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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
20/03/2012 |
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Data da última atualização: |
25/06/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P.; ACOSTA, J. J.; PETER, G. F.; DAVIS, J. M.; GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; KIRST, M. |
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Afiliação: |
MÁRCIO F. R. JÚNIOR RESENDE, University of Florida; University of Florida; University of Florida; University of Florida; UFV; DARIO GRATTAPAGLIA, CENARGEN; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; University of Florida. |
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Título: |
Accelerating the domestication of trees using genomic selection: accuracy of prediction models across ages and environments. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
New Phytologist, v. 193, p. 617-624, 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic selection is increasingly considered vital to accelerate genetic improvement. However, it is unknown how accurate genomic selection prediction models remain when used across environments and ages. This knowledge is critical for breeders to apply this strategy in genetic improvement. Here, we evaluated the utility of genomic selection in a Pinus taeda population of c. 800 individuals clonally replicated and grown on four sites, and genotyped for 4825 singlenucleotide polymorphism (SNP) markers. Prediction models were estimated for diameter and height at multiple ages using genomic random regression best linear unbiased predictor (BLUP). Accuracies of prediction models ranged from 0.65 to 0.75 for diameter, and 0.63 to 0.74 for height. The selection efficiency per unit time was estimated as 53?112% higher using genomic selection compared with phenotypic selection, assuming a reduction of 50% in the breeding cycle. Accuracies remained high across environments as long as they were used within the same breeding zone. However, models generated at early ages did not perform well to predict phenotypes at age 6 yr. These results demonstrate the feasibility and remarkable gain that can be achieved by incorporating genomic selection in breeding programs, as long as models are used at the relevant selection age and within the breeding zone in which they were estimated. |
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Palavras-Chave: |
Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Pinus Taeda. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aGenomic selection is increasingly considered vital to accelerate genetic improvement. However, it is unknown how accurate genomic selection prediction models remain when used across environments and ages. This knowledge is critical for breeders to apply this strategy in genetic improvement. Here, we evaluated the utility of genomic selection in a Pinus taeda population of c. 800 individuals clonally replicated and grown on four sites, and genotyped for 4825 singlenucleotide polymorphism (SNP) markers. Prediction models were estimated for diameter and height at multiple ages using genomic random regression best linear unbiased predictor (BLUP). Accuracies of prediction models ranged from 0.65 to 0.75 for diameter, and 0.63 to 0.74 for height. The selection efficiency per unit time was estimated as 53?112% higher using genomic selection compared with phenotypic selection, assuming a reduction of 50% in the breeding cycle. Accuracies remained high across environments as long as they were used within the same breeding zone. However, models generated at early ages did not perform well to predict phenotypes at age 6 yr. These results demonstrate the feasibility and remarkable gain that can be achieved by incorporating genomic selection in breeding programs, as long as models are used at the relevant selection age and within the breeding zone in which they were estimated.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 47 | |
| 7. |  | MATTOS, M. L. T.; ANDRES, A.; SANTOS, I. M. B.; ANSELMO, J. Comportamento ambiental do herbicida clomazona na tecnologia Permit em lavoura de arroz irrigado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 2, p. 471-473| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | MATTOS, M. L. T.; GOMES, A. da S.; SANTOS, I. M. B. Isolamento e caracterização de bactérias endofiticas do colmo da cultivar de arroz irrigado BRS Pelota. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | MATTOS, M. L. T.; ANDRES, A.; SILVA, C. A. S. da; SANTOS, I. M. B. dos. Residual do herbicida atrazina aplicado em milho no solo e na água de irrigação de cultivo subseqüente de arroz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 2, p. 373-375| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 18. | | ALMEIDA, M. T.; SZCZEPANIAK, R. F.; SANTOS, I. M. B.; GALARZ, L. A.; MATTOS, M. L. T. Análise de carbono da biomassa microbiana do solo utilizando a técnica de digestão em banho maria. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18., MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 8., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: UCPel, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 19. | | MATTOS, M. L. T.; MARTINS, J. F. da S.; CUNHA, U. S. da; SANTOS, I. M. B. dos. Aspectos microbiológicos e ambientais do inseticida carbosulfano em lavoura de arroz irrigado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 2, p. 376-378| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| Registros recuperados : 47 | |
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