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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
16/12/2013 |
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Data da última atualização: |
10/12/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. |
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Afiliação: |
ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; MARCELO FIDELES BRAGA, CPAC; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP. |
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Título: |
Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013. |
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ISSN: |
0003-4746 |
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DOI: |
10.1111/aab.12028 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
One of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of which fit a segregation ratio of 1:1:1:1, 1.3% a ratio of 1:2:1, 27.3% a ratio of 3:1 and 69.4% a ratio of 1:1. The map spanned a total of 2073.0 cM, with an average distance between adjacent markers of 3.8 cM. This is the first linkage study on sweet passion fruit and should prove useful for quantitative trait loci mapping. MenosOne of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of w... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Maracujá; Marcador genético; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal; Polimorfismo Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Genetic markers; Genetic polymorphism; Passiflora alata; Passion fruits. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 10 | |
| 1. |  | PEREIRA, G. de M.; LATTA, K. I.; RIBAS, M. N.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; GOMES, R. da C.; EGITO, A. A. do; MENEZES, G. R. de O. Consumo hídrico e suas associações com características produtivas em novilhas da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. p. 38-39| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 2. | | PEREIRA, G. de M.; LATTA, K. I.; RIBAS, M. N.; FERNANDES JÚNIOR, J. A.; GOMES, R. da C.; EGITO, A. A. do; MENEZES, G. R. de O. Parâmetros genéticos e fenotípicos para consumo de água e eficiência hídrica em bovinos da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 50-51| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 3. | | MARTINS, T. R.; NOVO, L. C.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; LAUREANO, M. M. M.; ARAÚJO, C. V. de; PÁDUA, J. T.; MENEZES, G. R. de O. Heritability for antral follicle count and its genetic associations with ultrasound carcass traits in Senepol Cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais. Viçosa: Sociedade Brasileira de Zootecnia; Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | PEREIRA, G. de M.; MARTINS, T. R.; LATTA, K. I.; RIBAS, M. N.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; GOMES, R. da C.; MENEZES, G. R. de O. Residual water intake as an indicator of water efficiency in cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais. Viçosa: Sociedade Brasileira de Zootecnia; Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | PEREIRA, G. de M.; MARTINS, T. R.; LATTA, K. I.; RIBAS, M. N.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; GOMES, R. da C.; EGITO, A. A. do; MENEZES, G. R. de O. Carcass traits of Senepol heifers with divergent residual water intake. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais. Viçosa: Sociedade Brasileira de Zootecnia; Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | NOVO, L. C.; GONDO, A.; GOMES, R. da C.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; RIBAS, M. N.; BRITO, L. F.; LAUREANO, M. M. M.; ARAÚJO, C. V.; MENEZES, G. R. O. Genetic parameters for performance, feed efficiency, and carcass traits in Senepol heifers. The international journal of animal biosciences, v. 15,2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | MENEZES, G. R. de O.; GOMES, R. da C.; RIBAS, M. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; PEREIRA, G. M.; FAVERO, R.; SILVA, L. O. C. da. Genetic and phenotypic parameters for feed and water efficiency in Senepol cattle. In: BRYANT, J.; BURKE, M.; COOK, R.; HARRIS, B; MOSCONI, C.; WICKHAM, B. (Ed.). Cooperation, networking and global interactions in the animal production sector. Rome, Italy: ICAR (ICAR Technical Series, 23) Proceedings of the ICAR Conference held in Auckland, NZ, 10-11 February 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | SOUZA, C. B.; MENEZES, G. R. de O.; GONDO, A.; EGITO, A. A. do; RAMOS, P. V. B.; GOMES, R. da C.; RIBAS, M. N.; FERNANDES JUNIOR, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F. Estimation of genetic parameters and GWAS on water efficiency traits in the Senepol cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, 2024. Online ahead of print.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | STARLING, J. M. C.; RIBEIRO, A. R. B.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P.; SAVEGNAGO, R. P.; FERNANDES JÚNIOR, J. A.; PAÇO, A. L.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A. Termorregulação de novilhas Senepol submetidas a um teste de tolerância ao calor na região Sudeste do Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda - anais. Salvador: SBZ: UFBA, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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