BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Área de Informação da Sede; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  15/08/2018
Data da última atualização:  13/11/2018
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  PAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc.
Afiliação:  Tiago do Prado Paim, Instituto Federal Goiano/Campus Iporá; PATRICIA IANELLA, Cenargen; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; Concepta Margaret McManus Pimentel, Universidade de Brasília - Unb/Instituto de Biologia.
Título:  Detection and evaluation of selection signatures in sheep.
Ano de publicação:  2018
Fonte/Imprenta:  Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018
Idioma:  Inglês
Notas:  Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos.
Conteúdo:  The recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field.
Palavras-Chave:  Analysis software; SNP markers.
Thesagro:  Genética Molecular; Genoma; Melhoramento Genético Animal; Ovis Aries.
Thesaurus NAL:  Animal genetic resources; Genetic improvement; Genomics; Molecular genetics; Sheep.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181463/1/Detection-and-evaluation-of-selection.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
AI-SEDE62911 - 1UPEAP - DD
CENARGEN37356 - 1UPCSP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Bovine genome sequenced: new tools and their applications. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 18.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Marcadores SNP: conceitos básicos, aplicações no manejo e no melhoramento animal e perspectivas para o futuro. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 38, p. 64-71, 2009. Suplemento especial.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Embrapa's animal genomics network and biotechnology for economically important traits. In: RDA AND EMBRAPA JOINT WORKSHOP [ON] STRATEGIC RESEARCH COOPERATION ON HORTICULTURE AND ANIMAL SCIENCE, 3., 2013, Suwon. Proceedings... [Jeonju]: RDA; Suwon: Embrapa Labex Korea, 2013. p. 191-214
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Revelado o mapa físico do genoma bovino. In: SANTOS, M. G. B. dos. (Org). Artigos técnicos divulgados na mídia: coletânea 2007. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 244). Publicado em 21/08/2007. Disponível em: Cultivar, cultivar210807; Boletim Pecuário, bpecuario210807; Clicnews, clicnews210807; Pets, pets210807; Hotel Virtual, hvirtual210807; Agrosoft, agrosoft210807; Portal Biotecnologia Ufla,...
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoARAÚJO, R. O. de; CAETANO, A. R. Low density genomic data for animal breeding: critical analysis and perspectives of the GoldenGate Beadxpress technology. Ciência Rural, Santa Maria, v. 46, n. 11, p. 2005-2011, nov. 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoGIBBS, R. A.; CAETANO, A. R. The genome sequence of taurine Cattle: a window to ruminant biology and evolution. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W085.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoREBELATO, A. B.; CAETANO, A. R. Runs of homozygosity for autozygosity estimation and genomic analysis in production animals. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 9, p. 975-984, Sept. 2018
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Área de Informação da Sede; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSTAFUZZA, N. B.; CAETANO, A. R.; AMARAL, M. E. J. Mapeamento RH dos genes APOM, BDA20 e CRABP2 no genoma bovino. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 194.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; GUIMARÃES, M. F. M. Genotipagem dos touros do teste de progênie: Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Associação Brasileira dos Criadores de Girolando, 2008. 1 Folder.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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10.Imagem marcado/desmarcadoIANELLA, P.; CAETANO, A. R.; MCMANUS, C.; PAIVA, S. R. Frequencias alélicas e genotípicas do gene PRNP em rebanhos de ovinos Santa Inês no Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. [Anais...]. [S.l.]: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoFACO, O.; PAIVA, S. R.; LOBO, R. N. B.; VILLELA, L. C. V.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTEL, C. M. Núcleo de consercação e melhoramento genético da raça Morada Nova: resultados preliminares. In: XIMENES, L. J. F.; MARTINS, G. A.; MORAIS, O. R. de; COSTA, L. S. de A.; NASCIMENTO, J. L. S. do (Coord.). Ciência e tecnologia na pecuária de caprinos e ovinos. Fortaleza: Banco do Nordeste do Brasil, 2010. Cap. 12. p. 311-337. (Série BNB. Ciência e Tecnologia, 5).
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, J. M. da; CARDOSO, F. F.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Accuracy of low- to medium-density genotype imputation in a Hereford and Braford cattle population from Brazil. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster K11.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sul.
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13.Imagem marcado/desmarcadoIANELLA, P.; MCMANUS, C. M. P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Adaptation of a low-cost medium-throughput genotyping system for ovine prion protein gene polymorphims associated with scrapie. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 4, p. 3180-3185, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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14.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; ARAÚJO, R. O. de; BIEGELMEYER, P.; CARDOSO, F. F. Aplicações práticas de dados genômicos no melhoramento genético animal: progressos recentes e perspectivas futuras. In: ARAGAO, F. J. L.; MOREIRA, J. R. de A. (Ed.). Mendel: das leis da hereditariedade à engenharia genética. Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 193-218
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoALMEIDA, I. G.; IANELLA, P.; FARIA, M. T.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Bulked segregant analysis of the pirarucu (Arapaima gigas) genome for identification of sex-specific molecular markers. Genetics and Molecular Research v. 12, n. 4, p. 6299-6308, Dec. 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Área de Informação da Sede; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; LOPA, T. B. P.; BIEGELMEYER, P.; CAETANO, A. R. Avanços nos programas de avaliação genética aplicados à pecuária de corte. In: JORNADA [DO] NÚCLEO DE ESTUDOS EM SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 8.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 1., 2013, Porto Alegre. A vez da inovação na pecuária de corte: anais. Porto Alegre: NESPRO-UFRGS: SENAR, 2013. p. 179-196. 1 CD-ROM. Editores: Maria Eugênia Andrighetto Canozzi, Bárbara Bremm, João Batista Gonçalves Costa Júnior, Júlio Otávio Jardim Barcellos.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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17.Imagem marcado/desmarcadoANDREOTTI, R.; PEDROSO, M. S.; CAETANO, A. R.; MARTINS, N. F. Comparison of predicted binders in Rhipicephalus (Boophilus) microplus intestine protein variants BM86 Campo Grande Strain, BM86 and BM95. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, São Paulo, v. 17, n. 2, p. 93-98 abr./jun. 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - C
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoLAURI, A.; CHESSA, S.; RASCHETTI, M.; CASTIGLIONI, B.; MARIANI, P.; CAETANO, A. R. New labelling technology for molecular probes applied to the ligation detection reaction?Universal Array System. Molecular Biotechnology, v. 47, n. 1, p. 1-8, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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19.Imagem marcado/desmarcadoGORNI, C.; FILIPPINI, F.; SBARRA, F.; FERRAZ, J. B.; STELLA, A.; CAETANO, A. R.; MARIANI, P. Linkage disequilibrium (LD) and association studies in Marchigiana cattle breed. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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20.Imagem marcado/desmarcadoBIEGELMEYER, P.; GULIAS-GOMES, C. C.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. Linkage disequilibrium, persistence of phase and effective population size estimates in Hereford and Braford cattle. BMC Genetics, v. 17, n. 32, 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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