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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
16/12/2008 |
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Data da última atualização: |
15/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KUSER, P.; CUPRI, F.; BLEICHER, L.; POLIKARPOV, I. |
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Afiliação: |
PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; FÁBIO CUPRI, Laboratório Nacional de Luz Síncrotron; LUCAS BLEICHER, USP; IGOR POLIKARPOV, USP. |
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Título: |
Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: a classical "induced fit" example revised. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Proteins, v. 72, n. 2, p. 731-740, 2008. |
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DOI: |
10.1002/prot.21956 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Hexokinase is the first enzyme in the glycolytic pathway that catalyzes the transfer of a phosphoryl group from ATP to glucose to form glucose-6-phosphate and ADP. Two yeast hexokinase isozymes are known, namely PI and PII. Here we redetermined the crystal structure of yeast hexokinase PI from Saccharomyces cerevisiae as a complex with its substrate, glucose, and refined it at 2.95 A resolution. Comparison of the holo-PI yeast hexokinase and apo-hexokinase structures shows in detail the rigid body domain closure and specific loop movements as glucose binds and sheds more light on structural basis of the "induced fit" mechanism of reaction in the HK enzymatic action. We also performed statistical coupling analysis of the hexokinase family, which reveals two co-evolved continuous clusters of amino acid residues and shows that the evolutionary coupled amino acid residues are mostly confined to the active site and the hinge region, further supporting the importance of these parts of the protein for the enzymatic catalysis. |
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Palavras-Chave: |
Estrutura cristalina; Estrutura de raio-X de hexoquinase; Hexokinase X-ray structure; Statistical coupling analysis. |
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Thesagro: |
Análise estatística; Glicose; Saccharomyces Cerevisiae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 01831naa a2200253 a 4500
001 1009610
005 2020-01-15
008 2008 bl uuuu u00u1 u #d
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100 1 $aKUSER, P.
245 $aCrystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose$ba classical "induced fit" example revised.$h[electronic resource]
260 $c2008
520 $aHexokinase is the first enzyme in the glycolytic pathway that catalyzes the transfer of a phosphoryl group from ATP to glucose to form glucose-6-phosphate and ADP. Two yeast hexokinase isozymes are known, namely PI and PII. Here we redetermined the crystal structure of yeast hexokinase PI from Saccharomyces cerevisiae as a complex with its substrate, glucose, and refined it at 2.95 A resolution. Comparison of the holo-PI yeast hexokinase and apo-hexokinase structures shows in detail the rigid body domain closure and specific loop movements as glucose binds and sheds more light on structural basis of the "induced fit" mechanism of reaction in the HK enzymatic action. We also performed statistical coupling analysis of the hexokinase family, which reveals two co-evolved continuous clusters of amino acid residues and shows that the evolutionary coupled amino acid residues are mostly confined to the active site and the hinge region, further supporting the importance of these parts of the protein for the enzymatic catalysis.
650 $aAnálise estatística
650 $aGlicose
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653 $aStatistical coupling analysis
700 1 $aCUPRI, F.
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700 1 $aPOLIKARPOV, I.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 2. |  | SILVA, C. F. da; PINTO, L. A. da S. R.; PEREIRA, M. G.; TEODORO, S. A.; FONTES, M. A. B-Glucosidase and total organic carbon as indicators of the erosion stabilization process of gullies in ?Mar de Morros? environment, Rio de Janeiro, Brazil. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 21., 2018, Rio de Janeiro. Soil science: beyond food and fuel: abstracts. Viçosa, MG: SBCS, 2018. Não paginado. WCSS 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 3. | | SILVA, C. F. da; PINTO, L. A. da S. R.; PEREIRA, M. G.; TEODORO, S. A.; FONTES, M. A. B-Glucosidase and total organic carbon as indicators of the erosion stabilization process of gullies in Mar de Morros environment, Rio de Janeiro, Brazil. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 21., 2018, Rio de Janeiro. Soil science: beyond food and fuel: proceedings... Viçosa: SBCS, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 4. | | SILVA, G. M.; KESTRING, D. R.; FONTES, M. A.; ALONSO, J. M.; SANTOS, G. S. dos; STRALIOTTO, R. Bioanálise aplicada à qualidade do solo de pastagens da Região Médio Paraíba do Sul. In: SEMINÁRIO PIBIC EMBRAPA SOLOS, 2021-2024, Rio de Janeiro. Seminários Pibic Embrapa Solos 2021-2024: resumos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2025. p. 154-160. (Embrapa Solos. Eventos técnicos & científicos, 2).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 5. | | FONTES, M. A.; ROCHA, P. VAZ da; LIMA, K. D. R. de; MARANHÃO, D. D. C.; CAMPELLO, E. F. C.; RESENDE, A. S. de. Fracionamento da matéria orgânica em áreas degradadas pela extração de piçarr na caatinga, RN In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 6. | | LIMA, K. D. R. de; LIMA, I. S. de S. de; FONTES, M. A.; CHAER, G. M.; CAMPELLO, E. F. C. Bioindicadores de qualidade do solo em área degradada pela extração de piçarra na caatinga, RN In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 7. | | ROCHA, F. I.; RIBEIRO, T. G.; FONTES, M. A.; SCHWAB, S.; COELHO, M. R. R.; LUMBRERAS, J. F.; MOTTA, P. E. F. da; TEIXEIRA, W. G.; COLE, J.; BORSANELLI, A. C.; DUTRA, I. dos S.; HOWE, A.; OLIVEIRA, A. P. de; JESUS, E. da C. Land-use system and forest floor explain prokaryotic metacommunity structuring and spatial turnover in amazonian forest-to-pasture conversion areas. Frontiers in Microbiology, v. 12, 657508, Apr. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Solos. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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