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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
29/05/2014 |
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Data da última atualização: |
24/05/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VALICENTE, F. H.; SILVA, R. B. da. |
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Afiliação: |
FERNANDO HERCOS VALICENTE, CNPMS; ROSANE BEZERRA DA SILVA, BOLSISTA. |
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Título: |
fAFLP analysis of Brazilian Bacillus thuringiensis isolates. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
SpringerPlus, v. 3, n. 256, 2014. |
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DOI: |
10.1186/2193-1801-3-256 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A total of 65 Bacillus thuringiensis (Bt) isolates were subjected to analysis of genetic relationship using fAFLP (fluorescent Fragment Length Polymorphism), in order to determine the genetic diversity within a group of Bt strains. 26 strains from different subspecies were identified as it follows: 9 kindly provided by the USDA (United States Department of Agriculture), 9 kindly provided by the Institute Pasteur and eight from Embrapa Maize and Sorghum Bt Collection, and 39 strains with no subspecies information also from Embrapa’s Bt Collection. DNA sample was double digested with restriction enzymes EcoRI and MseI, and the fragments were linked to adapters. Selective amplification reactions were performed using five primer combinations and the amplified fragments were separated by gel electrophoresis on an ABI377 sequencer. Genetic distances were obtained by the complement of the Jaccard coefficient and the groups were performed by the UPGMA method. Five primer combinations generated 495 scorable fragments and 483 were found to be polymorphic. Out of 26 subspecies, strains 344 and T09 (B. thuringiensis subsp. tolworthi) showed the highest similarity (15%), while isolates HD3 B. thuringiensis subsp finitimus and T24 B. thuringiensis subsp neoleonensis were the most genetically distant (92%). B. thuringiensis isolates with no subspecies identification, found in samples from Goiás State showed higher similarity forming a group with an average distance of 6%, and the closest subspecies to this group was B. thuringiensis subsp thuringiensis (HD2) with 52% of similarity. This similarity may be due to the fact that these organism exchange genetic material by conjugation, and it is relatively common to have evolutionary characteristics of their ancestors. MenosA total of 65 Bacillus thuringiensis (Bt) isolates were subjected to analysis of genetic relationship using fAFLP (fluorescent Fragment Length Polymorphism), in order to determine the genetic diversity within a group of Bt strains. 26 strains from different subspecies were identified as it follows: 9 kindly provided by the USDA (United States Department of Agriculture), 9 kindly provided by the Institute Pasteur and eight from Embrapa Maize and Sorghum Bt Collection, and 39 strains with no subspecies information also from Embrapa’s Bt Collection. DNA sample was double digested with restriction enzymes EcoRI and MseI, and the fragments were linked to adapters. Selective amplification reactions were performed using five primer combinations and the amplified fragments were separated by gel electrophoresis on an ABI377 sequencer. Genetic distances were obtained by the complement of the Jaccard coefficient and the groups were performed by the UPGMA method. Five primer combinations generated 495 scorable fragments and 483 were found to be polymorphic. Out of 26 subspecies, strains 344 and T09 (B. thuringiensis subsp. tolworthi) showed the highest similarity (15%), while isolates HD3 B. thuringiensis subsp finitimus and T24 B. thuringiensis subsp neoleonensis were the most genetically distant (92%). B. thuringiensis isolates with no subspecies identification, found in samples from Goiás State showed higher similarity forming a group with an average distance of 6%, and the closest s... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bacillus thruringiensis; Diversidade genética. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02280naa a2200169 a 4500
001 1987279
005 2017-05-24
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520 $aA total of 65 Bacillus thuringiensis (Bt) isolates were subjected to analysis of genetic relationship using fAFLP (fluorescent Fragment Length Polymorphism), in order to determine the genetic diversity within a group of Bt strains. 26 strains from different subspecies were identified as it follows: 9 kindly provided by the USDA (United States Department of Agriculture), 9 kindly provided by the Institute Pasteur and eight from Embrapa Maize and Sorghum Bt Collection, and 39 strains with no subspecies information also from Embrapa’s Bt Collection. DNA sample was double digested with restriction enzymes EcoRI and MseI, and the fragments were linked to adapters. Selective amplification reactions were performed using five primer combinations and the amplified fragments were separated by gel electrophoresis on an ABI377 sequencer. Genetic distances were obtained by the complement of the Jaccard coefficient and the groups were performed by the UPGMA method. Five primer combinations generated 495 scorable fragments and 483 were found to be polymorphic. Out of 26 subspecies, strains 344 and T09 (B. thuringiensis subsp. tolworthi) showed the highest similarity (15%), while isolates HD3 B. thuringiensis subsp finitimus and T24 B. thuringiensis subsp neoleonensis were the most genetically distant (92%). B. thuringiensis isolates with no subspecies identification, found in samples from Goiás State showed higher similarity forming a group with an average distance of 6%, and the closest subspecies to this group was B. thuringiensis subsp thuringiensis (HD2) with 52% of similarity. This similarity may be due to the fact that these organism exchange genetic material by conjugation, and it is relatively common to have evolutionary characteristics of their ancestors.
653 $aBacillus thruringiensis
653 $aDiversidade genética
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 20 | |
| 2. |  | LOPES, L. V.; ROSA, T. C. da; SILVEIRA, T. S.; MACHADO, M. A. S.; BORTOLINI, F. Análise descritiva em populações de Vicia angustifolia. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 26.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 19.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 3., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 3. | | ROSA, T. C. Da; BORTOLINI, F.; LOPES, L. V.; PAGNUSSATT, A. L.; MITTELMANN, A. Avaliação de híbridos experimentais de sorgo silageiro em solos hidromórficos na safra agrícola 2014/2015. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 6., 2016, Pelotas. Ciência: Empreendedorismo e inovação: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 271-273| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | SILVEIRA, T. S.; BORTOLINI, F.; LOPES, L. V.; MACIEL, L. da R.; VALGAS, R. A. Caracterização morfoagronômica de uma população de serradela nativa. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 6., 2016, Pelotas. Ciência: Empreendedorismo e inovação: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 7. | | SILVEIRA, T. S.; LOPES, L. V.; ROSA, T. C. da; MAXIMINO, J. V. de O.; BORTOLINI, F. Caracterização morfoagronômica de duas populações de Macroptilium lathyroides. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 26.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 19.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 3., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | CHAGAS, G. A.; SOUZA, J. de; MOURA, M. F.; LOPES, L. V.; TOGNI, P. H. B.; SOUZA, A. E. R. A.; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Eficiência de três modelos de armadilhas interceptadoras de vôo modificadas na captura de insetos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. Anais... Curitiba: SBE, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | MACHADO, M. A. S.; FREITAS, J. V. R.; LOPES, L. V.; MAXIMINO, J. V. de O.; KOPP, M. M.; MITTELMANN, A. Distribuição da produtividade ao longo do ciclo da cultivar BRS integração em diferentes ambientes. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS, 26., 2017, Pelotas. Anais... Pelotas: Universidade Federal de Pelotas, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | SOUSA, A. A. T. C. de; CHAGAS, G. A.; LOPES, L. V.; PIMENTA, M.; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R.; FIGUEIREDO, C. C. Efeito da borra de café na macrofauna de solo sob produção de cafeeiro orgânico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. Anais... Curitiba: SBE, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | CHAGAS, G. A.; MOURA, M. F.; LOPES, L. V.; SOUZA, A. E. R. A.; SOUSA, A. A. T. C. de; SOARES, H. H.; TOGNI, P. H. B.; SOUZA, L. M. de; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Abundância de insetos em sistemas agrícolas de produção orgânica no Distrito Federal . In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. Anais... Curitiba: SBE, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | SOUZA, A. E. R. A.; MOURA, M. F.; LOPES, L. V.; CHAGAS, G. A.; SOARES, H. H.; SOUSA, A. A. T. C. de; HARTERREITEN-SOUZA, E. S.; SOUZA, L. M. de; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Diversidade de insetos em propriedades rurais orgânicas com diferentes práticas de manejo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. Anais... Curitiba: SBE, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | SOUZA, A. E. R. A.; TOGNI, P. H. B.; SOARES, H. H.; LOPES, L. V.; BRAVO, L. K. B.; OLIVEIRA, A. R.; SOUZA, L. M.; PIRES, C. S. S.; LAUMANN, R. A.; SUJII, E. R. A diversificação vegetal afeta a comunidade de himenópteros parasitoides em sistemas orgânicos de produção. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | SOUZA, E. R. A.; LOPES, L. V.; MOURA, M. F.; CHAGAS, G. A.; SOARES, H. A.; SOUSA, A. A. T. C. de; HARTERREITEN-SOUZA, E. S.; SOUZA, L. M. de; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. A heterogeneidade local afeta a composição da comunidade de insetos em agroecossistemas? In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. Anais... Curitiba: SBE, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | HARTERREITEN-SOUZA, E. S.; SOUZA, H. H. S. de; BRAVO, L. K. B.; OLIVEIRA, A. R.; MADEIRA, L. F.; LOPES, L. V.; SOUZA, A. E. R. A.; TOGNI, P. H. B.; SOUSA, A. A. T. C.; SOUZA, L. M. de; PIRES, C. S. S.; PUJOL-LUZ, J. R.; SUJII, E. R. Área de pousio como hábitat fonte para manutenção de moscas predadoras e parasitoides em agroecossistemas de hortaliças. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | OLIVEIRA, A. R.; BRAVO, L. K. B.; SOUZA, A. E. R. A.; TOGNI, P. H. B.; LOPES, L. V.; MADEIRA, L. F.; SOARES, H. H.; PIMENTA, M.; SOUZA, L. M. de; HARTERREITEN-SOUZA, E. S.; SOUSA, A. A. T. C. de; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Estrutura da comunidade de Coccinellidae em sistemas orgânicos de produção de hortaliças In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | MADEIRA, L. F.; SOUZA, A. E. R. A.; LOPES, L. V.; BRAVO, L. K. B.; OLIVEIRA, A. R.; TOGNI, P. H. B.; HARTERREITEN-SOUZA, E. S.; SOUSA, A. A. T. C. de; SOUZA, L. M. de; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Uso de habitat por Chrysoperla externa (Neuroptera: Chrysopidae) em sistemas orgânicos de produção de hortaliças. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | LOPES, L. V.; PIMENTA, M.; SOUZA, A. E. R. A.; TOGNI, P. H. B.; SOUSA, A. A. T. C. de; SOUZA, L. M. de; BRAVO, L. K. B.; OLIVEIRA, A. R.; MADEIRA, L. F.; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Diversidade de Reduviidae (Heteroptera) em cultivos orgânicos de hortaliças. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | BRAVO, L. K. B.; OLIVEIRA, A. R.; TOGNI, P. H. B.; SOUZA, A. E. R. A.; MADEIRA, L. F.; LOPES, L. V.; PIMENTA, M.; HARTERREITEN-SOUZA, E. S.; SOUSA, A. A. T. C. de; SOUZA, L. M. de; PIRES, C. S. S.; SUJII, E. R. Influência da Harmonia axyridis uso de habitat por Cycloneda sanguinea em sistemas orgânicos. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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