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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
05/01/2012 |
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Data da última atualização: |
19/07/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. |
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Afiliação: |
FRANCELI R. KULCHESKI, UFRGS; LUIZ F. V. DE OLIVEIRA, UFRGS; LORRAYNE G. MOLINA, UFRGS; MAURÍCIO P. ALMERÃO, UFRGS; FABIANA A. RODRIGUES; JULIANA MARCOLINO; JOICE F. BARBOSA; RENATA STOLF MOREIRA; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; LEANDRO C. NASCIMENTO, UNICAMP; MARCELO F. CARAZZOLLE, UNICAMP; GONÇALO A. G. PEREIRA, UNICAMP; ROGÉRIO MARGIS, UFRGS. |
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Título: |
Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 12, article 307, jun. 2011. |
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Páginas: |
17 p. |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-12-307 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also different for the distinct genotypes submitted to the pathogen stress. Most miRNAs were down regulated during the fungus infection in the susceptible genotype; however, in the resistant genotype, most miRNAs did not vary during rust attack. A prediction of the putative targets was carried out for conserved and novel miRNAs families. Conclusions: Validation of our results with quantitative RT-qPCR revealed that Solexa sequencing is a powerful tool for miRNA discovery. The identification of differentially expressed plant miRNAs provides molecular evidence for the possible involvement of miRNAs in the process of water deficit- and rust-stress responses. MenosBackground: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also di... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Deficiência hídrica; Gene marcador; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Soil water deficit; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
LEADER 03244naa a2200385 a 4500
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005 2024-07-19
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520 $aBackground: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also different for the distinct genotypes submitted to the pathogen stress. Most miRNAs were down regulated during the fungus infection in the susceptible genotype; however, in the resistant genotype, most miRNAs did not vary during rust attack. A prediction of the putative targets was carried out for conserved and novel miRNAs families. Conclusions: Validation of our results with quantitative RT-qPCR revealed that Solexa sequencing is a powerful tool for miRNA discovery. The identification of differentially expressed plant miRNAs provides molecular evidence for the possible involvement of miRNAs in the process of water deficit- and rust-stress responses.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 2. |  | MOURA NETO, J. B. de; MOREIRA, J. N.; AZEVEDO, S. G. de; ARAÚJO, C. R. de; FRANÇA, C. A. de. Avaliação econômica e de desempenho de quatro rações utilizadas na engorda de ovinos para o semi-árido. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 3. | | MOURA NETO, J. B. de; MOREIRA, J. N.; AZEVEDO, S. G. de; ARAÚJO, C. R. de; FRANÇA, C. A. de. Avaliação econômica de três rações utilizadas na alimentação ovinos em confinamento, em um sistema de pesquisa participativa, em Dormentes-PE. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 6. | | MOREIRA, J. N.; VOLTOLINI, T. V.; MOURA NETO, J. B. de; SANTOS, R. D. dos; FRANÇA, C. A. de; ARAUJO, G. G. L. de. Alternativas de volumosos para caprinos em crescimento. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 9, n. 3, p. 407-415, jul./set. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | MOURA NETO, J. B.; PEREIRA, L. G. R.; CHIZZOTTI, M. L.; YAMAMOTO, S. M.; ARAGÃO, A dos S. L.; MASCIOLI, A. dos S. Componentes constituintes e não constituintes da carcaça de cordeiros Santa Inês alimentados com farelo de manga em substituição ao milho. Semina: Ciências Agrárias, v. 35, n. 1, p. 437-448, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | MENEZES, D. R.; ARAUJO, G. G. L. de; CHAGAS, E. C. de O.; MOURA NETO, J. B. de; DANTAS, F. R.; JESUS, L. S. de. Composição química, fracionamento da proteína e digestibilidade in vitro do mamãozinho-de-veado (Jacaratia corumbensis O. kuntze). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. O avanço científico e tecnológico na produção animal: anais. Jaboticabal: UNESP, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 9. | | SANTOS, M. R. A.; SILVA, K. M.; MOURA NETO, J. B. de; AZEVEDO, H. C.; GUIMARAES, J. de O.; NUNES, L. A. Caracterização de conformação corporal do ecótipo Berganês. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais... Salvador: SBMA, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 10. | | SANTOS, M. R. A.; AZEVEDO, H. C.; MOURA NETO, J. B.; ALMEIDA, E. C. de J.; ARAUJO, J. I. M.; CARNEIRO, P. L. S. Caracterização racial de ovinos Berganês via morfometria geométrica. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais... Salvador: SBMA, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 11. | | MOURA NETO, J. B. de; MASCIOLI, A. dos S.; PEREIRA, L. G. R.; YAMAMOTO, S. M.; CHIZZOTTI, M. L.; QUEIROGA, R. de C. R. do E. Avaliação sensorial da carne de cordeiros Santa Inês alimentados com dietas contendo farelo de manga em substituição ao milho. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | VOLTOLINI, T. V.; MOREIRA, J. N.; SANTOS, R. D. dos; MOURA NETO, J. B. de; PEREIRA, L. G. R.; RODRIGUES, P. F. Inclusão parcial e total de raspa de mandioca na porção energética de rações para caprinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 45., 2008, Lavras. Biotecnologia e sustentabilidade: anais. Lavras: UFLA: SBZ, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 13. | | MASCIOLI, A. dos S.; MOURA NETO, J. B. de; PEREIRA, L. G. R.; YAMAMOTO, S. M.; ARAGÃO. A. S. L. de; CHIZZOTTI, M. L.; SANTOS, G. A. Efeito do farelo do fruto da manga na composição tecidual do lombo de ovinos Santa Inês. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 14. | | MOREIRA, J. N.; CHAGA, E. C. de O.; ARAUJO, G. G. L. de; MOURA NETO, J. B. de; ALVES, M. J. Desempenho de novilhos Sindi em pastagem de capim buffel suplementados com diferentes fontes de proteína, no Sertão de Pernambuco. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | SILVA, J. R. R.; MISTURA, C.; ARAUJO, G. G. L. de; PORTO, E. R.; VOLTOLINI, T. V.; MOURA NETO, J. B. de; LOPES, R. S. Parâmetros estruturais da erva-sal cultivada em diferentes espaçamentos e irrigada com rejeito de dessalinizadores no semi-árido. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 16. | | MASCIOLI, A. dos S.; MOURA NETO, J. B. de; PEREIRA, L. G. R.; YAMAMOTO, S. M.; ARAGÃO, A. S. L. de; CHIZZOTTI, M. L.; SANTOS, G. A. Rendimento dos componentes não-carcaça de ovinos Santa Inês alimentados com farelo do fruto da manga. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | SILVA FILHO, J. R. V. da; MOURA NETO, J. B. de; CHAGAS, E. C. de O.; SANTOS, L. T. A. dos; SOUZA, J. I. R. de; QUEIROZ, M. A. A.; RODRIGUES, R. T. de S.; VOLTOLINI, T. V. Berganês, a new sheep breed from the Brazilian semiarid: performance and carcass traits in different sex-classes by univariate and multivariate approaches. Acta Scientiarum. Animal Sciences, v. 46, e64120, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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| 19. | | SILVA FILHO, J. R. da; MOURA NETO, J. B. de; SANTOS, L. T. A. dos; FERREIRA, C. O.; RODRIGUES, R. T. de S.; ARANDAS, J. K. G.; RIBEIRO, M. N.; VOLTOLINI, T. V. Factorial and discriminant analysis on non-carcass components of Berganês lambs from different sexual classes and crossbreeding. Journal of Agricultural Science, v. 154, n. 3/4,p. 304-313, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | SILVA FILHO, J. R. V. da; MOURA NETO, J. B. de; ARANDAS, J. K. G.; SANTOS, L. T. A. dos; QUEIROZ, M. A. A.; NOGUEIRA FILHO, P. A. de; VOLTOLINI, T. V.; MESQUITA, F. L. T. de; CARVALHO, F. F. R. de; RIBEIRO, M. N. Does crossbreeding improve the performance and carcass traits of Berganês sheep? Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 5, 451, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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