| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com rosangela.lacerda@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
24/02/2015 |
|
Data da última atualização: |
23/05/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
BRAGA, R. M.; SANTANA, M. F.; COSTA, R. V. da; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ARAÚJO, E. F. de; QUEIROZ, M. V. de. |
|
Afiliação: |
RODRIGO VERAS DA COSTA, CNPMS. |
|
Título: |
Transposable elements belonging to the Tc1-Mariner superfamily are heavily mutated in Colletotrichum graminicola. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Mycologia, New York, v. 106, n. 4, p. 629-641, 2014. |
|
DOI: |
10.3852/13?262 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Transposable elements are ubiquitous and constitute an important source of genetic variation in addition to generating deleterious mutations. Several filamentous fungi are able to defend against transposable elements using RIP(repeat-induced point mutation)-like mechanisms, which induce mutations in duplicated sequences. The sequenced Colletotrichum graminicola genome and the availability of transposable element databases provide an efficient approach for identifying and characterizing transposable elements in this fungus, which was the subject of this study. We identified 132 full-sized Tc1-Mariner transposable elements in the sequenced C. graminicola genome, which were divided into six families. Several putative transposases that have been found in these elements have conserved DDE motifs, but all are interrupted by stop codons. An in silico analysis showed evidence for RIP-generated mutations. The TCg1 element, which was cloned from the Brazilian 2908 m isolate, has a putative transposase sequence with three characteristic conserved motifs. However, this sequence is interrupted by five stop codons. Genomic DNA from various isolates was analyzed by hybridization with an internal region of TCg1. All of the isolates featured transposable elements that were similar to TCg1, and several hybridization profiles were identified. C. graminicola has many Tc1-Mariner transposable elements that have been degenerated by characteristic RIP mutations. It is unlikely that any of the characterized elements are autonomous in the sequenced isolate. The possible existence of active copies in field isolates from Brazil was shown. The TCg1 element is present in severalC. graminicola isolates and is a potentially useful molecular marker for population studies of this phytopathogen. Key words: RIP, transposase, transposon MenosTransposable elements are ubiquitous and constitute an important source of genetic variation in addition to generating deleterious mutations. Several filamentous fungi are able to defend against transposable elements using RIP(repeat-induced point mutation)-like mechanisms, which induce mutations in duplicated sequences. The sequenced Colletotrichum graminicola genome and the availability of transposable element databases provide an efficient approach for identifying and characterizing transposable elements in this fungus, which was the subject of this study. We identified 132 full-sized Tc1-Mariner transposable elements in the sequenced C. graminicola genome, which were divided into six families. Several putative transposases that have been found in these elements have conserved DDE motifs, but all are interrupted by stop codons. An in silico analysis showed evidence for RIP-generated mutations. The TCg1 element, which was cloned from the Brazilian 2908 m isolate, has a putative transposase sequence with three characteristic conserved motifs. However, this sequence is interrupted by five stop codons. Genomic DNA from various isolates was analyzed by hybridization with an internal region of TCg1. All of the isolates featured transposable elements that were similar to TCg1, and several hybridization profiles were identified. C. graminicola has many Tc1-Mariner transposable elements that have been degenerated by characteristic RIP mutations. It is unlikely that any of the char... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Antracnose. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02476naa a2200205 a 4500
001 2009650
005 2017-05-23
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.3852/13?262$2DOI
100 1 $aBRAGA, R. M.
245 $aTransposable elements belonging to the Tc1-Mariner superfamily are heavily mutated in Colletotrichum graminicola.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aTransposable elements are ubiquitous and constitute an important source of genetic variation in addition to generating deleterious mutations. Several filamentous fungi are able to defend against transposable elements using RIP(repeat-induced point mutation)-like mechanisms, which induce mutations in duplicated sequences. The sequenced Colletotrichum graminicola genome and the availability of transposable element databases provide an efficient approach for identifying and characterizing transposable elements in this fungus, which was the subject of this study. We identified 132 full-sized Tc1-Mariner transposable elements in the sequenced C. graminicola genome, which were divided into six families. Several putative transposases that have been found in these elements have conserved DDE motifs, but all are interrupted by stop codons. An in silico analysis showed evidence for RIP-generated mutations. The TCg1 element, which was cloned from the Brazilian 2908 m isolate, has a putative transposase sequence with three characteristic conserved motifs. However, this sequence is interrupted by five stop codons. Genomic DNA from various isolates was analyzed by hybridization with an internal region of TCg1. All of the isolates featured transposable elements that were similar to TCg1, and several hybridization profiles were identified. C. graminicola has many Tc1-Mariner transposable elements that have been degenerated by characteristic RIP mutations. It is unlikely that any of the characterized elements are autonomous in the sequenced isolate. The possible existence of active copies in field isolates from Brazil was shown. The TCg1 element is present in severalC. graminicola isolates and is a potentially useful molecular marker for population studies of this phytopathogen. Key words: RIP, transposase, transposon
650 $aAntracnose
700 1 $aSANTANA, M. F.
700 1 $aCOSTA, R. V. da
700 1 $aBROMMONSCHENKEL, S. H.
700 1 $aARAÚJO, E. F. de
700 1 $aQUEIROZ, M. V. de
773 $tMycologia, New York$gv. 106, n. 4, p. 629-641, 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 47 | |
| 4. |  | PINTO, L. R. M.; SILVA, J. C.; SEDIYAMA, C. S. Y.; SILVA, M. de A. e. Avaliacao de oito cultivares de milho em cruzamentos dialelicos, com analise das medias dos hibridos, das suas geracoes e avancadas e das autofecundacoes. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.22, n.9/10, p.975-986 set./out.1987.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
|   |
| 8. | | FERREIRA, I. C.; SILVA, M. de A. e; EUCLIDES FILHO, K.; REIS, R. P.; FIGUEIREDO, G. R.; FRIDRICH, A. B. Análises de sensibilidade da margem bruta em relação às variações nos preços de itens que compõem a receita e os custos do confinamento de diferentes grupos genéticos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria, RS: SBZ, 2003. 4 p. 1 CD-ROM. Sistemas de produção e economia. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 9. | | FERREIRA, I. C.; SILVA, M. de A. e; EUCLIDES FILHO, K.; FIGUEIREDO, G. R.; REIS, R. P.; FRIDRICH, A. B. Análise de custos de diferentes grupos genéticos de bovinos de corte terminados em confinamento. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria, RS: SBZ, 2003. 5 p. 1 CD-ROM. Sistemas de produção e economia. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 10. | | LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; SILVA, M. de A. e; FONSECA, J. B.; SOARES, P. R. Analise genetica e economica em caracteristicas produtivas de aves de postura. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 21., 1984, Belo Horizonte, MG. Anais... Belo Horizonte: SBZ, 1984. p.93| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 12. | | COELHO, M. das G. R.; ROSTAGNO, H. S.; SANT'ANNA, R.; SILVA, M. de A. e; SOARES, P. R. Disponibilidade de aminoacidos de alimentos usados nas racoes de aves. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 21., 1984, Belo Horizonte, MG. Anais... Belo Horizonte: SBZ, 1984. p.243| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 13. | | BARBOSA, H. P.; PEREIRA, J. A. A.; COSTA, P. M. de A.; SILVA, M. de A. e; ROSTAGNO, H. S. Determinacao das exigencias nutricionais de leitoes na fase inicial de crescimento. I. Exigencia de proteina. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 19., 1982, Piracicaba, SP. Anais... Campinas: SBZ, 1982. p.65| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 15. | | WENCESLAU, R. R.; FELIPE, V. P. S.; VALENTE, BRUNO DOURADO; SILVA, M. de A. e; ROSA, A. do N.; NOBRE, P. R. C. Estimativas de parâmetros genéticos para peso e conformação frigorífica de bovinos da raça Nelore à idade de sobreano. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. 3 p. R5984| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 16. | | WENCESLAU, R. R.; FELIPE, V. P. S.; VALENTE, B. D.; SILVA, M. de A. e; ROSA, A. do N.; NOBRE, P. R. C. Estimativas de parâmetros genéticos para peso e conformação frigorífica à desmama em bovinos da raça Nelore. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. 3 p. R5807| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 17. | | SOUSA, J. E. R. de; SILVA, M. de A. e; SARMENTO, J. L. R.; SOUSA, W. H. de; SOUZA, M. do S. M. de; FRIDRICH, A. B. Homogeneidade e heterogeneidade de variância residual em modelos de regressão aleatória sobre o crescimento de caprinos Anglo-Nubianos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 12, p. 1725-1732, dez. 2008. Título em inglês: Homogeneity and heterogeneity of residual variance in random regression models on growth trajectory of Nubian goats.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
|  |
| 18. | | WENCESLAU, A. A.; LOPES, P. S.; TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; EUCLYDES, R. F.; FERREIRA, W. J.; SILVA, M. de A. e. Estimação de parâmetros genéticos de medidas de conformação, produção de leite e idade ao primeiro parto em vacas da raça Gir Leiteiro. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 29, n. 1, p. 153-158, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 19. | | BARBOSA, H. P.; PEREIRA, J. A. A.; COSTA, P. M. de A.; SILVA, M. de A. e; ROSTAGNO, H. S.; COELHO, L. S. S. Influencia do nivel de energia e relacao caloria: nutriente na exigencia de lisina de leitoes na fase inicial de crescimento (5 a 15 kg de peso vivo). Revista da Sociedade Brasileira de Zootecnia, v.14, n.1, p.72-79, 1985.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 20. | | FREITAS, L. S. de; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. de A. e; VERNEQUE, R. da S.; FELIPE, V. P. S.; LEITE, M. B. Avaliação do desempenho produtivo de filhas de touros provados da raça Gir Leiteiro. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| Registros recuperados : 47 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
