA JUNIOR, M. T.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Metabolic fingerprinting analysis of oil palm reveals a set of differentially expressed metabolites in fatal yellowing symptomatic and non-symptomatic plants. Metabolomics, v. 14, n. 142, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 17. | | SOUZA, M. A.; GUIMARÃES, M. B.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES NETO, J. C.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Metabolômica untargeted por UHPLC-MS em processos pré-tratamento biológico de torta de pinhão manso por macrobasidiomicetos. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 15| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 18. | | RODRIGUES NETO, J. C.; CORREIA, M. V.; SOUTO, A. L.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Validation of a PLS-DA Model for biomarker discovery in Elaeis guineensis leaves related to fatal yellowing using UHPLC-MS/MS analysis. In: WORLD CHEMISTRY CONGRESS, 46.,; REUNIÃO ANNUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 40., 2017, São Paulo, SP. [Resumos ...]. São Paulo: SBQ, 2017. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 19. | | BITTENCOURT, C. B.; SILVA, T. L. C. da; RODRIGUES NETO, J. C.; VIEIRA, L. R.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Insights from a multi-omics integration (MOI) study in oil palm (Elaeis gineensis Jacq.) response to abiotic stresses: part one - salinity. Plants, 11, n. 1755, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
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| 20. | | LEAO, A. P.; BITTENCOURT, C. B.; SILVA, T. L. C. da; RODRIGUES NETO, J. C.; BRAGA, I. de O.; VIEIRA, L. R.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOUSA, C. A. F. de; ABDELNUR, P. V.; SOUZA JUNIOR, M. T. Insights from a Multi-Omics Integration (MOI) Study in Oil Palm (Elaeis gineensis Jacq.) Response to Abiotic Stresses: Part Two - Drought. Plants, 11, n. 2786, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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