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1.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A. Aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões usando os descritores estruturais de proteínas da base de dados do software STING para discriminação do sítio catalítico de enzimas. 2015. 216 p. il. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Engenharia Elétrica e Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Fernando José Von Zuben, Co-orientador: Goran Neshich.

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2.Imagem marcado/desmarcadoDRUCKER, D. P.; SALIM, J. A; POELEN, J.; SOARES, F. M. Collectively working towards plant-pollinator interactions data interoperability and reuse: lessons learned from the WorldFAIR Project. Biodiversity Information Science and Standards, v. 8, e141109, 2024. Presented at SPNHC-TDWG 2024.

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3.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple structure single parameter: analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, 2016.

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4.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple Structures Single Parameter (MSSP): analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics Advance, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, June 2016.

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5.Imagem marcado/desmarcadoBORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. In: CONGRESS OF THE INTERNATIONAL UNION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 23.; ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 44., 2015, Foz do Iguaçu. Biochemistry for a better world: abstracts book. [Foz do Iguaçu]: SBBq, 2015. p. 153. C.047.

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6.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. A comparison between internal protein nanoenvironments of α-helices and beta-sheets. Plos One, v. 15, n. 12, p. 1-13, Dec. 2020. Artigo e0244315.

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7.Imagem marcado/desmarcadoOLLERTON, J.; TALIGA, C.; SALIM, J. A.; POELEN, J. H.; DRUCKER, D. P. Incorporating measures of data quality into plant-pollinator databases. Journal of Pollination Ecology, v. 38, n. 10, p. 151-160, 2025.

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8.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Study of specific nanoenvironments containing α-helices in all-α and ([α]+[β])+([α]/[β]) proteins. Plos One, v. 13, n. 7, p. 1-25, 2018. Artigo e0200018.

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9.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; NISHIMURA, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Pathogenic Prion Proteins (PrP) have higher electrostatic potential pattern than normal cellular prion protein in a specific region. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.

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10.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G. MSSP: a web-based application for analysis of selected parameter from multiple structures in a graphical manner. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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11.Imagem marcado/desmarcadoYANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; NESHICH, G.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G. RNDS: Rede Neural para Classificar Descritores do Sting. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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12.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. de; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Size matters: surface hydrophobicity index (SHI) describes the impact of the size of interface area on oligomerization driven by hydrophobic effect. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY; STRUCTURAL BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS MEETING, 8., 2012, Long Beach, California. Abstracts... California: ISMB, 2012. Não paginado. 3Dsig 2012.

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13.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A; MORAES, F. R. de; CORREA, J. L.; BORRO, L. C.; NESHICH, G. Comprehensive analysis of the distinct nano environments characteristics containing the different secondary structure elements: alpha-helices, beta-sheets, and turns. Current Nanomedicine, v. 15, n. 3, p. 267-285, 2025.

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14.Imagem marcado/desmarcadoJARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; MAZONI, I.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Generation of lipase B mutants with increased surface hydrophobicity in order to improve biodiesel catalysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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15.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Surface hydrophobicity index (SHI): insight into the mechanisms of protein-protein associations. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009

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16.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; NISHIMURA, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Structure function relationship de convoluted to a level of physical chemical descriptors: case study - lysozyme / lactalbumine differences. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.

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17.Imagem marcado/desmarcadoJARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; BORRO, L.; NISHIMURA, L. S.; NESHICH, G. Biologia computacional molecular e suas aplicações na agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 6. p. 101-117.

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18.Imagem marcado/desmarcadoKOFFLER, S.; SOARES, F. M.; GHILARDI-LOPES, N. P.; ALBERTINI, B.; DRUCKER, D. P.; SALIM, J. A.; NUNES-SILVA, P.; FRANCOY, T. M.; SARAIVA, A. M.; CARVELL, C. FIT Count Brasil: monitoramento de visitantes florais por contagem. Santo André, SP: Universidade Federal do ABC, 2022. 90 p. (Ciência cidadã, v. 7).

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19.Imagem marcado/desmarcadoDRUCKER, D. P.; SALIM, J. A; TREKELS, M.; GROOM, Q.; PARR, C.; SOARES, F. M.; AGOSTINI, K.; SARAIVA, A. M.; MOLLOY, L.; HODSON, S.; GREGORY, A. Plant-pollinator interaction data: a case study of the WorldFAIR Project. Biodiversity Information Science and Standards, v. 6, e94310, 2022. Edição de resumos de The Biodiversity Information Standards (TDWG) annual conference, 2022, Sofia, Bulgaria.

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20.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A.; YANO, I. H.; MORAES, F. R.; CARVALHO, J. G.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I.; NESHICH, G. Prediction of a-helix using data mining decision tree technique. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 41., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... [S.l]: SBBq, 2012. Não paginado. Poster.

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1.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos; SANTOS, J. C. dos. Evolução e perfil distributivo das aplicações do Fundo Constitucional de Financiamento do Norte (FNO) na pecuária leiteira paraense no período 2000-2009. In: ZOOTEC NA AMAZÔNIA LEGAL, 1.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 20., 2010, Palmas. Sustentabilidade e produção animal. Palmas: UFT: ABZ, [2010]. Zootec 2010.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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2.Imagem marcado/desmarcadoREBELLO, F. K.; HOMMA, A. K. O.; SANTOS, M. A. S. dos; CORRÊA, R. R. Crédito rural e rede bancária no Nordeste Paraense: evolução e concentração espacial, 2000-2010. Sociedade e Desenvolvimento Rural, v. 7, n. 4, p. 92-105, nov. 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
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3.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, J. R. da S. C. de; MARTORANO, L. G.; SANTOS, M. A. S. dos. Conjuntura de mercado nacional e internacional para apontar evidências de consolidação do programa palma de óleo (Elaeis guineensis) no estado do Pará. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 65., 2013, Recife. Ciência para o novo Brasil: anais. Recife: SBPC, 2013.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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4.Imagem marcado/desmarcadoFILGUEIRAS, G. C.; HOMMA, A. K. O.; SANTOS, M. A. S. dos. Conjuntura do mercado da pimenta-do-reino no Brasil e no mundo. In: WORKSHOP DA PIMENTA DO REINO DO ESTADO DO PARÁ, 1., 2009, Belém, PA. Situação atual e alternativa para a produção sustentável. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
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5.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, J. C. dos; SANTOS, M. A. S. dos. Estrutura de produção e comercialização da agroindústria do leite no Oeste do Pará. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém, PA: SBZ, 2011.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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6.Imagem marcado/desmarcadoREBELLO, F. K.; SANTOS, M. A. S. dos; HOMMA, A. K. O. Modernização da agricultura na mesorregião do Nordeste paraense (PA): determinantes e hierarquização. Revista Movendo Idéias, v. 15, n. 2, p. 106-120, 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
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7.Imagem marcado/desmarcadoREBELLO, F. K.; SANTOS, M. A. S. dos; HOMMA, A. K. O. Modernização da agricultura nos municípios do Nordeste paraense: determinantes e hierarquização no ano 2006. Revista de Economia e Agronegócio, v. 9, n. 2, p. 209-232, maio/ago. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
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8.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, J. C. dos; SANTOS, M. A. S. dos. Caracterização da agroindústria do leite na região oeste do estado do Pará. Amazônia: Ciência & Desenvolvimento, Belém, PA, v. 8, n. 15, p. 63-78, jul./dez. 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
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9.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos; RAIOL, L. C. B. Identificação das fontes de crescimento da produção de leite no estado do Pará no período 1990-2008. In: ZOOTEC NA AMAZÔNIA LEGAL, 1.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 20., 2010, Palmas. Sustentabilidade e produção animal. Palmas: UFT: ABZ, [2010]. Zootec 2010.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoFILGUEIRAS, G. C.; SANTOS, M. A. S. dos; SANTANA, A. C. de; HOMMA, A. K. O. Fontes de crescimento da produção de pimenta-do-reino no Estado do Pará no período de 1979 a 2001. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA E SOCIOLOGIA RURAL, 42., 2004, Cuiabá. Dinâmicas setoriais e desenvolvimento regional: artigos completos. Cuiabá: SOBER: UFMT, 2004. Não paginado. il.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
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11.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, J. C. dos; SENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos. Rentabilidade e custos da pecuária leiteira na região Oeste do estado do Pará. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém, PA: SBZ, 2011.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos; SANTOS, J. C. dos; HOMMA, A. K. O. Concentração espacial e caracterização da pecuária leiteira no estado do Pará. In: CONGRESSO SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 48., 2010, Campo Grande, MS. Tecnologias, desenvolvimento e integração social. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Economia, Administração e Sociologia Rural, 2010. p. 1-17. 1 CD-ROM. SOBER.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoFILGUEIRAS, G. C.; SANTOS, M. A. S. dos; HOMMA, A. K. O.; REBELLO, F. K.; CRAVO, M. da S. Aspectos socioeconômicos. In: ZILLI, J E.; VILARINHO, A. A.; ALVES, J. M. A. (Ed.). A cultura do feijão-caupi na Amazônia brasileira. Boa Vista, RR: Embrapa Roraima, 2009. Cap. 1, p. 23-58.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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14.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, J. C. dos; SENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos; NAHUM, B. de S. Perfil socioeconômico dos produtores de leite da região Oeste do estado do Pará. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém, PA: SBZ, 2011.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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15.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. S. dos; SENA, A. L. dos S.; SANTOS, J. C. dos; LOURENÇO JUNIOR, J. de B. Caracterização das aplicações de crédito rural e dos financiamentos à pecuária leiteira na região Oeste do estado do Pará. Nucleus, v. 11, n. 2, p. 213-223, out. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
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16.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos; SANTOS, J. C. dos; HOMMA, A. K. O. Avaliação do nível tecnológico dos produtores de leite na região oeste do estado do Pará. Revista de Economia e Agronegócio, Viçosa, v. 10, n. 3, p. 397-417, 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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17.Imagem marcado/desmarcadoSENA, A. L. dos S.; SANTOS, M. A. S. dos; SANTOS, J. C. dos; HOMMA, A. K. O. Índice de desenvolvimento tecnológico da pecuária leiteira na região oeste do estado do Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 10.; SEMANA DO MÉDICO VETERINÁRIO DO PARÁ, 37.; SIMPÓSIO PARAENSE DE MEDICINA VETERINÁRIA, 5., 2013, Belém, PA. Ciência e prática andam juntas para aumentar a produção: anais. Belém, PA: Associação Brasileira de Buiatria, 2013.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, J. C. dos; SENA, A. L. dos S.; ROCHA, C. I. L. da; SANTOS, M. A. S. dos. O boi na fronteira agrícola: herói ou vilão? In: ZOOTEC NA AMAZÔNIA LEGAL, 1.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 20., 2010, Palmas. Sustentabilidade e produção animal. Palmas: UFT: ABZ, [2010]. p. 110-123. 1 CD-ROM. Zootec 2010.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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19.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. S. dos; SANTANA, A. C. de; HOMMA, A. K. O.; BEZERRA, A. S.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B. Economic efficiency of cattle production in the brazilian amazon. International Journal of Food and Agricultural Economics, v. 7, n. 4, p. 293-301, 2019.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. S. dos; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; SENA, A. L. dos S.; NORONHA, G. N.; NERES, L. de S. Evolução dos abates inspecionados de bovinos no estado do Pará, Brasil, 1997-2012. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 10.; SEMANA DO MÉDICO VETERINÁRIO DO PARÁ, 37.; SIMPÓSIO PARAENSE DE MEDICINA VETERINÁRIA, 5., 2013, Belém, PA. Ciência e prática andam juntas para aumentar a produção: anais. Belém, PA: Associação Brasileira de Buiatria, 2013.
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