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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
19/10/2018 |
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Data da última atualização: |
19/10/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
WILLIAM RAPHAEL LORENZETTI, UDESC/Chapecó; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; IGOR RICARDO SAVOLDI, UNC/Concórdia; KAMILLA BLEIL DO CARMO, UNC/Concórdia; HANIEL CEDRAZ DE OLIVEIRA, UFV; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Identification of endogenous normalizing genes for expression studies in inguinal ring tissue for scrotal hernias in pigs. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 13, n.9, e0204348, 2018. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0204348 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and since the stability of these genes could be variable depending on the experimental design, it has become indispensable to test the reliability of endogenous genes. Therefore, this study evaluated 10 reference candidate genes in two different experimental conditions in order to obtain stable genes to be used as reference in expression studies related to scrotal hernias in pigs. Two independent experiments were performed: one with 30 days-old MS115 pigs and the other with 60 days-old Landrace pigs. The inguinal ring/canal was collected, frozen and further submitted to real-time PCR analysis (qPCR). For the reference genes stability evaluation, four tools were used: GeNorm in the SLqPCR, BestKeeper, NormFinder and Comparative CT. A general ranking was generated using the BruteAggreg function of R environment. In this study, the RPL19 was one of the most reliable endogenous genes for both experiments. The breed/age effects influenced the expression stability of candidate reference genes evaluated in the inguinal ring of pigs. Therefore, this study reinforces the importance of evaluating the stability of several endogenous genes previous their use, since a consensual set of reference genes is not easily obtained. Here, two sets of genes are recommended: RPL19, RPL32 and H3F3A for 30-days MS115 and PPIA and RPL19 for the 60 days-old Landrace pigs. This is the first study using the inguinal ring tissue and the results can be useful as an indicative for other studies working with gene expression in this tissue. Resumo: O uso de genes de referência é necessário para a quantificação relativa na análise da expressão gênica e como a estabilidade desses genes pode ser variável dependendo do desenho experimental, tornou-se indispensável testar a confiabilidade dos genes endógenos. Portanto, este estudo avaliou 10 genes candidatos de referência em duas condições experimentais diferentes, a fim de obter genes estáveis para serem usados como referência em estudos de expressão relacionados a hérnias escrotais em suínos. Dois experimentos independentes foram realizados: um com porcos MS115 com 30 dias de idade e outro com porcos Landrace com 60 dias de idade. O anel / canal inguinal foi coletado, congelado e posteriormente submetido à análise de PCR em tempo real (qPCR). Para a avaliação da estabilidade dos genes de referência, foram utilizadas quatro ferramentas: GeNorm no SLqPCR, BestKeeper, NormFinder e Comparative CT. Uma classificação geral foi gerada usando a função BruteAggreg do ambiente R. Neste estudo, o RPL19 foi um dos genes endógenos mais confiáveis para ambos os experimentos. Os efeitos raça / idade influenciaram a estabilidade de expressão dos genes de referência candidatos avaliados no anel inguinal de suínos. Portanto, este estudo reforça a importância de avaliar a estabilidade de vários genes endógenos antes do seu uso, uma vez que um conjunto consensual de genes de referência não é facilmente obtido. Aqui, dois conjuntos de genes são recomendados: RPL19, RPL32 e H3F3A para MS115 de 30 dias e PPIA e RPL19 para os suínos Landrace com 60 dias de idade. Este é o primeiro estudo usando o tecido anelar inguinal e os resultados podem ser úteis como um indicativo para outros estudos que trabalham com expressão gênica neste tecido. MenosAbstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and since the stability of these genes could be variable depending on the experimental design, it has become indispensable to test the reliability of endogenous genes. Therefore, this study evaluated 10 reference candidate genes in two different experimental conditions in order to obtain stable genes to be used as reference in expression studies related to scrotal hernias in pigs. Two independent experiments were performed: one with 30 days-old MS115 pigs and the other with 60 days-old Landrace pigs. The inguinal ring/canal was collected, frozen and further submitted to real-time PCR analysis (qPCR). For the reference genes stability evaluation, four tools were used: GeNorm in the SLqPCR, BestKeeper, NormFinder and Comparative CT. A general ranking was generated using the BruteAggreg function of R environment. In this study, the RPL19 was one of the most reliable endogenous genes for both experiments. The breed/age effects influenced the expression stability of candidate reference genes evaluated in the inguinal ring of pigs. Therefore, this study reinforces the importance of evaluating the stability of several endogenous genes previous their use, since a consensual set of reference genes is not easily obtained. Here, two sets of genes are recommended: RPL19, RPL32 and H3F3A for 30-days MS115 and PPIA and RPL19 for the 60 days-old Landrace pigs. This is the first study us... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Hérnias escrotais; Scrotal hernias. |
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Thesagro: |
Genética Animal; Hérnia; Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding; Breeding and Genetic Improvement; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 04455naa a2200325 a 4500
001 2097801
005 2018-10-19
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 21 | |
| 9. |  | ALVARES, M. C. de; OLIVEIRA, S. A. de; MATTOS, J. K. de A.; MESQUITA FILHO, M. V. de. Efeito de B na absorcao de N, P e K em repolho cultivado em solo de cerrado. In: REUNIAO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRICAO DE PLANTAS, 22., 1996, Manaus, AM. Resumos expandidos... Manaus: SBCS/UA-FCA/EMBRAPA-CPAO/INPA, 1996. p.429-430.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 10. | | ALVARES, M. C.; OLIVEIRA, S. A. de; MATTOS, J. K. de A.; MESQUITA FILHO, M. V. de. Resposta do repolho a adubacao com borax. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 3, n. 2, p. 18-21, nov. 1985.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 12. | | LEÃO, D. S. S.; PEIXOTO, J. R.; VIEIRA, J. V.; MATTOS, J. K. de A.; RAMOS M. L. G. Avaliação do teor de licopeno e sólidos solúveis em oito cultivares de melancia. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, jul. 2004. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 44º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2004. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, p. 367, jul. 2004. Suplemento 1.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 13. | | PINTO, P. H. D.; PEIXOTO, J. R.; JUNQUEIRA, N. T. V.; MATTOS, J. K. de A.; MELO, B. de. Reação de progênies de maracujá-azedo a septoriose. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 22, n. 2, p. 61-67, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 14. | | LEÃO, D. S. S.; PEIXOTO, J. R.; VIEIRA, J. V.; MATTOS, J. K. de A.; RAMOS, M. L. G. Produtividade da melancia cv. Crimson Sweet em diferentes níeis de adubação química e orgânica Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, jul. 2004. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 44º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2004. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, p. 367, jul. 2004. Suplemento 1.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 16. | | JANNUZZI, H.; SILVA, D. B. da; ALVES, R. de B. N.; BIZZO, H. R.; MATTOS, J. K. de A.; VIEIRA, R. F. Avaliação de biomassa e atividade antioxidante do óleo essencial de cultivares comerciais de manjericão no Distrito Federal. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE ÓLEOS ESSENCIAIS, 6., 2011, Campinas. Livro de resumos. Campinas: Unicamp, 2011. p. 180.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| 17. | | CAMILLO, J.; BRAGA, V. C.; MATTOS, J. K. de A.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; PADILHA J.; PEREIRA, J. E. S. Seed biometric parameters in oil palm accessions from a brazilian germplasm bank. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 8, p. 604-612, ago. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 18. | | PINTO, P. H. D.; PEIXOTO, J. R.; JUNQUEIRA, N. T. V.; RESENDE, R. de O.; MATTOS, J. K. de A.; MELO, B. de. Reação de genótipos de maracujazeiro-azedo ao vírus do endurecimento do fruto. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 24, n. 2, p. 19-26, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 19. | | LEÃO, R. M. K.; PEIXOTO, J. R.; JUNQUEIRA, N. T. V.; RESENDE, R. de O.; MATTOS, J. K. de A.; MELO, B. de. Reação de progênies de maracujazeiro-azedo ao vírus do endurecimento do fruto em casa de vegetação. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 22, n. 2, p. 87-92, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 20. | | FREITAS, V. M. DE; MATTOS, J. K. de A.; SILVA, J. G. P.; CARNEIRO, M. D. G.; GOMES, C. B.; CASTRO, J. M. da C. e; CARNEIRO, R. M. D. G. Hospedabilidade de fruteiras a Meloidogyne enterolobii: uma sugestão de manejo para áreas infestadas. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2015. 36 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 310)| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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