| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Meio Ambiente. Para informações adicionais entre em contato com cnpma.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
|
Data corrente: |
03/01/2018 |
|
Data da última atualização: |
03/01/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CAVALETT, A.; SILVA, M. A. C. da; TOYOFUKU, T.; MENDES, R.; TAKETANI, R. G.; PEDRINI, J.; FREITAS, R. C. de; SUMIDA, P. Y. G.; YAMANAKA, T.; NAGANO, Y.; PELLIZARI, V. H.; ALVAREZ PEREZ, J. A. LIMA, A. O. S.; KITAZATO, H.; LIMA, A. O. de S. |
|
Afiliação: |
ANGELICA CAVALETT, Univali; MARCUS ADONAI CASTRO DA SILVA, Univali; TAKASHI TOYOFUKU, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology; RODRIGO MENDES, CNPMA; RODRIGO GOUVEA TAKETANI; JESSICA PEDRINI, Univali; ROBERT CARDOSO DE FREITAS, Univali; PAULO YUKIO GOMES SUMIDA, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology; TOSHIRO YAMANAKA, Okayama University; YURIKO NAGANO, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology; VIVIAN HELENA PELLIZARI, IO-USP; JOSE ANGEL ALVAREZ PEREZ, Univali; HIROSHI KITAZATO, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology; ANDRE OLIVEIRA DE SOUZA LIMA, Univali. |
|
Título: |
Dominance of Epsilonproteobacteria associated with a whale fall at a 4204 m depth - South Atlantic Ocean. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Deep Sea Research Part II, v. 146, p. 53-58, 2017. |
|
DOI: |
http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2017.10.012 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The deep ocean is the largest marine environment on Earth and is home to a large reservoir of biodiversity. Within the deep ocean, large organic falls attract a suite of metazoans and microorganisms, which form an important community that, in part, relies on reduced chemical compounds. Here, we describe a deep-sea (4204 m) microbial community associated with sediments collected underneath a whale fall skeleton in the South Atlantic Ocean. Metagenomic analysis of 1 Gb of Illumina HiSeq. 2000 reads, including taxonomic and functional genes, was performed by using the MG-RAST pipeline, SEED, COG and the KEGG database. The results showed that Proteobacteria (79%) was the main phylum represented. The most dominant bacterial class in this phylum was Epsilonproteobacteria (69%), and Sulfurovum sp. NBC37-1 (97%) was the dominant species. Different species of Epsilonproteobacteria have been described in marine and terrestrial environments as important organisms for nutrient cycling. Functional analysis revealed key genes for nitrogen and sulfur cycles, including protein sequences for Sox system (sulfur oxidation) enzymes. These enzymes were mainly those of the Epsilonproteobacteria, indicating their importance for nitrogen and sulfur cycles and the balance of nutrients in this environment. |
|
Palavras-Chave: |
Aquatic bacteria; Bacteria marinha; Marine bacteria. |
|
Thesagro: |
Bactéria; Oceano. |
|
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
|
Marc: |
LEADER 02337naa a2200349 a 4500
001 2084114
005 2018-01-03
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2017.10.012$2DOI
100 1 $aCAVALETT, A.
245 $aDominance of Epsilonproteobacteria associated with a whale fall at a 4204 m depth - South Atlantic Ocean.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aThe deep ocean is the largest marine environment on Earth and is home to a large reservoir of biodiversity. Within the deep ocean, large organic falls attract a suite of metazoans and microorganisms, which form an important community that, in part, relies on reduced chemical compounds. Here, we describe a deep-sea (4204 m) microbial community associated with sediments collected underneath a whale fall skeleton in the South Atlantic Ocean. Metagenomic analysis of 1 Gb of Illumina HiSeq. 2000 reads, including taxonomic and functional genes, was performed by using the MG-RAST pipeline, SEED, COG and the KEGG database. The results showed that Proteobacteria (79%) was the main phylum represented. The most dominant bacterial class in this phylum was Epsilonproteobacteria (69%), and Sulfurovum sp. NBC37-1 (97%) was the dominant species. Different species of Epsilonproteobacteria have been described in marine and terrestrial environments as important organisms for nutrient cycling. Functional analysis revealed key genes for nitrogen and sulfur cycles, including protein sequences for Sox system (sulfur oxidation) enzymes. These enzymes were mainly those of the Epsilonproteobacteria, indicating their importance for nitrogen and sulfur cycles and the balance of nutrients in this environment.
650 $aBactéria
650 $aOceano
653 $aAquatic bacteria
653 $aBacteria marinha
653 $aMarine bacteria
700 1 $aSILVA, M. A. C. da
700 1 $aTOYOFUKU, T.
700 1 $aMENDES, R.
700 1 $aTAKETANI, R. G.
700 1 $aPEDRINI, J.
700 1 $aFREITAS, R. C. de
700 1 $aSUMIDA, P. Y. G.
700 1 $aYAMANAKA, T.
700 1 $aNAGANO, Y.
700 1 $aPELLIZARI, V. H.
700 1 $aALVAREZ PEREZ, J. A. LIMA, A. O. S.
700 1 $aKITAZATO, H.
700 1 $aLIMA, A. O. de S.
773 $tDeep Sea Research Part II$gv. 146, p. 53-58, 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 17 | |
| 2. |  | FONSECA, P. A. S.; LAMOUNIER, P. F.; ROSSE, I. C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Polymorphisms in the regulatory regions of genes regulating lipid metabolism in the mammary gland in Guzerat breed (Bos indicus). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: Sociedade Brasileira de Genética, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|    |
| 3. | | CARVALHO, M. R. S.; STEINBERG, R. S.; ROSSE, I. C.; MIRANDA, M. DE; PEIXOTO, M. G. C. D.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S. An INDEL polymorphism in DGAT1 3'UTR correlates with milk production parameters in Brazilian guzerat dairy breed. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 32., 2010, Edinburgh. Proceedings... Edinburgh: International Society for Animal Genetics, 2010. p. 113.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 4. | | ROSSE, I. C.; STEINBERG, R. S.; SANDES, S. H. C.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; CARVALHO, M. R. S. Investigação e variabilidade genética de polimorfismos no gene da oxitocina bovina em animais da raça Guzerá. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 5. | | FONSECA, P. A. S; ROSSE, I. C.; DEMIRANDA, M.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. S. A new tetra-primer ARMS-PCR for genotyping bovine kappa-casein polymorphisms. Genetics and Molecular Research, v. 12, n. 4, p. 6521-6526, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|  |
| 6. | | FONSECA, P. A. S.; ROSSE, I. C.; LAMOUNIER, P. F.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Desenvolvimento de marcadores moleculares no gene regulador do metabolismo de lipídeos na glândula mamária bovina - PPAR gamma. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 7. | | SOUZA, G. E.; STEINBERG, R. S.; ROSSE, I. C.; FIGUEIREDO, P. O.; PEIXOTO, M. G. C. D.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Variabilidade genética do gene da Prolactina (PRL) na raça Guzerá (Bos indicus). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 8. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. S.; EGITO, A. A. do; STEINBERG, R. S.; BRUNELI, F. A. T.; MACHADO, M. A.; SANTOS, F. C.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S. Genetic diversity and population genetic structure of a Guzerá (Bos indicus) meta-population. Animals, v. 11, 1125, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 9. | | MATOSINHO, C. G. R.; FONSECA, P. A. de S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; ROSSE, I. C.; LOPES, F. C. F.; ZÓZIMO, T.; VERCESI FILHO, A. E.; BRUNELI, F. A. T.; CARVALHO, M. R. S.; GAMA, M. A. S. da. Phenotypic variation in milk fatty acid composition and its association with stearoyl-CoA desaturase 1 (SCD1) gene polymorphisms in Gir cows. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 140, n. 5, p. 532-548, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 10. | | SILVA, M. V. G. B.; ARAÚJO, F.; DRUMMOND, B.; ZERLOTINI, A.; ROSSE, I. C.; LOPES, B. C.; GUEDES, E.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; GUIMARÃES, M. M.; COIMBRA, R. S.; OLIVEIRA, G. C.; VOLPINI, A.; CARVALHO, M. R. Comparative analysis of six genes related to dairy production in Bos taurus and Bos indicus. In: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 11. | | MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; OLIVEIRA, F. S. de; SANTOS, F. G. dos; ARAÚJO, F. M. G.; SALIM, A. C. de M.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; PIRES, D. E. V.; CARVALHO, M. R. S. Identification and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr. Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 6, 524, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 12. | | MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; ASSIS, J. G.; OLIVEIRA, F. S.; ARAUJO, F.; SALIM, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; COIMBRA, R. S.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Identification and functional analysis in silico of polymorphisms in milk protein genes of Guzerá and Gir cattle. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 13. | | FONSECA, P. A. de S.; SANTOS, F. C. dos; ROSSE, I. C.; VENTURA, R. V.; BRUNELI, F. A. T.; PENNA, V. M.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CARVALHO, M. R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D. Retelling the recent evolution of genetic diversity for Guzerá: Inferences from LD decay, runs of homozygosity and Ne over the generations. Livestock Science, v. 193, p. 110-117, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 14. | | FONSECA, P. A. S.; LEAL, T. P.; SANTOS, F. C.; GOUVEIA, M. H.; ID-LAHOUCINE, S.; ROSSE, I. C.; VENTURA, R. V.; BRUNELI, F. A. T.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TARAZONA-SANTOS, E.; CARVALHO, M. R. S. Reducing cryptic relatedness in genomic data sets via a central node exclusion algorithm. Molecular Ecology Resources, v. 18, n. 3, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 15. | | ROSSE, I. C.; ASSIS, J. G.; OLIVEIRA, F. S.; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. S.; GUIMARÃES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Novel polymorphisms in genes associated with milk and meat production and disease resistance in the Guzerá breed identified by whole-genome sequencing. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DE MINAS GERAIS: PESQUISA E PÓS GRADUAÇÃO, 5., 2014, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 74. Engemig 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 16. | | ROSSE, I. C.; OLIVEIRA, F. S.; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI NETO, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Novel polymorphisms in genes associated with milk and meat production and disease resistance in the guzera breed identified by whole-genome sequencing. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DE MINAS GERAIS: PESQUISA E PÓS GRADUAÇÃO, 5., 2014, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Genética, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 17. | | ROSSE, I. C.; ASSIS, J. G.; OLIVEIRA, F. S.; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI NETO, A.; VOLPINI, A.; DOMINITINI, A. J.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; COIMBRA, R. S.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Whole genome sequencing of Guzera cattle reveals genetic variants in candidate genes for production, disease resistance, and heat tolerance. Mammalian Genome, v. 28, n. 1-2, p. 66-80, 2017. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Rui S. Verneque.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite. |
| |
| Registros recuperados : 17 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
