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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
11/10/2018 |
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Data da última atualização: |
11/10/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALBUQUERQUE, H. Y. G. de; CARMO, C. D. do; BRITO, A. C.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
HILÇANA YLKA GONÇALVES DE ALBUQUERQUE, UFRB; CATIA DIAS DO CARMO, UFRB; ANA CARLA BRITO; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Genetic diversity of Manihot esculenta Crantz germplasm based on single-nucleotide polymorphism markers. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Annals Applied Biology, p. 1-14, 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cassava (Manihot esculenta Crantz) is a species whose natural diversity has great food, industrial and energy potential. This study aimed to evaluate the genetic diversity, and population structure of 1,580 accessions belonging to the international germplasm conserved in Brazil using 20,601 single?nucleotide polymorphism markers. The average values of polymorphic information content (PIC), inbreeding (f), observed heterozygosity (Ho) and expected heterozygosity (He) were 0.24, 0.21, 0.23 and 0.30, respectively, presenting levels of genetic diversity compatible with the nature of the marker (predominantly biallelic) and with the species reproductive system. The mean values of He, Ho, PIC and f were similar for the 18 chromosomes of the species. At the individual level, f values ranged from 0.49 to 0.97, with an average of 0.69, whereas some cassava accessions showed f?>?0.90. The values of linkage disequilibrium ranged from 15 to 20?kb (r2?=?0.20). In the discriminant analysis of principal components (DAPC), 22 groups were formed with probabilities of assignment of individuals above 0.99. No association was observed between DAPC grouping and clusters based on phenotypic data (cyanogenic compound content and colour of the root pulp) and on genetic and geographic origin. However, the DAPC grouping resulted in greater variation between groups (14.85%). This information suggests extensive exchange of cassava germplasm in Brazil and wide molecular and phenotypic diversity. These results will provide a better understanding of the preserved genetic variability and the population organisation of the germplasm. MenosCassava (Manihot esculenta Crantz) is a species whose natural diversity has great food, industrial and energy potential. This study aimed to evaluate the genetic diversity, and population structure of 1,580 accessions belonging to the international germplasm conserved in Brazil using 20,601 single?nucleotide polymorphism markers. The average values of polymorphic information content (PIC), inbreeding (f), observed heterozygosity (Ho) and expected heterozygosity (He) were 0.24, 0.21, 0.23 and 0.30, respectively, presenting levels of genetic diversity compatible with the nature of the marker (predominantly biallelic) and with the species reproductive system. The mean values of He, Ho, PIC and f were similar for the 18 chromosomes of the species. At the individual level, f values ranged from 0.49 to 0.97, with an average of 0.69, whereas some cassava accessions showed f?>?0.90. The values of linkage disequilibrium ranged from 15 to 20?kb (r2?=?0.20). In the discriminant analysis of principal components (DAPC), 22 groups were formed with probabilities of assignment of individuals above 0.99. No association was observed between DAPC grouping and clusters based on phenotypic data (cyanogenic compound content and colour of the root pulp) and on genetic and geographic origin. However, the DAPC grouping resulted in greater variation between groups (14.85%). This information suggests extensive exchange of cassava germplasm in Brazil and wide molecular and phenotypic diversity. These r... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava; Population structure; Variability. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 14 | |
| 1. |  | SOUZA, T. S. de; COSTA, J. N.; MARTINEZ, P. M.; COSTA NETO, A. O.; PINHEIRO, R. R. Anticorpos contra o vírus da língua azul em rebanhos ovinos da microrregião de Juazeiro, Bahia. Arquivos do Instituto Biológico, v. 77, n. 3, p. 419-427, jul./set. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 2. | | MARTINEZ, P. M.; COSTA, J. N.; SOUZA, T. S. de; COSTA NETO, A. O.; PINHEIRO, R. R. Sistemas de criação de ovinos e ocorrência de anticorpos contra o vírus da Maedi-Visna na microrregião de Juazeiro, BA. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, v. 11, n. 2, p. 342-353, abr./jun. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | CARVALHO, V. S.; SANTOS, M. C.; GUIMARÃES, J. E.; OLIVEIRA FILHO, J. C. O.; COSTA NETO, A. O.; MACÊDO, J. T. S. A.; PEDROSO, P. M. O. Doenças podais em ovinos no estado da Bahia. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 7, p. 1678-5150, julho 2018 Título em inglês: Foot diseases in sheep in the state of Bahia, Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | SOUZA, T. S. de; MARTINEZ, P. M.; COSTA, J. N.; LIMA, C. C. V. de; COSTA NETO, A. O.; PINHEIRO, R. R. Caracterização dos sistemas de produção de ovinos da região do Baixo Médio São Francisco, Bahia, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 3 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | PINHEIRO, D. N. S.; COSTA, J. N.; SOUZA, T. S. de; SANTOS, V. W. S.; AZEVEDO, D. A.; COSTA NETO, A. O.; PINHEIRO, R. R. Serum epidemiological survey and risk factors investigation for lentivirus in goats from Sisal Region, Bahia, Brazil. Arquivos do Instituto Biológico, São Paulo, v. 85, p. 1-6, e0812016, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | SOUZA, T. S.; COSTA, J. N.; MARTINEZ, P. M.; LIMA, C. C. V.; ARAÚJO, B. R.; COSTA NETO, A. O.; ANUNCIAÇÃO, A. V. M.; ALMEIDA, M. G. A. R.; PINHEIRO, R. R. Inquérito soro-epidemiológico de Brucella ovis em rebanhos ovinos no semiárido baiano. Arquivo do Instituto Biológico, São Paulo, v. 79, n. 2, p. 277-281, abr./jun., 2012.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | LIMA, C. C. V. de; COSTA, J. N.; SOUZA, T. S. de; MARTINEZ, P.; COSTA NETO, A. O.; ANUNCIAÇÃO, A. V. M.; ALMEIDA, M. das G. Á. R.; ARAÚJO, B. R.; PINHEIRO, R. R. Inquérito soroepidemiológico do lentivírus caprino e perfil das criações de caprinos na região do Baixo Médio São Francisco (BA). Arquivos do Instituto Biológico, São Paulo, v. 80, n. 3, p. 288-296, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | CARVALHO, J. E. B. de; SOUZA, L. da S.; CASTRO JORGE, L. A.; RAMOS, W. F.; COSTA NETO, A. O.; ARAUJO, A. M. de A.; LOPES, L. C.; JESUS, M. S. de. Manejo de coberturas do solo e sua interferência no desenvolvimento do sistema radicular da laranja 'pera'. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIENCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 21., jul. 1997, Caxambu, MG. Resumos... [S.l.: s.n.], 1997. p. 399. Entrada padronizada: JORGE, L. A. C.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 9. | | CARVALHO, J. E. B. de; SOUZA, L. da S.; JORGE, L. A. C.; RAMOS, W. F.; COSTA NETO, A. O.; ARAÚJO, A. M. de A.; LOPES, L. C.; JESUS, M. S. de. Manejo de coberturas do solo e sua interferência no desenvolvimento do sistema radicular da laranja 'pera'. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v.21, n.2, p. 140-145, ago. 1999.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 10. | | LIMA, C. C. V. de; COSTA, J. N.; SOUZA, T. S. de; MARTINEZ, P. M.; COSTA NETO, A. O.; AZEVEDO, D. A. A.; PINHEIRO, R. R.; BRITO, R. L. L. de. Imunodiagnóstico para a artrite-encefalite caprina em rebanhos do semiárido baiano, Brasil. Revista Brasileira de Medicina Veterinária, Rio de Janeiro, v. 35, n. 4, p. 358-364, out./dez. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 11. | | LIMA, C. C. V. de; AYRES, M. C. C.; PINHEIRO, R. R.; COSTA, J. N.; COSTA NETO, A. O.; ANDRIOLI, A. A.; SOUZA, T. S. de; AZEVEDO, D. A. A. de; SANTOS, V. W. S. dos; OLIVEIRA, L. G. Influência da lentivirose no metabolismo de ovinos. Biológico, São Paulo, v. 77, p. 120, 2015. Suplemento 2, ref. 240 Edição dos Resumos XI Congresso Brasileiro de Buiatria, XVII Congresso Latinoamericano de Buiatria, jul. São Paulo, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 12. | | SOUZA, T. S. de; PINHEIRO, R. R.; COSTA, J. N.; LIMA, C. C. V. de; ANDRIOLI, A.; AZEVEDO, D. A. A. de; SANTOS, V. W. S. dos; ARAÚJO, J. F.; SOUZA, A. L. M. de; COSTA NETO, A. O. Interspecies transmission of lentiviruses from goats to sheep. Biológico, São Paulo, v. 77, p. 119, 2015. Suplemento 2, ref. 237. Edição dos Resumos XI Congresso Brasileiro de Buiatria, XVII Congresso Latinoamericano de Buiatria, jul. São Paulo, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 13. | | LIMA, C. C. V.; AYRES, M. C. C.; PINHEIRO, R. R.; COSTA, J. N.; ANDRIOLI, A.; SOUZA, T. S.; AZEVEDO, D. A. A.; SANTOS, V. W. S.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M.; PEIXOTO, R. M.; DAMASCENO, E. M.; COSTA NETO, A. O. Caprine lentivirus in sheep milk and semen. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 69, n. 2, mar./apr. 2017. Título em português: Lentivírus caprino em leite e sêmen de ovinos.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 14. | | SOUZA, T. S. de; PINHEIRO, R. R.; COSTA, J. N.; LIMA, C. C. V. de; ANDRIOLI, A.; AZEVEDO, D. A. A. de; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; PINHEIRO, D. N. S.; FERNANDES, F. M. C.; COSTA NETO, A. O. Interspecific transmission of small ruminant lentiviruses from goats to sheep. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 46, n. 3, p. 867-874, July/Sept. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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