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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
01/03/2011 |
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Data da última atualização: |
04/03/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PRIOLLI, R. H. G.; RAMOS, L. C. S.; POT, D.; MOLLER, M.; GALLO, P. B.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F.; YAMAMOTO, P. Y.; LANNES, S. D.; FERREIRA, L. P.; SCHOLZ, M. B. S.; MAZZAFERA, P.; PEREIRA, L. F. P.; COLOMBO, L. F. P. |
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Afiliação: |
ESALQ/USP; IAC; IAPAR/CIRAD; IAC; IAC; ESALQ/USP; EEALQ/USP; IAC; IAPAR; IAPAR; IAPAR; UNICAMP; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; IAC. |
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Título: |
Construction of a genetic map based on an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora and its usefulness for quality related traits. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for more complete coverage of the coffee genome. MenosGenetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genetic maps. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica; Coffea Canephora. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aGenetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for more complete coverage of the coffee genome.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 16 | |
| 2. |  | De BONI, L. FONSECA, R. D. CARDOSO, K. R. A. GROVA, I. AKCELRUD, L.; CORREA, D. S.; MENDONÇA, C. R. Characterization of two- and three-photon absorption of polyfluorene derivates. Journal of Polymer Science: part B: Polymer Physics, New York, v. 52, p. 747-754, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 6. | | GONÇALVES, P. J.; CORREA, D. S.; FRANZEN, P. L.; DE BONI, L.; ALMEIDA, L. M.; MENDONÇA, C. R.; BORISSEVITCH, I. E.; ZILIO, S. C. Effect of interaction with micelles on the excited-state optical properties of zinc porphyrins and J-aggregates formation. Spectrochimica Acta Part A Molecular and Biomolecular Spectroscopy, Amsterdan, v. 112, p. 203-317, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 7. | | BARBOSA NETO, N. M.; CORREA, D. S.; DE BONI, L.; PARRA, G. C.; MISOGUTI, L.; MENDONÇA, C. R.; BORISSEVITCH, I. E.; ZÍLIO, S. C.; GONÇALVES, P. J. Excited states absorption spectra of porphyrins - Solvent effects. Chemical Physics Letters, Amsterdam, v. 587, p. 118-123, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 8. | | ROQUE, A. P.; OLIVEIRA, J. A.; SCAGION, V. P.; OLIVEIRA, J. E.; DE BONI, L.; MENDONÇA, C. R.; MATTOSO, L. H. C.; CORREA, D. S. Emprego da eletrofiação na produção de micro e nanofibras de polimetilmetacrilato. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 74. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 9. | | ROQUE, A. P. MERCANTE, L. A. SCAIGON, V. P. OLIVEIRA, J. E.; MATTOSO, L. H. C.; De BONI, L. MENDONCA, C. R.; CORREA, D. S. Fluorescent PMMA/MEH-PPV electrospun nanofibers: investigation of morphology, solvent, and surfactant effect. Journal of Polymer Science: part B: Polymer Physics, New York, v. 52, p. 1388-1394, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 10. | | ROQUE, A. P.; SCAGION, V. P.; OLIVEIRA, J. E.; DE BONI, L.; MENDONÇA, C. R.; MATTOSO, L. H. C.; CORREA, D. S. Fibras micro e sub-micrométricas de PMMA contendo polímero eletroluminescente: caracterização das propriedades morfológicas e ópticas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE POLÍMEROS, 12., 2013, Florianópolis. Anais... São Carlos: ABPol, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 11. | | MERCANTE, L. A.; ROQUE, A. P.; SCAIGON, V. P.; OLIVEIRA, J. E.; MATTOSO, L. H. C.; De BONI, L.; MENDONÇA, C. R.; CORREA, D. S. Propriedades morfológicas e ópticas de nanofibras fluorescentes de PMMA/MEH-PPV. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 403-406. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 12. | | ROQUE, A. P.; MERCANTE, L. A.; SCAGION, V. P.; OLIVEIRA, J. E.; MATTOSO, L. H. C.; DE BONI, L.; MENDONÇA, C. R.; CORREA, D. S. Micro-e nanofibras de polimetilmetacrilato contendo o polímero luminescente MEH-PPV. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 8, 2014, Juiz de fora. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação; Campo Grande: Embrapa Gado de Corte; Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2014. p. 45-47. Editores: Maria Alice Martins, Humberto de Mello Brandão, Marlene de Barros Coelho, Daniel Souza Corrêa, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 13. | | ROQUE, A. P.; OLIVEIRA, J. A.; SCAGION, V. P.; OLIVEIRA, J. E.; DE BONI, L.; MENDONÇA, C. R.; MATTOSO, L. H. C.; CORREA, D. S. Micro- E nanofibras de polimetilmetacrilato de diferentes morfologias obtidas por eletrofiação. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 7.; ESCOLA DE NANOTECNOLOGIA, 3., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2013. p. 428-429 Editores: Maria Alice Martins, Odílio Benedito Garrido de Assis, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso. CD-ROM. Editores: Maria Alice Martins, Odílio Benedito Garrido de Assis, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 14. | | SILVA, D. L.; DE BONI, L.; CORREA, D. S.; COSTA, S. C. S.; HIDALGO, A. A.; ZILIO, S. C.; CANUTO, S.; MENDONÇA, C. R. Two-photon absorption in oxazole derivatives: an experimental and quantum chemical study. Optical Materials, Amsterdam, v. 34, n. 7, p.1013-1018, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 15. | | CORREA, D. S.; DE BONI, L.; NOWACKI, B.; GROVA, I.; FONTES, B. D.; RODRIGUES, P. C.; TOZONI, J. R.; AKCELRUD, L.; MENDONÇA, C. R. Two-photon excitation and optical limiting in polyfluorene derivatives. Journal of Polymer Science: part B: Polymer Physics, New York, v. 50, p. 148-153, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 16. | | PARRA, G. G.; CORREA, D. S.; SILVEIRA-ALVES JUNIOR, E.; ALMEIDA, L. M.; SOUZA, M. A. R.; DE BONI, L.; MISOGUTI, L.; MENDONÇA, C. R.; ZÍLIO, S. C.; BARBOSA NETO, N. M.; BORISSEVITCH, I. E.; GONÇALVES, P. J. Effects of meso-tetrakis (4-sulfonatophenyl) porphyrin (TPPS4) aggregation on its spectral and kinetic characteristics and singlet oxygen production. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, v. 261, e120063, 2021. 1-7| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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