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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
11/07/2018 |
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Data da última atualização: |
12/07/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; SOLLERO, B. P.; SUREK, D.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
RAFAEL KEITH ONO; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; DIEGO SUREK, CNPSA; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; THAÍS FERNANDA GODOY, ESALQ; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Genome-wide association study for femur-related traits in broilers. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Due to the intense selection for heavier and faster growing broilers, metabolic disorders such as skeletal problems became a worldwide concern. Advances in genome-wide association study (GWAS) methodologies increased the possibility of elucidating the genetic architecture controlling bone integrity traits. Therefore, the aim of this study was to perform a GWAS to identify potential genetic markers and candidate genes associated with femur traits in a paternal broiler line developed by Embrapa. To this, three femur bone-related traits were evaluated in 1,433 chickens: dry matter (FDM), ash content (FAC) and breaking strength (FBS). Chickens were genotyped using the 600K Affymetrix® Axiom® HD panel. A total of 16 regions associated to FAC, being a significant SNP in the GGA19 (rs317696422) and 15 suggestive SNPs in the GGA1, GGA2, GGA3, GGA5, GGA8, GGA13, GGA19 and GGA24. For FDM, only one SNP (GGA1) was significantly associated and was located in the DSCAM gene. For the FBS, two suggestive regions (GGA12 and GGA15) were found and no QTLs were described for this trait in these regions. According to the results, new candidate genes and miRNAs related to ossification, such as TPVR2, gga-mir-146a and PCP4 were associated to important femur traits in the broiler line under study. Resumo:Devido à intensa seleção de frangos de corte mais pesados e de crescimento mais rápido, distúrbios metabólicos, como problemas esqueléticos, tornaram-se uma preocupação mundial. Avanços em metodologias de estudo de associação genômica ampla (GWAS) aumentaram a possibilidade de elucidar a arquitetura genética controlando características de integridade óssea. Portanto, o objetivo deste estudo foi realizar um GWAS para identificar potenciais marcadores genéticos e genes candidatos associados às características do fêmur em uma linhagem de frangos de corte paterna desenvolvida pela Embrapa. Para isso, três características relacionadas ao osso do fêmur foram avaliadas em 1.433 aves: matéria seca (FDM), teor de cinzas (FAC) e resistência à ruptura (FBS). As galinhas foram genotipadas usando o painel 600y Affymetrix® Axiom® HD. Um total de 16 regiões associadas ao FAC, sendo um significativo SNP no GGA19 (rs317696422) e 15 SNPs sugestivos no GGA1, GGA2, GGA3, GGA5, GGA8, GGA13, GGA19 e GGA24. Para FDM, apenas um SNP (GGA1) foi significativamente associado e foi localizado no gene DSCAM. Para o FBS, duas regiões sugestivas (GGA12 e GGA15) foram encontradas e não foram descritos QTLs para essa característica nessas regiões. De acordo com os resultados, novos genes candidatos e miRNAs relacionados à ossificação, como TPVR2, gga-mir-146a e PCP4, foram associados a importantes características do fêmur na linha de frangos em estudo. MenosAbstract: Due to the intense selection for heavier and faster growing broilers, metabolic disorders such as skeletal problems became a worldwide concern. Advances in genome-wide association study (GWAS) methodologies increased the possibility of elucidating the genetic architecture controlling bone integrity traits. Therefore, the aim of this study was to perform a GWAS to identify potential genetic markers and candidate genes associated with femur traits in a paternal broiler line developed by Embrapa. To this, three femur bone-related traits were evaluated in 1,433 chickens: dry matter (FDM), ash content (FAC) and breaking strength (FBS). Chickens were genotyped using the 600K Affymetrix® Axiom® HD panel. A total of 16 regions associated to FAC, being a significant SNP in the GGA19 (rs317696422) and 15 suggestive SNPs in the GGA1, GGA2, GGA3, GGA5, GGA8, GGA13, GGA19 and GGA24. For FDM, only one SNP (GGA1) was significantly associated and was located in the DSCAM gene. For the FBS, two suggestive regions (GGA12 and GGA15) were found and no QTLs were described for this trait in these regions. According to the results, new candidate genes and miRNAs related to ossification, such as TPVR2, gga-mir-146a and PCP4 were associated to important femur traits in the broiler line under study. Resumo:Devido à intensa seleção de frangos de corte mais pesados e de crescimento mais rápido, distúrbios metabólicos, como problemas esqueléticos, tornaram-se uma preocupação mund... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Associação genômica; Características do fêmur; Integridade óssea; QTLs. |
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Thesagro: |
Fêmur; Formação Óssea; Frango de Corte; Melhoramento Genético Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Bone metabolism; Broiler chickens; Quantitative trait loci. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1093205/1/final8692.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| 1. |  | MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos? Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 2. | | GODOY, T. F.; SILVA, V. H.; TESSMANN, A. L.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Adiponectin receptor 2 gene associated with bone traits in broiler chickens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 39.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 3. | | GODOY, T. F.; SILVA, V. H. da; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; CROOIJAMANS, R. P.; GROENEN, M. A. M.; COUTINHO, L. L. Inherited CNVs in regions related to breast muscle development in a broiler population. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l. : s.n.], 2018. Paper 29816. Organizers: Sébastien Praud and Kellye Eversole. PAG XXVI.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 4. | | FERNANDES, L. T.; GODOY, T. F.; SILVA, V. H.; PANDOLFI, J. R. C.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Sex-specific association of a SNP in the ADIPOR2 gene with carcass traits in a paternal broiler line. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; SILVA, V. H.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification of CNVs on the genome of Brazilian chicken lines. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0646.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of mutations in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 38. ISAFG 2013. AB.31| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of polymorphisms in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 39. ISAFG 2013.AB.32| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | MOREIRA, G. C. M.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D. J.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association studies reveal genomic windows and candidate genes related to fat deposition in chickens. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0647.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 9. | | SILVA, V. H.; PANDOLFI, J. R. C.; GODOY, T. F.; PEIXOTO, J. de O.; TESSMANN, A. L.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Hepatocyte nuclear factor 4 gene associated with bone traits and birth weight in male chickens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 27.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; GHEYAS, A. A.; GASPARIN, G.; PADUAN, M.; ANDRADE, S. C. S.; MONTENEGRO, H.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. SNP and INDEL detection in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. Animal Genetics, v. 6, n. 2, p. 158-163, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 11. | | BOSCHIERO, C.; GHEYAS, A.; GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; GRADE, C. V. C.; GASPARIN, G.; PADUAN, M.; ANDRADE, S. C. da S.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. SNPs and INDELS detection in the chicken myostation gene and its intergenic regions. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 24. ISAFG 2013. AB.17.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | BOSCHIERO, C.; GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; GHEYAS, A. A.; GASPARIN, G.; PADUAN, M.; ANDRADE, S. C. S.; MONTENEGRO, H.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. SNP discovery in a QTL region associated with breast muscle deposition on chicken chromosome 2. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 13. | | MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. Exploring the genetic architecture of feed efficiency traits in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 4622, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; SOLLERO, B. P.; SUREK, D.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Genome-wide association study for femur-related traits in broilers. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 17. | | MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; GODOY, T. F.; TREVISOLI, P. A.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; IBELLI, A. M. G.; MOURA, A. S. M. T.; GARRICK, D.; COUTINHO, L. L. A genome-wide association study reveals novel genomic regions and positional candidate genes for fat deposition in broiler chickens. BMC Genomics, v. 19, n. 374, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 20. | | MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; GODOY, T. F.; PÉRTILLE, F.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T. M.; GARRICK, D. J.; COUTINHO, L. L. Integration of genome wide association studies and whole genome sequencing provides novel insights into fat deposition in chicken. Scientific Reports, v. 8, n. 16222, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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