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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
18/11/2013 |
Data da última atualização: |
21/09/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CASTRO, A. P. de; SILVA, M. R. S. S. da; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. |
Afiliação: |
Alinne Pereira de Castro, UnB; Maria Regina Silveira Sartori da Silva, UnB; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; Ricardo Henrique Krüger, UnB. |
Título: |
Combining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Current Protein and Peptide Science, v. 14, n. 6, 2013. |
DOI: |
10.2174/13892037113149990062 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
It is well established in the scientific literature that only a small fraction of microorganisms can be cultured by conventional microbiology methods. The ever cheaper and faster DNA sequencing methods, together with advances in bioinformatics, have improved our understanding of the structure and functional behavior of microbial communities in many complex environments. However, the metagenomics approach alone cannot elucidate the functionality of all micro-organisms, because a vast number of potentially new genes have no homologs in public databases. Metatranscriptomics and metaproteomics are approaches based on different techniques and have recently emerged as promising techniques to describe microbial activities within a given environment at the molecular level. In this review, we will discuss current developments and applications of metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics, and their limitations in the study of microbial communities. The combined analysis of genes, mRNA and protein in complex microbial environments will be key to identify novel biological molecules for biotechnological purposes. |
Palavras-Chave: |
Metagenome; Metaproteome; Metatranscriptome and microbial diversity. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01801naa a2200205 a 4500 001 1971297 005 2017-09-21 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.2174/13892037113149990062$2DOI 100 1 $aCASTRO, A. P. de 245 $aCombining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aIt is well established in the scientific literature that only a small fraction of microorganisms can be cultured by conventional microbiology methods. The ever cheaper and faster DNA sequencing methods, together with advances in bioinformatics, have improved our understanding of the structure and functional behavior of microbial communities in many complex environments. However, the metagenomics approach alone cannot elucidate the functionality of all micro-organisms, because a vast number of potentially new genes have no homologs in public databases. Metatranscriptomics and metaproteomics are approaches based on different techniques and have recently emerged as promising techniques to describe microbial activities within a given environment at the molecular level. In this review, we will discuss current developments and applications of metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics, and their limitations in the study of microbial communities. The combined analysis of genes, mRNA and protein in complex microbial environments will be key to identify novel biological molecules for biotechnological purposes. 653 $aMetagenome 653 $aMetaproteome 653 $aMetatranscriptome and microbial diversity 700 1 $aSILVA, M. R. S. S. da 700 1 $aQUIRINO, B. F. 700 1 $aKRUGER, R. H. 773 $tCurrent Protein and Peptide Science$gv. 14, n. 6, 2013.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
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Registros recuperados : 203 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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143. | | LAZARO, S. de; BORTOLINI, T. J.; BERGER, D.; TEBCHERANI, S. M.; PIANARO, S. A.; GIRALDI, T.; OLIVEIRA, C. R. de. Theoretical investigation about reactive properties of the Atrazine herbicide In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON FOOD AND AGRICULTURE APPLICATIONS OF NANOTECHNOLOGIES - NanoAgri, 2010, São Pedro, SP. [Anais…] São Pedro: Aptor Software, 2010. Editors: Caue Ribeiro, Odílio Benedito Garrido de Assis, Luiz Henrique Capparelli Mattoso, Sérgio Mascarenhas.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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148. | | COSTA JUNIOR, L. J. D.; ZIMER, A. M.; MACHADO, M. M. P.; YAMAMOTO, C. F.; OLIVEIRA, C. R. de; PEREIRA, E. C. Aplicação de membranas de alumina anódica porosa como filtros físicos para microorganismos. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 6., 2012, Fortaleza. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação; Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2012. p. 422-424. Editores: Maria Alice Martins, MOrsyleide de Freitas Rosa, Men de Sá Moreira de Souza Filho, Nicodemos Moreira dos Santos Junior, Odílio Benedito Garrido de Assis, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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149. | | CRUZ, C. C. T. da; PEREIRA, E. I.; SATO, P. S.; GUIMARÃES, G. G. F.; SOUZA, G. B. de; BERNARDI, A. C. de C.; OLIVEIRA, C. R. de. Analysis of NH3-N slow release systems for fiber digestibility of low-quality forage: in vitro approach. Scientia Agricola, v. 77, n. 5, e20180005, dec. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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152. | | LASSO, P. R. O.; GUANOR, J. R. do; BERNARDI, A. C. de C.; VAZ, C. M. P.; OLIVEIRA, C. R. de; BACCHI, O. O. S. Avaliação da utilização de resíduos de construção e demolição reciclados (RCD-R) como condicionador de solos. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 2., 2010, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária: Embrapa Pecuária Sudeste, 2010. p. 40. (Embrapa Instrumentação Agropecuária. Documentos, 50).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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153. | | LASSO, P. R. O.; GUANOR, J. R. do; CARDOSO, R. D.; BERNARDI, A. C. de C.; VAZ, C. M. P.; OLIVEIRA, C. R. de; BACCHI, O. O. S. Avaliação da utilização de resíduos de construção e demolição reciclados (RCD-R) como corretivos de acidez do solo. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 2., 2010, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária: Embrapa Pecuária Sudeste, 2010. p. 41. (Embrapa Instrumentação Agropecuária. Documentos, 50).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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156. | | GUIMARÃES, G. G. F.; PEREIRA, E. I.; NOGUEIRA, A. R. A.; CRUZ, C. C. T.; FOSCHINI, M. M.; BERNARDI, A. C. C.; OLIVEIRA, C. R. de. Liberação controlada de ureia proveniente de nanocompósitos reduz a volatização de amônia e aumenta a eficiência do uso de nitrogênio pela planta. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 9., 2017, São Carlos. Anais ... São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2017. p.471-474. Editores: Caue Ribeiro de Oliveira, Elaine Cristina Paris, Luiz Henrique Capparelli Mattoso, Marcelo Porto Bemquerer, Maria Alice Martins, Odílio Benedito Garrido de Assis.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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157. | | BYZYNSKI, G.; MELO, C.; VOLANTI, D. P.; FERRER, M. M.; GOUVEIA, A. F.; OLIVEIRA, C. R. de; ANDRÉS, J.; LONGO, E. The interplay between morphology and photocatalytic activity in ZnO and N-doped ZnO crystals. In: Materials and Design, v. 120, 2017. 363-375Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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160. | | ZANETTE, R.; ALMEIDA, L. B. F.; SOUZA, N. L. G. D.; ALMEIDA, C. G.; OLIVEIRA, L. F. C.; OLIVEIRA, C. R. de; BRANDÃO, H. M.; MUNK, M. Preparação, caracterização e citocompatibilidade de filmes nanocompósitos de quitosana e nanofibras de celulose. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 9., 2017, São Carlos. Anais ... São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2017. p. 283-286. Editores: Caue Ribeiro de Oliveira, Elaine Cristina Paris, Luiz Henrique Capparelli Mattoso, Marcelo Porto Bemquerer, Maria Alice Martins, Odílio Benedito Garrido de Assis.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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