Data/hora: 12/07/2025 18:39:52

Biblioteca(s): 	Embrapa Café.	
Data corrente: 	27/10/2011	
Data da última atualização: 	07/10/2014	
Autoria: 	GUERRA, R. L.; ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; GOULART, C. de C.	
Afiliação: 	RAFAEL LUCIANO GUERRA, UFV; SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; CARLOS DE CASTRO GOULART, UFV.	
Título: 	Um software para extração de ESTs, CONTIGS e SINGLETS do CAFEST.	
Ano de publicação: 	2011	
Fonte/Imprenta: 	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.	
Idioma: 	Português	
Conteúdo: 	Uma das dificuldades encontrada atualmente para os usuários da base de dados do Projeto Brasileiro do Genoma Café (CafEST) é a dificuldade em extrair manualmente todas as sequências armazenadas em seus projetos, no sistema Gene Projects. A partir dessa necessidade, foi desenvolvido um software para fazer a automatização do processo. Desta forma, o usuário do CafEST passa a dispor da comodidade de apenas informar ao programa quais projetos ele deseja que tenham as ESTs, contigs ou singlets extraídos. O programa consiste em dois scripts, um para fazer a extração das ESTs e outro para fazer a extração dos contigs e dos singlets. Os dois scripts retiram do CafEST apenas as ESTs, os contigs e singlets e salvam cada um desses em um arquivo do tipo FASTA. Isto facilita o uso dos mesmos em outras bases de dados e/ou ferramentas de bioinformática	
Palavras-Chave: 	ESTs; Genoma café; Programação Script.	
Categoria do assunto: 	--	
URL: 	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/904264/1/Umsoftwareparextracao.pdf	
Registro original: 	Embrapa Café (CNPCa)	
Exemplares: 	CNPCa - (385-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS