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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
02/12/2015 |
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Data da última atualização: |
15/04/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FREITAS, M. S. de; FREITAS, L. S.; WEBER, T.; YAMAKI, M; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
MARCELO SILVA DE FREITAS, BRF; LUCIANA SALLES FREITAS, BRF; BRF; BRF; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Comparison of iterated single-step and Bayesian regressions on genomic evaluations for age at 100 kg in swine. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Science, v. 93, n. 10, p. 4675-4683, 2015. |
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DOI: |
10.2527/jas.2014-8842 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The effects of modified single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP) iterations on GEBV and SNP were investigated using 85,388 age at 100 kg phenotypes from the BRF SA breeding program Landrace pure line animals, off-tested between 2002 and 2013. Pedigree data comprised animals born between 1999 and 2013. A total of 1,068 animals were assigned to the training population, in which all of them had genotypes, original and corrected age at 100 kg phenotypes, and weighted deregressed proof records. A total of 100 genotyped animals, with high accuracy age at 100 kg estimated breeding values, were assigned to the validation population. After applying the quality control workflow, a set of 41,042 SNP was used for the analysis. Standard and modified ssGBLUP, BayesC?, and Bayesian Lasso were compared, and their predictive abilities were accessed by approximate true and GEBV correlations. Modified ssGBLUP iteration effects on SNP estimates and GEBV were relevant, in which assigned differential weights and shrinkage caused important losses on ssGBLUP predictive ability for age at 100 kg GEBV. Even though ssGBLUP accuracy can be equal or better than the compared Bayesian methods, additional gains can be obtained by correctly identifying the number of iterations required for best ssGBLUP performance. |
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Thesagro: |
Melhoramento genético animal; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Molecular genetics; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02100naa a2200253 a 4500
001 2030401
005 2019-04-15
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024 7 $a10.2527/jas.2014-8842$2DOI
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245 $aComparison of iterated single-step and Bayesian regressions on genomic evaluations for age at 100 kg in swine.$h[electronic resource]
260 $c2015
520 $aAbstract: The effects of modified single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP) iterations on GEBV and SNP were investigated using 85,388 age at 100 kg phenotypes from the BRF SA breeding program Landrace pure line animals, off-tested between 2002 and 2013. Pedigree data comprised animals born between 1999 and 2013. A total of 1,068 animals were assigned to the training population, in which all of them had genotypes, original and corrected age at 100 kg phenotypes, and weighted deregressed proof records. A total of 100 genotyped animals, with high accuracy age at 100 kg estimated breeding values, were assigned to the validation population. After applying the quality control workflow, a set of 41,042 SNP was used for the analysis. Standard and modified ssGBLUP, BayesC?, and Bayesian Lasso were compared, and their predictive abilities were accessed by approximate true and GEBV correlations. Modified ssGBLUP iteration effects on SNP estimates and GEBV were relevant, in which assigned differential weights and shrinkage caused important losses on ssGBLUP predictive ability for age at 100 kg GEBV. Even though ssGBLUP accuracy can be equal or better than the compared Bayesian methods, additional gains can be obtained by correctly identifying the number of iterations required for best ssGBLUP performance.
650 $aMolecular genetics
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700 1 $aLEDUR, M. C.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 2. |  | ROSA, E. P. de A.; SARMENTO, C. M. B.; VEIGA, J. B. da. Avaliação de pastagem em propriedades familiares na zona Bragantina. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FCAP, 11.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL (AVALIAÇÃO-2001), 5., 2001, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP: Embrapa Amazônia Oriental, 2002. p. 108-110.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | ROSA, E. P. de A.; SARMENTO, C. M. B.; VEIGA, J. B. da. Introdução do gado e de pastagem no sistema cultivo/pousio existente: o desempenho da pastagem. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA FCAP, 10.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2000, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 2000. p. 97-99.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | FERREIRA, A. R.; YARED, J. A. G.; BRIENZA JUNIOR, S.; SANTOS, I. A. dos; ROSA, E. P. de A. Enriquecimento de floresta secundária para melhoria de um sistema agroflorestal sequencial no Nordeste paraense: avaliação de espécies nativas. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 54.; REUNIÃO AMAZÔNICA DE BOTÂNICA, 3., 2003, Belém, PA. Botânica: desafios da botânica brasileira no novo milênio: inventário, sistematização, conservação e uso da diversidade vegetal: resumos. Belém, PA: Sociedade Botânica do Brasil: UFRA: Museu Paraense Emílio Goeldi: Embrapa Amazônia Oriental, 2003. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | LOPEZ, C. V. da C.; BRIENZA JUNIOR, S.; LEÃO, N. V. M.; FERREIRA, A. R.; ROSA, E. P. de A.; SANTOS, I. A. dos. Fenologia de espécies da floresta secundária potencialmente acumuladoras de fósforo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS, 4., 2002, Ilhéus. Anais. Ilhéus: CEPLAC-CEPEC, 2002. Resumo expandido 1-040.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | FERREIRA, A. R.; BRIENZA JUNIOR, S.; ROSA, E. P. de A.; LÓPEZ, C. V. da C.; SANTOS, I. A. dos; YARED, J. A. G.; PEREIRA, C. A. Germinação, sobrevivência e crescimento em altura de Acacia mangium Willd. e Inga edulis num sistema agroflorestal de derruba e queima na Amazônia Oriental. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS, 4., 2002, Ilhéus. Resumos expandidos. IIhéus: CEPLAC-CEPEC, 2002. 4 f. Cópia de trabalho editado em CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 7. | | ROSA, E. P. de A.; BRIENZA JUNIOR, S.; SANTOS, I. A. dos; LOPEZ, C. V. da C.; FERREIRA, A. R.; YARED, J. A. G. Avaliações iniciais do crescimento e sobrevivência de espécies nativas para a melhoria de um sistema agroflorestal seqüencial no nordeste paraense. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS, 4., 2002, Ilhéus, BA. Resumo expandido. Ilhéus: CEPLAC-CEPEC, 2002.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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