| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|
Data corrente: |
23/03/2016 |
|
Data da última atualização: |
17/06/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
COTTA, M. G.; MARRACCINI, P.; THIS, D.; LEROY, T.; BOCS, S.; DROC, G.; DUFAYARD, J. F.; DEREEPER, A.; LASHERMES, P.; ANDRADE, A. C. |
|
Afiliação: |
M. G. COTTA, UFLA; P. MARRACCINI, CIRAD UMR AGAP; D. THIS, CIRAD UMR AGAP; T. LEROY, CIRAD UMR AGAP; S. BOCS, CIRAD UMR AGAP; G. DROC, CIRAD UMR AGAP; J. F. DUFAYARD, CIRAD UMR AGAP; A. DEREEPER, IRD UMR RPM; P. LASHERMES, IRD UMR RPM; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN. |
|
Título: |
Molecular mechanisms in the first step of ABA-mediated response to drought in Coffea canephora clones. |
|
Ano de publicação: |
2015 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-50. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Global climate changes are becoming more unpredictable and abiotic stress, such as drought and high temperatures, are key factors that affect coffee plant development and production. Although the strategies for drought adaptation in perennial plants are complex, there is genetic variability within the Coffea genus that could be used to increase tolerance. Drought tolerant clones of Coffea canephora have been characterized as vigorous plants with high productivity throughout years under water deficit. Recently, novel intracellular ABA receptors (PYL/RCARs) involved in sensing and signaling of this hormone were identified. A mechanism of ABA transduction was proposed, involving PYR/PYL/RCARs receptors interacting with PP2Cs phosphatases and SnRK2 protein kinases. The goal of this study was to identify and characterize orthologous genes of this tripartite system in C. canephora. For this purpose, protein sequences from Arabidopsis, citrus, rice, grape, and tomato were chosen as query to search orthologous genes in sequence databases. This approach allowed the identification and characterization of 24 candidate genes (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs and 9 SnRK2s) in C. canephora genome. The protein domains identified in the predicted coffee sequences enabled to characterize these genes as family?s members of receptors (PYR/PYL/ RCAR), phosphatases (PP2Cs) or kinases (SnRK2) of ABA response pathway. Phylogenetic analysis allowed the classification of coffee-polypeptide sequences between subclasses and subfamilies. The gene structures of these three gene families were functionally annotated in Coffee Genome Hub (http://coffee-genome.org/). Tissue (leaf, seed, root and floral organ) differential expression was verified through in silico analyses. Regarding drought conditions, data from root transcriptome showed contrasting gene expression for those genes between the tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) and susceptible (Cc22) clones of C. canephora. By comparing gene expression profiles of only drought tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) clones, differential responses were observed suggesting the existence of multiple biological mechanisms for drought tolerance in coffee. All those evidences will help to identify the genetic determinism of drought tolerance essential to obtain molecular markers that could be used in coffee breeding programs. MenosGlobal climate changes are becoming more unpredictable and abiotic stress, such as drought and high temperatures, are key factors that affect coffee plant development and production. Although the strategies for drought adaptation in perennial plants are complex, there is genetic variability within the Coffea genus that could be used to increase tolerance. Drought tolerant clones of Coffea canephora have been characterized as vigorous plants with high productivity throughout years under water deficit. Recently, novel intracellular ABA receptors (PYL/RCARs) involved in sensing and signaling of this hormone were identified. A mechanism of ABA transduction was proposed, involving PYR/PYL/RCARs receptors interacting with PP2Cs phosphatases and SnRK2 protein kinases. The goal of this study was to identify and characterize orthologous genes of this tripartite system in C. canephora. For this purpose, protein sequences from Arabidopsis, citrus, rice, grape, and tomato were chosen as query to search orthologous genes in sequence databases. This approach allowed the identification and characterization of 24 candidate genes (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs and 9 SnRK2s) in C. canephora genome. The protein domains identified in the predicted coffee sequences enabled to characterize these genes as family?s members of receptors (PYR/PYL/ RCAR), phosphatases (PP2Cs) or kinases (SnRK2) of ABA response pathway. Phylogenetic analysis allowed the classification of coffee-polypeptide sequences between subc... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Coffee. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 03092nam a2200229 a 4500
001 2041744
005 2024-06-17
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCOTTA, M. G.
245 $aMolecular mechanisms in the first step of ABA-mediated response to drought in Coffea canephora clones.$h[electronic resource]
260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-50.$c2015
520 $aGlobal climate changes are becoming more unpredictable and abiotic stress, such as drought and high temperatures, are key factors that affect coffee plant development and production. Although the strategies for drought adaptation in perennial plants are complex, there is genetic variability within the Coffea genus that could be used to increase tolerance. Drought tolerant clones of Coffea canephora have been characterized as vigorous plants with high productivity throughout years under water deficit. Recently, novel intracellular ABA receptors (PYL/RCARs) involved in sensing and signaling of this hormone were identified. A mechanism of ABA transduction was proposed, involving PYR/PYL/RCARs receptors interacting with PP2Cs phosphatases and SnRK2 protein kinases. The goal of this study was to identify and characterize orthologous genes of this tripartite system in C. canephora. For this purpose, protein sequences from Arabidopsis, citrus, rice, grape, and tomato were chosen as query to search orthologous genes in sequence databases. This approach allowed the identification and characterization of 24 candidate genes (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs and 9 SnRK2s) in C. canephora genome. The protein domains identified in the predicted coffee sequences enabled to characterize these genes as family?s members of receptors (PYR/PYL/ RCAR), phosphatases (PP2Cs) or kinases (SnRK2) of ABA response pathway. Phylogenetic analysis allowed the classification of coffee-polypeptide sequences between subclasses and subfamilies. The gene structures of these three gene families were functionally annotated in Coffee Genome Hub (http://coffee-genome.org/). Tissue (leaf, seed, root and floral organ) differential expression was verified through in silico analyses. Regarding drought conditions, data from root transcriptome showed contrasting gene expression for those genes between the tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) and susceptible (Cc22) clones of C. canephora. By comparing gene expression profiles of only drought tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) clones, differential responses were observed suggesting the existence of multiple biological mechanisms for drought tolerance in coffee. All those evidences will help to identify the genetic determinism of drought tolerance essential to obtain molecular markers that could be used in coffee breeding programs.
653 $aCoffee
700 1 $aMARRACCINI, P.
700 1 $aTHIS, D.
700 1 $aLEROY, T.
700 1 $aBOCS, S.
700 1 $aDROC, G.
700 1 $aDUFAYARD, J. F.
700 1 $aDEREEPER, A.
700 1 $aLASHERMES, P.
700 1 $aANDRADE, A. C.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 18 | |
| 1. |  | AMORIM, A. C. L.; NOGUEIRA, R. C.; LAMEIRA, O. A. Organogênese in vitro de erva de jabuti (Peperomia (L.). H.B.K.). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 260-261.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|    |
| 5. | | ROSAL, L. F.; LAMEIRA, O. A.; RODRIGUES, S. T.; AMORIM, A. C. L.; SILVEIRA, D. H. R. Coleta, avaliação e caracterização de plantas medicinais do horto da Embrapa Amazônia Oriental. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 53-55.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 6. | | SILVEIRA, D. H. R.; LAMEIRA, O. A.; AMORIM, A. C. L.; ROSAL, L. F.; TAVARES, S. R. Avaliação, caracterização e manipulação de plantas medicinais do horto da Embrapa Amazônia Oriental. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 374.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 7. | | AMORIM, A. C. L.; LAMEIRA, O. A.; ALVES, S. de M.; ROSAL, L. F.; SILVEIRA, D. H. R. Análise fitoquímica de cinco espécies vegetais do horto de plantas medicinais da Embrapa Amazônia Oriental. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 316-318.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 8. | | NOGUEIRA, R. C.; LAMEIRA, O. A.; LOPES, S. da C.; MENEZES, I. C. de; AMORIM, A. C. L. Micropropagação de mogno a partir de segmento caulinar (Swietenia macrophylla King). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 79-81.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 9. | | ROSAL, L. F.; LAMEIRA, O. A.; RODRIGUES, S. T.; AMORIM, A. C. L.; TRINDADE, M. J. de S.; BERG, M. E. V. den. Coleta, avaliação e caracterização de plantas medicinais de ocorrência na Amazônia. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FCAP, 9.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 3., 1999, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP: Embrapa Amazônia Oriental, 1999. p. 357-358.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 10. | | LAMEIRA, O. A.; RODRIGUES, S. T.; ROSAL, L. F.; AMORIM, A. C. L.; SILVEIRA, D. H. R.; PINTO, J. E. B. P. Avaliação e caracterização de plantas medicinais de ocorrência na Amazônia. Horticultura Brasileira, v. 18, p. 907-908, jul. 2000. Suplemento. Trabalhos e palestras apresentados no 40º. Congresso Brasileiro de Olericultura; 2º Congresso Ibero-Americamo sobre Utilização de Plástico na Agricultura; 1º Simpósio Latino-Americano de Produção de Plantas Medicinais, Aromáticas e...| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 11. | | LAMEIRA, O. A.; AMORIM, A. C. L.; ROSAL, L. F.; SILVEIRA, D. H. R.; ALVES, S. de M.; PINTO, J. E. B. P. Análise fitoquímica de cinco espécies vegetais do horto de plantas medicinais da Embrapa Amazônia Oriental. In: SIMPÓSIO DE PLANTAS MEDICINAIS DO BRASIL, 16., 2000, Recife. Livro de resumos. Recife: UFPe, 2000. p. 144.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 12. | | ARRUDA, N. P.; PEREIRA, E. J.; HOVELL, A. M. C.; AMORIM, A. C. L.; COURY, S. M.; BIZZO, H. R.; REZENDE, C. M. Differentiation between arabica and robusta brazilian coffees using HS-SPME and SDE gas chromatography-mass spectrometry and principal component analysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. Programme. Abstracts. Lausanne: Association for Science and Information on Coffee, 2008. p. 123, PC754.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
| |
| 13. | | LACERDA, J. J. de J.; FURTINI NETO, A. E.; RESENDE, A. V. de; HICKMANN, C.; AMORIM, A. C.; CARVALHO, V. G. Resposta da soja a variações na adubação de plantio e cobertura potássica na região dos Campos das Vertentes, Minas Gerais. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2012. 1 CD-ROM. Fertbio 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 14. | | ANDRÉ, A. da C.; S. JÚNIOR, H. M.; GARRETT, R.; AMORIM, A. C. L.; BIZZO, H. R.; HOVELL, A. M. C.; REZENDE, C. M. Chemotypes of Eugenia uniflora and antinociceptive activity. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ESPECTROMETRIA DE MASSAS, 4., 2011, Campinas. Pôsteres. Campinas: Sociedade Brasileira de Espectrometria de Massas, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
| |
| 15. | | TRINDADE, M. J. de S.; RODRIGUES, S. T.; LAMEIRA, O. A.; BERG, M. E. van den; MENEZES, I. C. de; ROSAL, L. F.; AMORIM, A. C. L. Plantas medicinais aromáticas e toxicas do horto da Embrapa Amazônia Oriental usadas pelas comunidades de Marudá, Bacuriteua, Augusto Correa e Bragança (Belém-PA): diversidade e uso. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 321-322.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 16. | | TRINDADE, M. J. de S.; RODRIGUES, S. T.; BERG, M. E. van den; LAMEIRA, O. A.; AMORIM, A. C. L.; ROSAL, L. F. Plantas medicinais aromáticas e tóxicas do horto da Embrapa Amazônia Oriental usadas pelas comunidades de Marudá, Bacuriteua, Augusto-Corrêia e Bragança (Belém-PA): diversidade e usos. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 51., 2000, Brasília, DF. Resumos. Brasília, DF: SBB, 2000. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 17. | | AMORIM, A. C. L.; HOVELL, A. M. C.; PINTO, A. C.; EBERLIN, M. N.; ARRUDA, N. P.; PEREIRA, E. J.; BIZZO, H. R.; CATHARINO, R. R.; MORAIS FILHO, Z. B.; REZENDE, C. M. Green and roasted arabica coffees differentiated by ripeness, process and cup quality via electrospray ionization mass spectrometry fingerprinting. Journal of the Brazilian Chemical Society, São Paulo, v. 20, n. 2, p. 313-321, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
| |
| 18. | | TEIXEIRA, N. de C.; QUEIROZ, V. A. V.; ROCHA, M. C.; AMORIM, A. C. P.; SOARES, T. A.; MONTEIRO, M. A. M.; MENEZES, C. B. de; SCHAFFERT, R. E.; GARCIA, M. A. V. T.; JUNQUEIRA, R. G. Resistant starch content among several sorghum (Sorghum bicolor) genotypes and the effect of heat treatment on resistant starch retention in two genotypes. Food Chemistry, Essex, v. 197, p. 291-296, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|  |
| Registros recuperados : 18 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
