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Biblioteca(s):  Embrapa Cerrados.
Data corrente:  24/08/2018
Data da última atualização:  20/11/2018
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  SOUZA, L. M. de; SANTOS, L. H. B. dos; ROSA, J. R. B. F.; SILVA, C. C. da; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F.; LE GUEN, V.; SOUZA, A. P. de.
Afiliação:  LIVIA M. DE SOUZA, UNICAMP; LUCIANO H. B. DOS SANTOS, UNICAMP; JOÃO R. B. F. ROSA, USP/ESALQ; CARLA C. DA SILVA, UNICAMP; CAMILA C. MANTELLO, UNICAMP; ANDRE R. O. CONSON, UNICAMP; ERIVALDO J. SCALOPPI JUNIOR, IAC; JOSEFINO DE FREITAS FIALHO, CPAC; MARIO LUIZ T. DE MORAES, UNESP; PAULO DE S. GONÇALVES, IAC; GABRIEL R. A. MARGARIDO, USP/ESALQ; ANTONIO A. F. GARCIA, USP/ESALQ; VINCENT LE GUEN, CIRAD; ANETE P. DE SOUZA, UNICAMP.
Título:  Linkage disequilibrium and population structure in wild and cultivated populations of rubber tree (Hevea brasiliensis).
Ano de publicação:  2018
Fonte/Imprenta:  Frontiers in Plant Science, v. 9, article 815, 03 July 2018.
DOI:  https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00815
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Abstract: Among rubber tree species, which belong to the Hevea genus of the Euphorbiaceae family, Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr.de Juss.) Muell. Arg. is the main commercial source of natural rubber production worldwide. Knowledge of the population structure and linkage disequilibrium (LD) of this species is essential for the efficient organization and exploitation of genetic resources. Here, we obtained single-nucleotide polymorphisms (SNPs) using a genotyping-by-sequencing (GBS) approach and then employed the SNPs for the following objectives: (i) to identify the positions of SNPs on a genetic map of a segregating mapping population, (ii) to evaluate the population structure of a germplasm collection, and (iii) to detect patterns of LD decay among chromosomes for future genetic association studies in rubber tree. A total of 626 genotypes, including both germplasm accessions (368) and individuals from a genetic mapping population (254), were genotyped. A total of 77,660 and 21,283 SNPs were detected by GBS in the germplasm and mapping populations, respectively. The mapping population, which was previously mapped, was constructed with 1,062 markers, among which only 576 SNPs came from GBS, reducing the average interval between two adjacent markers to 4.4 cM. SNPs from GBS genotyping were used for the analysis of genetic structure and LD estimation in the germplasm accessions. Two groups, which largely corresponded to the cultivated and wild populations, were detected usin... Mostrar Tudo
Thesagro:  Comportamento de Variedade; Hevea Brasiliensis; População de Planta; Seringueira; Variação Genética.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181926/1/DL-Hevea-brasiliensis-Livia-public-Frontiers-3.07.2018apagar.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Cerrados (CPAC)
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1.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, L. M. de; LE GUEN, V.; CERQUEIRA-SILVA, C. B. M.; SILVA, C. C.; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; SOUZA, A. P. de. Genetic diversity strategy for the management and use of rubber genetic resources: more than 1,000 wild and cultivated accessions in a 100-Genotype core collection. Plos One, San Francisco, v. 10, n. 7, e013607, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, L. M. de; SANTOS, L. H. B. dos; ROSA, J. R. B. F.; SILVA, C. C. da; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F.; LE GUEN, V.; SOUZA, A. P. de. Linkage disequilibrium and population structure in wild and cultivated populations of rubber tree (Hevea brasiliensis). Frontiers in Plant Science, v. 9, article 815, 03 July 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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