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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
19/11/2013 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S. do; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; MATOS, M. C.; ZAVAREZ, L. B.; O'BRIEN, A. M. P.; SÖLKNER, J.; McEWAN, J. C.; COLE, J. B.; TASSEL, C. P. V.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; PORTO NETO, L. R.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F. |
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Afiliação: |
YURI T. UTSUNOMIYA, UNESP; ADRIANA S. DO CARMO, UNESP; ROBERTO CARVALHEIRO, GenSys Consultores Associados; HAROLDO H. R. NEVES, UNESP; MÁRCIA C. MATOS, UNESP; LUDMILLA B. ZAVAREZ, UNESP; ANA M. PÉREZ O'BRIEN, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; JOHANN SÖLKNER, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; JOHN C. McEWAN, Centre for Reproduction and Genomics, AgResearch, Mosgiel, New Zealand; JOHN B. COLE, ARS-USDA, USA; CURTIS P. VAN TASSEL, ARS-USDA, USA; FLÁVIO S. SCHENKEL, University of Guelph, Canada; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; LAERCIO R. PORTO NETO, University of Queensland, Australia; University of New England, Australia; TAD S. SONSTEGARD, ARS-USDA, USA; JOSÉ F. GARCIA, UNESP. |
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Título: |
Genome-wide association study for birth weight in Nellore cattle points to previously described orthologous genes affecting human and bovine height. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, London, v. 14, article 52, 2013. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/1471-2156-14-52 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background - Birth weight (BW) is an economically important trait in beef cattle, and is associated with growth- and stature-related traits and calving difficulty. One region of the cattle genome, located on Bos primigenius taurus chromosome 14 (BTA14), has been previously shown to be associated with stature by multiple independent studies, and contains orthologous genes affecting human height. A genome-wide association study (GWAS) for BW in Brazilian Nellore cattle (Bos primigenius indicus) was performed using estimated breeding values (EBVs) of 654 progeny-tested bulls genotyped for over 777,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Results - The most significant SNP (rs133012258, PGC = 1.34 × 10-9), located at BTA14:25376827, explained 4.62% of the variance in BW EBVs. The surrounding 1 Mb region presented high identity with human, pig and mouse autosomes 8, 4 and 4, respectively, and contains the orthologous height genes PLAG1, CHCHD7, MOS, RPS20, LYN, RDHE2 (SDR16C5) and PENK. The region also overlapped 28 quantitative trait loci (QTLs) previously reported in literature by linkage mapping studies in cattle, including QTLs for birth weight, mature height, carcass weight, stature, pre-weaning average daily gain, calving ease, and gestation length. Conclusions- This study presents the first GWAS applying a high-density SNP panel to identify putative chromosome regions affecting birth weight in Nellore cattle. These results suggest that the QTLs on BTA14 associated with body size in taurine cattle (Bos primigenius taurus) also affect birth weight and size in zebu cattle (Bos primigenius indicus). MenosBackground - Birth weight (BW) is an economically important trait in beef cattle, and is associated with growth- and stature-related traits and calving difficulty. One region of the cattle genome, located on Bos primigenius taurus chromosome 14 (BTA14), has been previously shown to be associated with stature by multiple independent studies, and contains orthologous genes affecting human height. A genome-wide association study (GWAS) for BW in Brazilian Nellore cattle (Bos primigenius indicus) was performed using estimated breeding values (EBVs) of 654 progeny-tested bulls genotyped for over 777,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Results - The most significant SNP (rs133012258, PGC = 1.34 × 10-9), located at BTA14:25376827, explained 4.62% of the variance in BW EBVs. The surrounding 1 Mb region presented high identity with human, pig and mouse autosomes 8, 4 and 4, respectively, and contains the orthologous height genes PLAG1, CHCHD7, MOS, RPS20, LYN, RDHE2 (SDR16C5) and PENK. The region also overlapped 28 quantitative trait loci (QTLs) previously reported in literature by linkage mapping studies in cattle, including QTLs for birth weight, mature height, carcass weight, stature, pre-weaning average daily gain, calving ease, and gestation length. Conclusions- This study presents the first GWAS applying a high-density SNP panel to identify putative chromosome regions affecting birth weight in Nellore cattle. These results suggest that the QTLs on BTA14 associated with ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bos primigenius indicus; GWAS; Nellore cattle; Stature. |
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Thesaurus Nal: |
Birth weight. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 3. |  | SANTOS, T. A.; GOMES, T. C. de A.; LIMA, C. C. de. Alterações em características químicas de amostras de compostos de bagaço de coco-verde resultantes do método de estocagem. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. Fertbio 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 9. | | ALMADA, D. A. de; SANTOS, T. A. P. dos; RODRIGUES, S. T.; XAVIER JUNIOR, S. R. Plantas medicinais com propriedades anti-helmínticas utilizadas em caprinos. In: SIMPÓSIO DE ESTUDOS E PESQUISAS EM CIÊNCIAS AMBIENTAIS NA AMAZÔNIA, 6., 2017, Belém, PA. Anais. Belém, PA: UEPA, 2017. v. 1, p. 340-348.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 15. | | SILVA, M. T. R. da; SANTOS, T. A.; AGUILAR, M. V. M.; BARBOSA, G. S.; DANTAS, B. F. Avaliação do vigor de lotes armazenados de sementes de aroeira-do-sertão por meio do teste de condutividade elétrica. In: SIMPÓSIO DO BIOMA CAATINGA, 2., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 295. (Embrapa Semiárido. Documentos, 287).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | BARBOSA, G. S.; SILVA, M. T. R. da; SANTOS, T. A.; AGUILAR, M. V. M.; DANTAS, B. F. Avaliação do vigor de sementes de Erythrina mulungu Mart. ex Benth armazenadas e diferentes lotes por meio do teste de condutividade elétrica. In: SIMPÓSIO DO BIOMA CAATINGA, 2., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 318. (Embrapa Semiárido. Documentos, 287).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | SILVA, M. T. R. da; BARBOSA, G. S.; SANTOS, T. A.; AGUILAR, M. V. M.; DANTAS, B. F. Avaliação do vigor de sementes de pereiro em diferentes lotes através do teste de condutividade elétrica. In: SIMPÓSIO DO BIOMA CAATINGA, 2., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 317. (Embrapa Semiárido. Documentos, 287)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | FERREIRA, C. F.; SILVA, A. G. S.; SANTOS, T. A.; REINHARDT, D. H. R. C.; SOARES FILHO, W. dos S. Fingerprint molecular em genótipos de citros utilizando marcadores microssatélites não-ancorados. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | SILVA, F. F. da; SANTOS, T. A. dos; MACHADO, F. S.; JESUS, E. da C.; CHAER, G. M. Quantificação de rizóbios em áreas degradadas pela exploração e uso de piçarra na Caatinga. In: SIMPÓSIO DE GESTÃO AMBIENTAL E BIODIVERSIDADE, SIGABI, 7., 2018, Três Rios. Anais... Três Rios: UFRRJ, 2018. 1 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 20. | | SILVA, F. F. da; SANTOS, T. A. dos; MACHADO, F. S.; JESUS, E. da C.; CHAER, G. M. Quantificação de bactérias fixadoras de nitrogênio em áreas de exploração mineral no Bioma Caatinga. In: SIMPÓSIO DO BIOMA CAATINGA, 2., WORKSHOP DE MUDAS E SEMENTES DA CAATINGA, 6., Juazeiro. Trabalhos... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| Registros recuperados : 51 | |
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