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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/07/2013 |
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Data da última atualização: |
19/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. de O.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. de C.; SOUZA JR. M. L T.; MATSUMOTO, T.; AZEVEDO, V. C. R.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; CAVALCANTE, M. de J. B.; BAURENS, F.-C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PIGNOLET, L.; ABADIE, C.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. |
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Afiliação: |
MARCO A. N. PASSOS, UNB; VIVIANE DE OLIVEIRA CRUZ, UNB; FLAVIA L. EMEDIATO, UNB; CRISTIANE DE CAMARGO TEIXEIRA, UCB; MANOEL T. SOUZA JR., UCB; TAKASHI MATSUMOTO, National Institute of Agrobiological Resources; VANIA CRISTINA RENNO AZEVEDO, CENARGEN; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; LUCIO FLAVIO DE ALENCAR FIGUEIREDO, UNB; NATALIA FLORENCIO MARTINS, CENARGEN; MARIA DE JESUS BARBOSA CAVALCANTE, DPD; FRANC-CHRISTOPHE BAURENS, CIRAD; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, CENARGEN; GEORGIOS JOANNIS PAPPAS JUNIOR, CENARGEN; LUC PIGNOLET, CIRAD; CATHERINE ABADIE, CIRAD; ANA Y. CIAMPI; PIETRO PIFFANELLI, Genomics Platform at Parco Tecnologico Padano; ROBERT N.G. MILLER, UNB. |
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Título: |
Development of expressed sequence tag and EST-SSR marker resources for Musa acuminata. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
AOB Plants, 2012. |
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ISSN: |
2041-2851 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
(Open Access). |
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Conteúdo: |
Background and aims: Banana (Musa acuminata) is a crop contributing to global food security. Many varieties lack resistance to biotic stresses, due to sterility and narrow genetic background. The objective of this study was to develop an expressed sequence tag (EST) database of transcripts expressed during compatible and incompatible banana-Mycosphaerella fijiensis (Mf) interactions. Black leaf streak disease (BLSD), caused by Mf, is a destructive disease of banana. Microsatellite markers were developed as a resource for crop improvement. Methodology: cDNA libraries were constructed from in vitro-infected leafes from BLSD-resistant M. acuminata ssp. burmaniccoides Calcutta 4 (MAC4) and susceptible M. acuminata cv. Cavendish Grande Naine (MACV). Clones were 5´end Sanger sequenced, ESTs assembled with TGICL and unigenes annotated using BLAST, Blast2GO and InterProScan. Mreps was used to screen for simple sequence repeats (SSRs), with markers evaluated for polymorphism using twenty diploid (AA) M. acuminata accessions contrasting in resistance to Mycosphaerella leaf spot diseases. Principal results: A total of 9333 high quality ESTs were obtained for MAC4 and 3964 for MACV, which assembled into 3995 unigenes. Of these, 2592 displayed homology to genes encoding proteins with known or putative function, and 266 to genes encoding proteins with unknown function. Gene ontology (GO) classification identified 543 GO terms, 2300 unigenes were assigned to EuKaryotic Orthologous Groups (KOG) categories and 312 mapped to KEGG pathways. A total of 624 SSR loci were identified, with trinucleotide repeat motifs the most abundant in MAC4 (54.1%) and MACV Downloaded from http://aobpla.oxfordjournals.org/ at Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária on July 12, 2013 4 (57.6%). Polymorphism across M. acuminata accessions was observed with 75 markers. Alleles per polymorphic locus ranged from 2 to 8, totaling 289. Polymorphism information content (PIC) ranged from 0.08 to 0.81. Conclusions: This EST collection offers a resource for studying functional genes, including transcripts expressed in banana-Mf interactions. Markers are applicable for genetic mapping, diversity characterization and marker assisted breeding. MenosBackground and aims: Banana (Musa acuminata) is a crop contributing to global food security. Many varieties lack resistance to biotic stresses, due to sterility and narrow genetic background. The objective of this study was to develop an expressed sequence tag (EST) database of transcripts expressed during compatible and incompatible banana-Mycosphaerella fijiensis (Mf) interactions. Black leaf streak disease (BLSD), caused by Mf, is a destructive disease of banana. Microsatellite markers were developed as a resource for crop improvement. Methodology: cDNA libraries were constructed from in vitro-infected leafes from BLSD-resistant M. acuminata ssp. burmaniccoides Calcutta 4 (MAC4) and susceptible M. acuminata cv. Cavendish Grande Naine (MACV). Clones were 5´end Sanger sequenced, ESTs assembled with TGICL and unigenes annotated using BLAST, Blast2GO and InterProScan. Mreps was used to screen for simple sequence repeats (SSRs), with markers evaluated for polymorphism using twenty diploid (AA) M. acuminata accessions contrasting in resistance to Mycosphaerella leaf spot diseases. Principal results: A total of 9333 high quality ESTs were obtained for MAC4 and 3964 for MACV, which assembled into 3995 unigenes. Of these, 2592 displayed homology to genes encoding proteins with known or putative function, and 266 to genes encoding proteins with unknown function. Gene ontology (GO) classification identified 543 GO terms, 2300 unigenes were assigned to EuKaryotic Orthologous Groups (... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Banana; Melhoramento vegetal; Musa Acuminata. |
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Thesaurus Nal: |
Bananas; Breeding; Genetic improvement. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 21 | |
| 1. |  | BARROS, D. V.; GARCIA, A. R.; NAHUM, B. de S.; QUINZEIRO NETO, T. Uso de dispositivo eletrônico para controle e rastreabilidade de búfalos na Amazônia Oriental. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2010, Belém, PA. Bolsista de iniciação científica: um aporte ao desenvolvimento da pesquisa agropecuária: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2010. 1 CD-ROM. PIBIC 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | BARROS, D. V.; GARCIA, A. R.; NAHUM, B. de S.; OLIVEIRA JUNIOR, M. C. M. de; QUINZEIRO NETO, T. Eficiência do implante subcutâneo de transponders para identificação eletrônica de búfalos em diferentes faixas etárias. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 15., 2011, Belém, PA. A ciência de fazer ciência: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2011. 1 CD-ROM. PIBIC-2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | GONÇALVES, A. A.; CASTRO, S. R. S. de; GARCIA, A. R.; SANTOS, A. X.; SILVA, G. R.; BARROS, D. V. Efeito de substâncias antioxidantes no sêmen criopreservado de búfalos (Bubalus bubalis). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE EMBRIÕES, 25., 2011, Cumbuco. Anais... Cumbuco: SBTE, 2011. p. 451.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | SILVA, G. R.; GARCIA, A. R.; CASTRO, S. R. S. de; NAHUM, B. de S.; SANTOS, A. X.; GONÇALVES, A. A.; BARROS, D. V. Avaliação da integridade da membrana espermática de búfalos (Bubalus bubalis) por diferentes técnicas laboratoriais. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE EMBRIÕES, 25., 2011, Cumbuco. Anais... Cumbuco: SBTE, 2011. p. 337.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | BARROS, D. V.; GARCIA, A. R.; SILVA, A. G.; SILVA, A. O.; SOUSA, J. S.; KAHWAGE, P. R.; THOLON, P.; MARTORANO, L. G.; FRANCO, I. M. Avaliação do conforto térmico, parâmetros fisiológicos e seminais de búfalos mantidos em central de inseminação artificial sob clima tropical. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE EMBRIÕES, 28., 2014, Natal. [S.L.]: SBTe, 2014. p. 182| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 6. | | SILVA, L. K. X.; GARCIA, A. R.; MARTORANO, L. G.; FRANCO, I. M.; SILVA, A. O.; SOUSA, J. S.; BARROS, D. V.; FATURI, C. Scrotum surface infrared thermography associated with semen quality of buffaloes (Bubalus bubalis). In: INTERNATIONAL ECOSUMMIT, 5., 2016, Montpellier. Ecological sustainability: Engineering Change. [S.l.]: Elsevier, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 7. | | SILVA, L. K. X. da S.; GARCIA, A. R.; MARTORANO, L. G.; FRANCO, I. M.; SILVA, A. O. A. da; SOUSA, J. S.; BARROS, D. V.; FATURI, C. Scrotum surface infrared thermography associated with semen quality of buffaloes (Bubalus bubalis). In: INTERNATIONAL ECOSUMMIT, 5., 2016, Montpellier, France. Proceedings... Montpellier, France: ESEC, 2016. p. 334.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 8. | | MARINHO NETO, S. P.; BENIGNO, R. N. M.; ALBUQUERQUE, N. I. de; BARROS, D. V.; KAHWAGE, P. R.; GUIMARÃES, D. A. Parasitas gastrointestinais de caititus (Tayassu tajacu) criados em cativeiro. In: CONGRESO INTERNACIONAL SOBRE MANEJO DE FAUNA SILVESTRE EN LA AMAZONIA Y AMERICA LATINA, 9., 2010, Santa Cruz. Libro de resumenes. [Casilla: Museo de Historia Natural Noel Kempff Mercado: Fundación Amigos del Museo Noel Kempff Mercado], 2010. p. 143. IX CIMFAUNA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | BARROS, D. V.; SILVA, L. X.; KAHWAGE, P. R.; SILVA, A. O.; SILVA, A. G.; FRANCO, I. M.; MARTORANO, L. G.; LOURENÇO JUNIOR, J. B.; ROMANELLO, N.; GARCIA, A. R. Assessment of scrotal thermography and semen quality in buffalo bulls (Bubalus bubalis) raised under humid tropical environment. Animal Reproduction., v.12, n.3, p.540,Jul./Sept.2015. p.540 Publicado: Proceedings of the 29th Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE); Gramado, RS, Brazil, August 20th to 23rd, 2015, and 31st Meeting of the European Embryo Transfer Association (AETE); Ghent, Belgium,...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | BARROS, D. V.; SILVA, L. K. X.; KAHWAGE, P. R.; LOURENÇO JUNIOR, J. B.; SOUSA, J. S.; SILVA, A. G. M.; FRANCO, I. M.; MARTORANO, L. G.; GARCIA, A. R. Assessment of surface temperatures of buffalo bulls (Bubalus bubalis) raised under tropical conditions using infrared thermography. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 68, n. 2, p. 422-430, mar./abr. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 11. | | MARTORANO, L. G.; GARCIA, A. R.; SILVA, L. K. X.; AMARAL JÚNIOR, J. M. DO; BARROS, D. V.; RUFINO, J. P. F.; ROCHA, S. L. C. S.; FERNANDES, P. C. C.; OLIVEIRA, P. P. A. Infrared thermography to diagnose bioclimatic conditions in livestock systems in the amazon biome. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W . G. da (ed.). Adapting to climate change: strategies for Brazilian agricultural and livestock systems. Brasília, DF: MAPA, 2021. p.104-105.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 12. | | GARCIA, A. R.; BARROS, D. V.; OLIVEIRA JUNIOR, M. C. M. de; BARIONI JUNIOR, W.; SILVA, J. A. R. da; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; PESSOA, J. dos S. Innovative use and efficiency test of subcutaneous transponders for electronic identification of water buffaloes. Tropical Animal Health and Production, v. 52, p. 3725-3733, nov. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 13. | | SILVA, L. K. X.; GARCIA, A. R.; SILVA, A. O. A. da; SOUSA, J. S. de; BARROS, D. V.; SILVA, A. G. M. e; REIS, A. N. dos; MARTORANO, L. G.; LOUREÇO JÚNIOR, J. de B. Correlações entre parâmetros seminais de touros bubalinos em central de inseminação artificial. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 10.; SEMANA DO MÉDICO VETERINÁRIO DO PARÁ, 37.; SIMPÓSIO PARAENSE DE MEDICINA VETERINÁRIA, 5., 2013, Belém. Anais... Belém: Associação Brasileira de Buiatria, 2013 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 14. | | GARCIA, A. R.; SILVA, L. K. X.; BARROS, D. V.; MARTORANO, L. G.; NAHUM, B. de S.; SILVA, A. O. A.; SOUSA, J. S.; SILVA, A. G. M.; REIS, A. N. Avaliação da correlação entre parâmetros seminais de bubalinos (Bubalus bubalis) e variáveis climáticas em ambiente tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 20., 2013, Uberlândia, MG. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2013. p. 206.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 15. | | BARROS, D. V.; SILVA, L. K. X.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; SILVA, A. O. A. da; SILVA, A. G. M. e; FRANCO, I. M.; OLIVEIRA, C. M. C.; THOLON, P.; MARTORANO, L. G.; GARCIA, A. R. Evaluation of thermal comfort, physiological, hematological, and seminal features of buffalo bulls in an artificial insemination station in a tropical environment. Tropical Animal Health and Production, v. 47, n.5, p. 805-813, june 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 16. | | BARROS, D. V.; GARCIA, A. R.; SILVA, A. G.; SILVA, A. O.; SOUSA, J. S.; SILVA, L. X.; KAHWAGE, P. R.; THOLON, P.; MARTORANO, L. G.; FRANCO, I. M. Evaluation of thermal comfort, physiological and seminal parameters of buffaloes kept in artificial insemination center under tropical climate. Animal Reproduction, v.11, n.3, p.291, jul./set.2014. 291 Proceedings of the 28th Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE), August 14 to 17th, 2014, Natal, TN, Brazil.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 17. | | BARROS, D. V.; SILVA, L. X.; KAHWAGE, P. R.; SILVA, A. O.; A. G.; FRANCO, I. M.; MARTORANO, L. G.; LOURENÇO JUNIOR, J. DE B.; ROMANELLO, N.; GARCIA, A. R. Avaliação termográfica escrotal e qualidade seminal de touros bubalinos (Bubalus bubalis) mantidos em ambiente tropical úmido. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE EMBRIÕES, 29., 2015, Gramado. Anais... [S.l.]: SBTE, 2015. p. 190.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 18. | | SILVA, L. K. X.; BARROS, D. V.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; SILVA, A. O. A. da; SOUSA, J. S. de; FATURI, C.; PANTOJA, M. H. de A.; BOTTA, D.; GARCIA, A. R. Temperaturas de superfície escrotal avaliadas por termografia de infravermelho e qualidade seminal de touros bubalinos em condições de clima tropical úmido. In: REUNIÃO DA ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DE ANDROLOGIA ANIMAL, 2., 2017, Uberlândia, MG. Anais... Corumbá: Embrapa Pantanal, 2017. p. 187-190. (Embrapa Pantanal. Documentos, 146)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 19. | | MARTORANO, L. G.; GARCIA, A. R.; SILVA, L. K. X.; AMARAL JÚNIOR, J. M. DO; BARROS, D. V.; RUFINO, J. P. F.; ROCHA, S. L. C. S.; FERNANDES, P. C. C.; OLIVEIRA, P. P. A. Termografia infravermelho para diagnosticar condições bioclimáticas em sistemas pecuários no Bioma Amazônia. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W. G. da. Estratégias de adaptação às mudanças do clima dos sistemas agropecuários brasileiros. Brasília, DF: MAPA, 2021. p.104-105.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 20. | | SILVA, L. K. X.; SOUSA, J. S.; SILVA, A. O. A.; LOURENÇO JUNIOR, J. B.; FATURI, C.; MARTORANO, L. G.; FRANCO, I. M.; PANTOJA, M. H. A.; BARROS, D. V.; GARCIA, A. R. Testicular thermoregulation, scrotal surface temperature patterns and semen quality of water buffalo bulls reared in a tropical climate. Andrologia, v. 50, n. 2, e12836, Mar. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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