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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Café.
Data corrente:  15/12/2017
Data da última atualização:  15/12/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  FLORES, J. C.; MOFATTO, L. S.; FREITAS-LOPES, R. do L.; FERREIRA, S. S.; ZAMBOLIM, E. M.; CARAZZOLLE, M. F.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T.
Afiliação:  Juan Carlos Florez, BIAGRO/BioCafé/UFV; Luciana Souto Mofatto, Laboratório de Genômica e Expressão/Departamento de Genética/Evolução e Bioagentes/Instituto de Biologia/Universidade Estadual de Campinas; Rejane do Livramento Freitas?Lopes, BIAGRO/BioCafé/UFV; Sávio Siqueira Ferreira, BIAGRO/BioCafé/UFV; Eunize Maciel Zambolim, BIAGRO/BioCafé/UFV; Marcelo Falsarella Carazzolle, Laboratório de Genômica e Expressão/Departamento de Genética/Evolução e Bioagentes/Instituto de Biologia/Universidade Estadual de Campinas; Laércio Zambolim, Departamento de Fitopatologia/Universidade Federal de Viçosa; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC.
Título:  High throughput transcriptome analysis of coffee reveals prehaustorial resistance in response to Hemileia vastatrix infection.
Ano de publicação:  2017
Fonte/Imprenta:  Plant Molecular Biology, v. 95, n. 6, p. 607-623, Dec. 2017.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Coffee rust disease, caused by the fungus Hemileia vastatrix, is one of the major diseases in coffee throughout the world. The use of resistant cultivars is considered to be the most effective control strategy for this disease. To identify candidate genes related to different mechanism defense in coffee, we present a time-course comparative gene expression profile of Caturra (susceptible) and Híbrido de Timor (HdT, resistant) in response to H. vastatrix race XXXIII infection. The main objectives were to obtain a global overview of transcriptome in both interaction, compatible and incompatible, and, specially, analyze up-regulated HdT specific genes with inducible resistant and defense signaling pathways. Using both Coffea canephora as a reference genome and de novo assembly, we obtained 43,159 transcripts. At early infection events (12 and 24 h after infection), HdT responded to the attack of H. vastatrix with a larger number of up-regulated genes than Caturra, which was related to prehaustorial resistance. The genes found in HdT at early hours were involved in receptor-like kinases, response ion fluxes, production of reactive oxygen species, protein phosphorylation, ethylene biosynthesis and callose deposition. We selected 13 up-regulated HdTexclusive genes to validate by real-time qPCR, which most of them confirmed their higher expression in HdT than in Caturra at early stage of infection. These genes have the potential to assist the development of new coffee rust control ... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Biotrophic interaction; Coffee rust.
Thesaurus Nal:  Disease resistance; Transcriptome.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/169114/1/High-throughput-transcriptome-analysis.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Café (CNPCa)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPCa - SAPC1220 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoBARKA, G. D.; CAIXETA, E. T.; FERREIRA, S. S.; ZAMBOLIM, L. In silico guided structural and functional analysis of genes with potential involvement in resistance to coffee leaf rust: A functional marker based approach. Plos One, v. 15, n. 7, e0222747, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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2.Imagem marcado/desmarcadoFLORES, J. C.; MOFATTO, L. S.; FREITAS-LOPES, R. do L.; FERREIRA, S. S.; ZAMBOLIM, E. M.; CARAZZOLLE, M. F.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T. High throughput transcriptome analysis of coffee reveals prehaustorial resistance in response to Hemileia vastatrix infection. Plant Molecular Biology, v. 95, n. 6, p. 607-623, Dec. 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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