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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  10/08/2018
Data da última atualização:  24/09/2018
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S.
Afiliação:  SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; Giovanna Gabrielle Cruvinel, UNICEP; Caroline Valério Moraes, UFSCar; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE.
Título:  PCR-based genotyping of SNP markers in sheep.
Ano de publicação:  2018
Fonte/Imprenta:  Molecular Biology Reports, v.45, n.4, p.651-654, aug. 2018.
ISSN:  1573-4978
DOI:  https://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays.
Palavras-Chave:  PCR RFLP; Resistência nematódeo gastrintestinal; Tetra primer ARMS PCR.
Thesagro:  Marcador Molecular; Ovino.
Thesaurus Nal:  Genome.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CPPSE24421 - 1UPCAP - DDPROCI-2018.00040NIC2018.00052
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1.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. R. Avaliação genética de características produtivas e reprodutivas de animais da raça girolando. Fortaleza: Universidade Federal do Ceará, 2013. 107 f. Tese (Mestrado em Produção e Melhoramento Animal). Universidade Federal do Ceará, Fortaleza - CE. Co-orientador: Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva, Embrapa Gado de Leite.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T. Recuperação de pomares improdutivos de cajueiro pela substituição de copa. In: ARAÚJO, J. P. P. de (Ed.). Agronegócio caju: práticas e inovações. Brasília, DF: Embrapa, 2013. parte 4, cap. 2, p. 259-274.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T. Substituição da copa de plantas de cajueiro comum de diferentas idades. 2011. 153 f. il. color. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza.
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; ROSSETTI, A. G. Substituição de copas. In: ARAÚJO, J. P. P. de (Ed.). Caju: o produtor pergunta, a Embrapa responde. 2.ed. rev. e atualiz. Brasília, DF: Embrapa, 2015. Cap. 7, p. 117-128.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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5.Imagem marcado/desmarcadoROSSETTI, A. G.; MONTENEGRO, A. A. T. Substituição de copa: uma alternativa para recuperar pomares de cajueiro improdutivos ou de baixa produtividade. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2012. 25 p. (Embrapa Agroindústria Tropical. Circular técnica, 43).
Tipo: Circular Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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6.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; LIMA, R. N. Avaliação da frequência de fertirrigação sobre a produção do mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 36., 2007, Bonito, MS. Inovação tecnológica: re-organização e sustentabilidade dos espaços produtivos: anais. Bonito: SBEA, 2007. 3 p. 1 CD-ROM
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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7.Imagem marcado/desmarcadoROGGIA, S.; MONTENEGRO, A. C. C. Dessecação pré-plantio no combate às lagartas. Campo & Negócios, Uberlândia, v. 11, n. 129, p. 19-21, nov. 2013.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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8.Imagem marcado/desmarcadoROGGIA, S.; MONTENEGRO, A. C. C. Manejo da dessecação no controle de lagartas. Campo & Negócios. Grãos, Uberlândia, v. 11, n. 127, p. 60-61, set. 2013.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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9.Imagem marcado/desmarcadoMIRANDA, F. R. de; MONTENEGRO, A. A. T. Irrigação do cajueiro. in: Montenegro, A. A. T.; SERRANO, L. A. L.; MESQUITA, A. L. M.; CARDOSO, J. E.; MOURA, C. F. H.; PAULA PESSOA, P. F. A. de. Plantio, manejo e comercialização da cultura do caju anão precoce. Fortaleza: Instituto Frutal, 2011. 123 p. p. 45-60 Consultas LV 634-573 M777p
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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10.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; PARENTE, J. I. G. Método para estimar a oferta de lenha na substituição de copa em cajueiros. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2018. 6 p. (Embrapa Agroindústria Tropical. Comunicado Técnico, 238).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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11.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; BEZERRA, M. A; LIMA, R. N.; COSTA, J. T. A. Avaliação da recuperação de cajueiros submetidos à substituição de copa em diferentes idades. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20., ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Anais... Vitória: Incaper, 2008..
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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12.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; PARENTE, J. I. G.; PESSOA, P. F. A. P. Coeficientes técnicos para a substituição de copas em cajueiros. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2017. 28 p. (Embrapa Agroindústria Tropical. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 150).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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13.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; VIDAL NETO, F. das C.; SERRANO, L. A. L. Clones de cajueiro anão precoce. in: Montenegro, A. A. T.; SERRANO, L. A. L.; MESQUITA, A. L. M.; CARDOSO, J. E.; MOURA, C. F. H.; PAULA PESSOA, P. F. A. de. Plantio, manejo e comercialização da cultura do caju anão precoce. Fortaleza: Instituto Frutal, 2011. 123 p. p. 15-23 Consultar LV 634.573 M777p
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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14.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. R.; SILVA, L. P. da; LOBO, R. N. B. Effect of different mating systems on population structure and genetic progress of a simulated small flock. International Journal of Environmental Sciences and Natural Resources, v. 21, n. 1, e556051, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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15.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; GOMES, A. R. M.; MIRANDA, F. R. de; CRISÓSTOMO, L. A. Evapotranspiração e coeficientes de cultivo da bananeira para a região litorânea do Ceará. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 39, n. 2, p. 203-208, 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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16.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; PARENTE, J. I. G.; LIMA, C. R. de; BEZERRA, M. A. Potencial use of cashew tree (Anacardium occidentale L.) as raw material for the pulp industry. In: INTERNATIONAL HORTICULTURAL CONGRESS, 28., 2010, Lisboa, Portugal. Book of Abstracts. Lisboa: International Society for Horticultural Science, 2010. p. 769. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMIRANDA, F. R. de; MONTENEGRO, A. A. T.; OLIVEIRA, J. J. G. Produtividade da melancia irrigada por gotejamento em diferentes espaçamentos de plantio. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 36, n. 2, p. 158-162, maio/ago. 2005.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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18.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; LIMA, C. R.; PARENTE, J. I. G. Caracterização química da madeira do cajueiro (Anacardium occidentale L.). In: CONGRESSO E EXPOSIÇÃO INTERNACIONAL DE CELULOSE E PAPEL, 43., 2010, São Paulo. Sessões Técnicas. São Paulo: Associação Brasileira Técnica de Celulose e Papel, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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19.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A. A. T.; WEBER, O. B.; LIMA, R. N. de; CRISOSTOMO, L. A. Efeito da aplicação de nitrogênio e potássio na produção da bananeira CV. Pacovan (Musa spp., grupo AAB) sob irrigação. In: Reunião Anual da Sociedade Interamericana de Horticultura Tropical, 49, Fortaleza, 2003. Anais... Fortaleza: SIHT, 2003. p.142
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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20.Imagem marcado/desmarcadoMONTENEGRO, A.; MONTENEGRO, S.; KOIDE, S.; LIMA, J. E. F. W. Hydrological modelling in representative catchments in Brazil using the SWAT model: the experience of the REHIDRO network. In: SOIL AND WATER ASSESSMENT TOOL CONFERENCE, 2014, Porto de Galinhas. Book of abstracts... Texas: USDA Agricultural Research Service, 2014. 2 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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