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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
20/01/2017 |
Data da última atualização: |
25/01/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
VASCONCELOS, L. M.; BRITO, A. C.; CARMO, C. D.; OLIVEIRA, E. J. de. |
Afiliação: |
L. M. VASCONCELOS, UFRB; A. C. BRITO; C. D. CARMO, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
Título: |
Polymorphism of starch pathway genes in cassava. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n.4,[2016?]. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The distribution and frequency of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can help to understand changes associated with characteristics of interest. We aimed to evaluate nucleotide diversity in six genes involved in starch biosynthesis in cassava using a panel of 96 unrelated accessions. The genes were sequenced, aligned, and used to obtain values for nucleotide diversity (?), segregating sites (?), Tajima?s D test, and neighbor-joining (NJ) clustering. On average, one SNP per 147 and 171 bp was identified in exon and intron regions, respectively. Thirteen heterozygous loci were found. Three of seven SNPs in the exon region resulted in non-synonymous replacement or four synonymous substitutions. However, no associations were noted between SNPs and root dry-matter content. The parameter ? ranged from 0.0001 (granule bound starch synthase I) to 0.0033 (?-amylase), averaging 0.0011, while ? ranged from 0.00014 (starch branching enzyme) to 0.00584 (starch synthase I), averaging 0.002353. The diversity value was typically double that of the ?. Results of the D test did not suggest any evidence of deviance of neutrality in these genes. Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch for the use of polymorphisms for selection purposes. MenosThe distribution and frequency of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can help to understand changes associated with characteristics of interest. We aimed to evaluate nucleotide diversity in six genes involved in starch biosynthesis in cassava using a panel of 96 unrelated accessions. The genes were sequenced, aligned, and used to obtain values for nucleotide diversity (?), segregating sites (?), Tajima?s D test, and neighbor-joining (NJ) clustering. On average, one SNP per 147 and 171 bp was identified in exon and intron regions, respectively. Thirteen heterozygous loci were found. Three of seven SNPs in the exon region resulted in non-synonymous replacement or four synonymous substitutions. However, no associations were noted between SNPs and root dry-matter content. The parameter ? ranged from 0.0001 (granule bound starch synthase I) to 0.0033 (?-amylase), averaging 0.0011, while ? ranged from 0.00014 (starch branching enzyme) to 0.00584 (starch synthase I), averaging 0.002353. The diversity value was typically double that of the ?. Results of the D test did not suggest any evidence of deviance of neutrality in these genes. Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch fo... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Mandioca. |
Thesaurus Nal: |
Cassava. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 15 | |
1. |  | NOVAES, A. F. G.; CASTRO, F. de F. A. de; COMINATO, V.; PAVEL, L. D.; CARVALHO, G. R.; GUIMARÃES, A. S.; SILVA, M. R.; SOUZA, G. N. de. Desafios sanitários a serem superados pela cadeia produtiva do leite que impactam na competitividade, qualidade dos produtos lácteos e saúde do consumidor. In: COSTA, F. F.; HÚNGARO, H. M.; SILVA, J. P. S. S. da; RODARTE, M. P.; SILVA, P. H. D. da (org.). Gestão, qualidade e inovações tecnológicas: produções acadêmicas em ciência e tecnologia do leite e derivados. Juiz de Fora: Editar, 2024. v. 2. p. 149-165.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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2. |  | COMINATO, V.; GOMES, A. F. N.; CASTRO, F. de F. A. de; RIBEIRO, J. B.; SOUZA, G. N. de; TEODORO, V. A. M. Moléculas de antimicrobianos indicados para bovinos no Brasil de acordo com a categorização da Organização Mundial de Saúde Animal. In: CONGRESSO NACIONAL DE LATICINIOS, 36., 2023, Juiz de Fora. Anais. Belo Horizonte: Epamig, 2023. p. 127-128.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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3. |  | GOMES, A. F. N.; COMINATO, V.; CASTRO, F. de F. A. de; LANGE, C. C.; GUIMARÃES, A. S.; SOUZA, G. N. de. Identificação e perfil fenotípico de sensibilidade aos antimicrobianos de patógenos causadores de mastite subclínica em um rebanho mantido em Compost Barn. In: ENCONTRO NACIONAL DA REDE EM PESQUISA E INOVAÇÃO EM SANIDADE E PECUÁRIA LEITEIRA, 1., 2023, Lavras. Anais do evento. Lavras: Universidade Federal de Lavras, 2023.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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4. |  | GOMES, A. F. N.; COMINATO, V.; CASTRO, F. de F. A. de; GUIMARÃES, A. S.; LANGE, C. C.; SOUZA, G. N. de. Perfil fenotípico de sensibilidade aos antimicrobianos de patógenos causadores de mastite subclínica em um rebanho mantido em Compost Barn. In: CONGRESSO NACIONAL DE LATICINIOS, 36., 2023, Juiz de Fora. Anais. Belo Horizonte: Epamig, 2023. p. 134-135.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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5. |  | BENEDITO JUNIOR, H. dos S.; COMINATO, V.; VICENTINI, N. M.; SILVA, M. R.; COSTA, R. G. B.; PAULA, J. C. J. de; MOREIRA, G. de M. M.; SOBRAL, D.; MIGUEL, E. M.; TEODORO, V. A. M. Associação entre as condições higiênico-sanitárias de indústrias de laticínios e o nível de adequação na implementação de programas de autocontrole. In: COSTA, F. F.; HÚNGARO, H. M.; RODARTE, M. P. (org.). Gestão, qualidade e inovações tecnológicas: produções acadêmicas em ciência e tecnologia do leite e derivados. Juiz de Fora: Editar, 2023. v. 1. p. 31-47.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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6. |  | COMINATO, V.; GUIMARÃES, F. R.; NOVAES, A. F. G.; CASTRO, F. de F. A. de; PAVEL, L. D.; RIBEIRO, J. B.; GUIMARÃES, A. S.; SILVA, M. R.; TEODORO, V. A. M.; CORREA, K. de P.; SOUZA, G. N. de. Classes e moléculas dos antimicrobianos usados no tratamento da mastite bovina no Brasil e seu grau de importância de acordo com a Organização Mundial de Saúde Animal. In: COSTA, F. F.; HÚNGARO, H. M.; SILVA, J. P. S. S. da; RODARTE, M. P.; SILVA, P. H. D. da (org.). Gestão, qualidade e inovações tecnológicas: produções acadêmicas em ciência e tecnologia do leite e derivados. Juiz de Fora: Editar, 2024. v. 2. p. 167-184.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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7. |  | SOARES, G. O.; CAIRO, F. C.; RIBEIRO, A. K. do C.; ALBUQUERQUE, B. S. P.; PEREIRA, B. P.; PAIXÃO, R. Q. da; COMINATO, V.; CAMPOS, M. M.; PEREIRA, L. G. R.; TOMICH, T. R.; MACHADO, F. S. Consumo e comportamento alimentar de novilhas leiteiras em estro. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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8. |  | RIBEIRO, A. K. do C.; CAIRO, F. C.; ALBUQUERQUE, B. S. F.; SOARES, G. O.; COMINATO. V.; PEREIRA, B. P.; PAIXÃO, R. Q. da; MACHADO, F. S.; PEREIRA, L. G. R.; TOMICH, T. R.; CAMPOS, M. M. Detecção de estro através de sistema de cochos e bebedouros eletrônicos em novilhas leiteiras. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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9. |  | COMINATO, V.; NOGUEIRA, M. A. de C.; CARNEIRO, H.; RIBEIRO, J. B.; MOURA, A. M.; SILVA, G. A. da; MACHADO, F. S.; PEREIRA, L. G. R.; CAMPOS, M. M.; TOMICH, T. R. Efeito de aditivo microbiano sobre o aproveitamento ruminal de volumosos à base de cana-de-açúcar. In: PASSOS, L. P. (ed.). Coletânea de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite-PIBIC CNPq 2020-2021. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 262).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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10. |  | SOUZA, L. A. de; BOTTEON, R. de C. C. M.; LEOPOLDINO, B. L.; ALBUQUERQUE, B. S. F.; RIBEIRO, A. K. do C.; COMINATO, V.; SOARES, G. O.; CAMPOS, M. M. Naturally acquired diarrhea in calves from birth to 25 days of age: incidence, clinical Signs, and response to treatment. Acta Veterinaria Brasilica, v. 17, p. 36-43, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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11. |  | LOBATO, E. M. G. B.; COMINATO, V.; SOBRAL, D.; SILVA, M. R.; PINTO, M. S.; MIGUEL, E. M.; COSTA, R. G. B.; PAULA, J. C. J. de; MOREIRA, G. de M. M.; TEODORO, V. A. M. Implementação de programas de qualidade versus condições microbiológicas de veículos transportadores e do comércio varejista de leite e derivados. In: COSTA, F. F.; HÚNGARO, H. M.; RODARTE, M. P. (org.). Gestão, qualidade e inovações tecnológicas: produções acadêmicas em ciência e tecnologia do leite e derivados. Juiz de Fora: Editar, 2023. v. 1. p. 11-29.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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12. |  | PAIXÃO, R. Q. da; TEIXEIRA, V. A.; PEREIRA, B. P.; RIBEIRO, A. K. do C.; ALBUQUERQUE, B. S. F.; SOARES, G. O.; COMINATO, V.; CAMPOS, M. M.; TOMICH, T. R.; SILVA, M. V. G. B.; PEREIRA, L. G. R. Qualidade do sêmen de touros Girolando de diferentes composições genéticas e sua correlação com a termografia infravermelho. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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13. |  | ALBUQUERQUE, B. S. F.; DINIZ NETO, H. do C.; LOMBARDI, M. C.; PEREIRA, B. P.; COMINATO, V.; RIBEIRO, A. K. do C.; SOARES, G. O.; PAIXÃO, R.; COELHO, S. G.; PEREIRA, L. G. R.; TOMICH, T. R.; CARVALHO, W. A.; MACHADO, F. S.; CAMPOS, M. M. Efeitos da vacinação contra brucelose e clostridioses sobre a resposta imune de bezerras leiteiras. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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14. |  | PEREIRA, B. P.; DINIZ NETO, H. do C.; LOMBARDI, M. C.; ALBUQUERQUE, B. S. F.; COMINATO, V.; RIBEIRO, A. K. do C.; SOARES, G. O.; PAIXÃO, R. Q.; COELHO, S. G.; PEREIRA, L. G. R.; TOMICH, T. R.; CARVALHO, W. A.; MACHADO, F. S.; CAMPOS, M. M. Efeitos da vacinação simultânea ou não contra brucelose e clostridioses sobre a temperatura corporal e local de bezerras leiteiras. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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15. |  | COMINATO, V.; ALBUQUERQUE, B. S. F.; PEREIRA, B. P.; RIBEIRO, A. K. do C.; SOARES, G. O.; PAIXÃO, R.; MAIA, G. G.; SIQUEIRA, L. G. B.; CAMARGO, L. S. de A.; PEREIRA, L. G. R.; CAMPOS, M. M.; TOMICH, T. R. Efeitos do estresse térmico na atividade da ruminação e na degradabilidade ruminal in situ em vacas leiteiras. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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