BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite; Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  17/12/2014
Data da última atualização:  24/12/2014
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.
Afiliação:  FABIANA BARICHELLO MOKRY, UFSCar; MARCOS ELI BUZANSKAS, FCAV/Unesp; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; DANIELA DO AMARAL GROSSI, University of Guelph; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; RICARDO VIEIRA VENTURA, University of Guelph; ANDRESSA OLIVIERA DE LIMA, UFSCar; MENDI SARGOLZAEI, University of Guelph; SARAH LUGUNA CONCEIÇÃO MEIRELLES, UFV; FLÁVIO SCHRAMM SCHENKEL, University of Guelph; MARCOS VINICIUS GUALBERTO BARBOSA DA SILVA, CNPGL; SIMONE CRISTINA MÉO NICIURA, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; DANÍSIO PRADO MUNARI, FCAV/Unesp; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título:  Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed.
Ano de publicação:  2014
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, London, v. 15, p. 1-9, Oct. 2014.
DOI:  10.1186/1471-2164-15-S7-S6
Idioma:  Inglês
Português
Notas:  Suppl 7.
Conteúdo:  Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances ranging from 400 to 500 kb, clearly showing that the average r2 reduced with the increase in SNP pair distances. The persistence of LD phase showed higher values at shorter genomic distances, decreasing with the increase in physical distance, varying from 0.96 at a distance of < 2.5 kb to 0.66 at a distance from 400 to 500 kb. A total of 78% of all SNPs were clustered into haplotype blocks, covering 1,57 Mb of the total autosomal genome size. Conclusions: This study presented the first high density linkage disequilibrium map and haplotype block structure for a composite beef cattle population, and indicates that the high density SNP panel over 700 k can be used for genomic selection implementation and GWA studies for Canchim bee... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Composite; Desequilíbrio de ligação; Genome wide association studies; Halplotype block; Linjage disequilibirium; Polimorfismo de nucleotídeo único.
Thesagro:  Gado de corte.
Thesaurus Nal:  beef cattle; linkage disequilibrium; single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114252/1/1471-2164-15-S7-S6.pdf
http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/119863/1/MOKRY.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL21619 - 1UPCSP - PPSP 6542 P. 214SP 6542
CNPTIA18093 - 1UPCAP - DD
CPPSE22734 - 1UPCSP - PPPROCI-2014.00140MOK2014.00140

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1.Imagem marcado/desmarcadoBUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURINI, G. C.; BALDI, F.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de. Estimativas de parâmetros genéticos para características reprodutivas e de crescimento em bovinos Canchim por método Bayesiano. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais...Maringa: SBZ:UEM, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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2.Imagem marcado/desmarcadoBUNZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; GUIDOLIN, D. G. F.; BARROZO, D.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de. Estimativas de parâmetros genéticos para características reprodutivas e de crescimento em bovinos da raça Canchim. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais...Maringa: SBZ:UEM, 2009. 1 CD-ROM
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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3.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, R. B.; NKRUMAH, D.; GROSSI, D. DO A.; BARROS, P. S. DE; PAIVA, P.; BEZERRA, L. A. F.; OLIVEIRA, H. N.; SILVA, M. V. G. B. Implantação dos marcadores de DNA para produzir DEPs genomicamente avançados em gado nelore. In: Reunião Anual da SBTE, 25., 2011, Cumbuco. Anais...
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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4.Imagem marcado/desmarcadoLÔBO, R. B.; NKRUMAH, D.; GROSSI, D. do A.; BARROS, P. S. de; PAIVA, P.; BEZERRA, L. A. F.; OLIVEIRA, H. N. de; SILVA, M. V. G. B. Implementation of DNA markers to produce genomically - enhanced EPDs in Nellore cattle. Acta Scientiae Veterinariae, v. 39, suppl. 1, p. s23-s27, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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5.Imagem marcado/desmarcadoGROSSI, D. do A.; GRUPIONI, N. V.; BUZANSKAS, M. E.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; PAZ, C. M. P.; MUNARI, D. P. Efeito de substituição alélica dos marcadores genéticos de IGFl, GH e PITl sobre a idade e o peso ao primeiro parto de bovinos da raça Canchim. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais...Maringa: SBZ:UEM, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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6.Imagem marcado/desmarcadoGRUPIONI, N. V.; GROSSI, D. do A.; BUZANSKAS, M. E.; PAZ, C. C. P; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P. Efeito dos marcadores genéticos IGFl, GH e PITl sobre os valores genéticos da idade ao primeiro parto e peso ao primeiro parto em bovinos da raça Canchim. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais...Maringa: SBZ:UEM, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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7.Imagem marcado/desmarcadoGROSSI, D. do A.; BUZANSKAS, M. E.; GRUPIONI, N. V.; PAZ, C. C. P. de; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; SCHENKEL, F. S.; MUNARI, S. P. Effect of IGF1, GH, and PIT1 markers on the genetic parameters of growth and reproduction traits in Canchim cattle. Molecular Biology Report, 2014
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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8.Imagem marcado/desmarcadoVENTURINI, G. C.; GROSSI, D. do A.; RAMOS, S. B.; CRUZ, A. A. R. da; SOUZA, C. G.; LEDUR, M. C.; EL FARO, L.; SCHMIDT, G. S.; MUNARI, D. P. Estimation of genetic parameters for partial egg production periods by means of random regression models. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 3, p. 1819-1829, 2012. Projeto: 01.06.01.006.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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9.Imagem marcado/desmarcadoBUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle. Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 8, p. 1-10, 2017. Artigo 67. Na publicação: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste.
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10.Imagem marcado/desmarcadoMOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A. Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. BMC Genomics, London, v. 15, p. 1-9, Oct. 2014. Suppl 7.
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