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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
17/11/2015 |
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Data da última atualização: |
31/07/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROCHA, C. M. L.; VELLICCE, G. R.; GARCÍA, M. G.; PARDO, E. M.; RACEDO, J.; PERERA, M. F.; LUCÍA, A. de; GILLI, J.; BOGADO, N.; BONNECARRÈRE, V.; GERMAN, S.; MARCELINO, F.; LEDESMA, F.; REZNIKOV, S.; PLOPER, L. D.; WELIN, B.; CASTAGNARO, A. P. |
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Afiliação: |
CARLA MARIA LOURDES ROCHA, ITA - NOA; GABRIEL RICARDO VELLICCE, ITA - NOA; MARÍA GABRIELA GARCÍA, ITA - NOA; ESTEBAN MARIANO PARDO, ITA - NOA; JOSEFINA RACEDO, ITA - NOA; MARÍA FRANCISCA PERERA, ITA - NOA; ADRIAN DE LUCÍA, INTA; JAVIER GILLI, INTA; NOELIA BOGADO, IPTA; VICTORIA BONNECARRÈRE, INIA; SILVIA GERMAN, INIA; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; FERNANDO LEDESMA A ,, ITA - NOA; SEBASTIÁN REZNIKOV, ITA - NOA; LEONARDO DANIEL PLOPER, ITA - NOA; BJORN WELIN, ITA - NOA; ATILIO PEDRO CASTAGNARO, ITA- NOA. |
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Título: |
Use of AFLP markers to estimate molecular diversity of Phakopsora pachyrhizi. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Electronic Journal of Biotechnology, v. 18, n. 6, p. 439-444, 2015. |
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ISSN: |
0717-3458 |
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DOI: |
10.1016/j.ejbt.2015.06.007 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919 markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and potent molecular tool for the study of genetic diversity and could be useful to carry out wider genetic diversity studies. MenosBackground: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919 markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and pot... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Ferrugem asiática da soja. |
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Thesagro: |
Doença de planta; Ferrugem; Fungo; Phakopsora pachyrhizi; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Microbial growth; Plant diseases and disorders; Soybean rust. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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005 2017-07-31
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520 $aBackground: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919 markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and potent molecular tool for the study of genetic diversity and could be useful to carry out wider genetic diversity studies.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| 1. |  | ALMEIDA, F. T. de; FIGUEIREDO NETO, A.; SANTOS, C. A. F.; COSTA, M. S.; COELHO, B. S.; LIMA NETO, I. da S.; ARAGÃO, C. A.; SILVA, A. P. da. Qualidade pós-colheita de bulbos de cebola população Botucatu produzidos no Semiárido brasileiro e armazenados sob temperatura ambiente. Research Society and Development, v. 10, n. 4, e19410413592, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 2. | | BABUJIA, L. C.; SILVA, A. P. da; GARCIA, J. C.; NOGUEIRA, M. A.; VISENTAINER, J. V.; HUNGRIA, M. Bioindicadores de qualidade do solo na avaliação da sustentabilidade em agroecossistemas com cana-de-açúcar. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 1001-1. Disponível em: <http://www.sigeventos.com.br/sbmicrobiologia/cdrom/>.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 3. | | BABUJIA, L.; KASCHUK, G.; SILVA, A. P. da; MATSUMOTO, L. S.; RIBEIRO, R. A.; FRANCHINI, J. C.; HUNGRIA, M. Relação entre os diferentes sistemas de manejo e profundidades na atividade microbiana do solo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 4 p. Trab. 335. 1 CD-ROM. FERTBIO 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | BARROS, A. T. S.; COSTA, J. da A.; SILVA, J. R.; SILVA, A. P. da; DIAS, R. de C. S. Caracterização por descritores morfológicos e avaliação físico-química de frutos de acessos de melão. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 10., 2015, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. p. 311-316. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 264).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 5. | | BEUTLER, A. N.; CENTURION, J. F.; SILVA, A. P. da; CENTURION, M. A. P. da C.; LEONEL, C. L.; FREDDI, O. da S. Soil compaction by machine traffic and least limiting water range related to soybean yield. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 11, p. 1591-1600, nov. 2008. Título em português: Compactação do solo por tráfego de máquinas e intervalo hídrico ótimo na produtividade de soja.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | BEUTLER, A. N.; CENTURION, J. F.; SILVA, A. P. da; ROQUE, C. G.; FERRAZ, M. V. Compactação do solo e intervalo hídrico ótimo na produtividade de arroz de sequeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 6, p. 575-580, junho 2004 Título em inglês: Soil compaction and least limiting water range in dryland rice yield.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | CARMO, I. L. G. da S.; AROUCHE, D. S.; SILVA, A. P. da; SILVA, E. S. da; MEDEIROS, R. D. de; PORTO, D. S. Avaliação da qualidade de frutos da melancia em consórcio com mandioca produzida no Município de Boa vista, RR. In: SEMANA TECNOLÓGICA DO CAMPUS DE MURUPU. 3., 2014, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: Eagro/UFRR, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 9. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, A. P. da; SILVA, E. S. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; EVALD, A.; MEDEIROS, R. D. de. Produção de melancia adubada com diferentes doses de Ribumin@ no cerrado de Roraima. In: SEMANA TECNOLÓGICA DO CAMPUS DE MURUPU. 3., 2014, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: Eagro/UFRR, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, E. S. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; BARRETO, G. F.; SILVA, A. P. da; MEDEIROS, R. D. de. Milho em consórcio com cedro e castanheira em sistemas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 11. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, E. S. da; SILVA, A. P. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; NASCIMENTO, F. R. do; MEDEIROS, R. D. de. Produção de melancia adubada com fósforo e potássio na Savana de Roraima. In: SEMANA TECNOLÓGICA DO CAMPUS DE MURUPU. 3., 2014, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: Eagro/UFRR, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | CHAVES, R. O.; TOGNI, M.; COPAT, B.; FERANTI, J. P. S.; SILVA, A. P. da; FRANÇA, R. T.; FIGHERA, R. A.; MAZZANTI, A. Doenças neurológicas em gatos: 155 casos. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 1, p. 107-112, janeiro 2018. Título em inglês: Neurological diseases in cats: 155 cases.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | CONSALTER, A.; SILVA, A. P. da; GAIA, V. G.; ZANELLA, E. L.; SOUZA, G. N. de; FERREIRA, A. M. R. Seroprevalence and risk factors associated with Neospora caninum in commercial sheep from northwest of Rio Grande do Sul, Brazil. Semina. Ciências Agrárias, v. 41, n. 2, p. 705-710, mar./abr. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 14. | | CORREIA, J. de S.; RIBEIRO, R. A. M.; RIBEIRO, L. de S.; SILVA, A. P. da; ARAGÃO, C. A.; DANTAS, B. F. Curva de embebição de semente de catingueira (Caesalpinia pyramidalis TUL.). In: REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 27., 2004, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido; UNEB, 2004. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | CORREIA, J. de S.; RIBEIRO, R. A. M.; RIBEIRO, L. de S.; SILVA, A. P. da; ARAGÃO, C. A.; DANTAS, B. F. Curva de emergência de sementes de mororó [Bauhinia cheilantha (Bong) Stendd]. In: REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 27., 2004, Petrolina. Anais... Petrolina: SBB; Embrapa Semi-Árido; UNEB, 2004. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | COSTA, P. da; COSTA, J. R. da; SILVA, A. P. da; CAVALCANTE, A. C. R.; WANDELLI, E. V.; TAVARES, E. D.; BIANCHINI, F.; BELTRAO, S. L. L. Poverty and development. In: COSTA, P. da; COSTA, J. R. da; WANDELLI, E. V.; BIANCHINI, F.; TAVARES, E. D. (Ed.). No poverty: contributions of Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 11-17. (Sustainable Development Goals, 1).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | COSTA, P. da; COSTA, J. R. da; SILVA, A. P. da; CAVALCANTE, A. C. R.; WANDELLI, E. V.; TAVARES, E. D.; BIANCHINI, F.; BELTRAO, S. L. L. Poverty and development. In: COSTA, P. da; COSTA, J. R. da; WANDELLI, E. V.; BIANCHINI, F.; TAVARES, E. D. (Ed.). No poverty: contributions of Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 11-17. (Sustainable Development Goals, 1).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 18. | | COSTA, P. da; COSTA, J. R. da; SILVA, A. P. da; CAVALCANTE, A. C. R.; WANDELLI, E. V.; TAVARES, E. D.; BIANCHINI, F.; BELTRÃO, S. L. L. Pobreza e desenvolvimento. In: COSTA, P. da; COSTA, J. R. da; WANDELLI, E. V.; BIANCHINI, F.; TAVARES, E. D. (Ed.). Erradicação da pobreza: contribuições da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 11-16. E-book. (Objetivos de Desenvolvimento Sustentável, 1).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Roraima; Embrapa Semiárido. |
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| 19. | | COSTA, R. J. da; SILVA, A. P. da; FONSECA, R. N. da; HÜBNER, S. de O.; NALERIO, E. S.; MARQUES, J. de L.; VITOLA, H. R. S.; SILVA, W. P. da; DUVAL, E. H.; FIORENTINI, A. M. Characterization of Enterococcus faecium EO1 isolated from mutton and activity of bacteriocin-like substances in the control of Listeria monocytogenes in fresh mutton sausage. Food Science and Technology, v. 141, 110954, Apr. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 20. | | DALL'AGNOL, R. F.; SILVA, A. P. da; MATSUMOTO, L. S.; BABUJIA, L.; RIBEIRO, R. A.; FRANCHINI, J. C.; HUNGRIA, M. Parâmetros microbiológicos como indicadores de alterações decorrentes do manejo do solo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 4 p. Trab. 1070. 1 CD-ROM. FERTBIO 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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