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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
20/04/2006 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
YAMAGISHI, M. E. B.; BEZERRA, G. B. P.; QUINALIA, T.; KUSER, P. R.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; CRUZ, S. A. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; NESHICH, G.; RAY, N.; MAIGRET, B. |
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Afiliação: |
MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; GEORGE B. P. BEZERRA; THIAGO QUINALIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSÉ GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; SÉRGIO APARECIDO BRAGA DA CRUZ, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA; NICHOLAS RAY, Inria Lorraine; BERNARD MAIGRET, Universite Henri Poincare. |
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Título: |
An interative protein interface surface Java Viewer. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. |
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Páginas: |
p. 17. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-meeting 2005. Presented posters. |
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Conteúdo: |
More than 50% of protein structures deposited in the PDB database have two or more chains according to the PDB Metrics1 software. Therefore, there are a plenty of protein complexes in the PDB database. It is important to understand the physical-chemical forces that are involved in protein complexes aggregation. In order to facilitate this analyze, it would be desirable to get two protein chains and visualize their contact interface surfaces separately, and paint over each one of them a common physical-chemical property that could be important in the complex formation. Using weighted Delaunay triangulation and marching tetrahedra algorithms from the CGAL library these contact interface surfaces were generated and rendered in an Interactive Java Viewer based on JavaView2 library. The surfaces can be rotated, translated, scaled and it is possible to identify from which amino acid a given vertice came from, among other useful features. All the physical-chemical parameters available in Java Protein Dossier - JPD can be used to paint the surfaces facilitating the analyses. |
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Palavras-Chave: |
Interface; Java. |
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Thesagro: |
Proteína. |
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Thesaurus Nal: |
Proteins. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aMore than 50% of protein structures deposited in the PDB database have two or more chains according to the PDB Metrics1 software. Therefore, there are a plenty of protein complexes in the PDB database. It is important to understand the physical-chemical forces that are involved in protein complexes aggregation. In order to facilitate this analyze, it would be desirable to get two protein chains and visualize their contact interface surfaces separately, and paint over each one of them a common physical-chemical property that could be important in the complex formation. Using weighted Delaunay triangulation and marching tetrahedra algorithms from the CGAL library these contact interface surfaces were generated and rendered in an Interactive Java Viewer based on JavaView2 library. The surfaces can be rotated, translated, scaled and it is possible to identify from which amino acid a given vertice came from, among other useful features. All the physical-chemical parameters available in Java Protein Dossier - JPD can be used to paint the surfaces facilitating the analyses.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 1. |  | MORI, C. de. IAT: índice de atualização tecnológica. In: ENCONTRO DOS ENCONTROS DA SCOT CONSULTORIA, 5, 2018, Ribeirão Preto, SP. Anais... São Carlos,SP: Suprema Gráfica e Editora, 2018. p.273-279.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 2. | | MORI, C. de; CRESTANA, S. Gastos em pesquisa e desenvolvimento agrícola. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 699-702. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 7. | | MORI, C. de; HARGER, N.; DOSSA, A.; BODNAR, A.; FOLONI, J. S. S.; CESA, P. Perfil tecnológico de cultivo de trigo em lavouras tecnicamente assistidas no Paraná - safra 2012. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 7.; FÓRUM NACIONAL DO TRIGO, 8., 2013, Londrina. Resumos... [S.l.: s.n.], 2013. pdf 10_2. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 10. | | FARIAS, A. R.; MINGOTI, R.; HOLLER, W. A.; SPADOTTO, C. A.; LOVISI FILHO, E.; MORI, C. de; CUNHA, G. R. da; DOSSA, A. A.; FERNANDES, J. M. C.; SILVA, M. S. e. Estimativa do potencial de aumento da produção de trigo no Brasil: cenário 1. Campinas: Embrapa Gestão Territorial, 2015. 1 mapa. Escala 1:14.000.000| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial; Embrapa Trigo. |
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| 11. | | FARIAS, A. R.; MINGOTI, R.; HOLLER, W. A.; SPADOTTO, C. A.; LOVISI FILHO, E.; MORI, C. de; CUNHA, G. R. da; DOSSA, A. A.; FERNANDES, J. M. C.; SILVA, M. S. e. Estimativa do potencial de aumento da produção de trigo no Brasil: cenário 2. Campinas: Embrapa Gestão Territorial, 2015. 1 mapa. Escala 1:14.000.000.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial; Embrapa Trigo. |
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| 12. | | FARIAS, A. R.; MINGOTI, R.; HOLLER, W. A.; SPADOTTO, C. A.; LOVISI FILHO, E.; MORI, C. de; CUNHA, G. R. da; DOSSA, A. A.; FERNANDES, J. M. C.; SILVA, M. S. e. Estimativa do potencial de aumento da produção de trigo no Brasil: cenário 3. Campinas: Embrapa Gestão Territorial, 2015. 1 mapa. Escala 1:14.000.000.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial; Embrapa Trigo. |
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| 13. | | FARIAS, A. R.; MINGOTI, R.; HOLLER, W. A.; SPADOTTO, C. A.; LOVISI FILHO, E.; MORI, C. de; CUNHA, G. R. da; DOSSA, A. A.; FERNANDES, J. M. C.; SILVA, M. S. e. Estimativa do potencial de aumento da produção de trigo no Brasil: cenário 4. Campinas: Embrapa Gestão Territorial, 2015. 1 mapa. Escala 1:14.000.000.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial; Embrapa Trigo. |
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| 14. | | FARIAS, A. R.; MINGOTI, R.; HOLLER, W. A.; SPADOTTO, C. A.; LOVISI FILHO, E.; MORI, C. de; CUNHA, G. R. da; DOSSA, A. A.; FERNANDES, J. M. C.; SÓ E SILVA, M. Potencial de produção de trigo no Brasil a partir de diferentes cenários de expansão da área de cultivo. Passo Fundo: Embrapa Trigo; Campinas: Embrapa Gestão Territorial, 2016. 40 p. (Embrapa Trigo. Boletim de pesquisa e desenvolvimento online, 85; Embrapa Gestão Territorial. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 5)| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Territorial; Embrapa Trigo. |
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| 15. | | PIRES, J. L. F.; STRIEDER, M. L.; MORI, C. de; CAIERAO, E.; MARSARO JUNIOR, A. L.; PEREIRA, P. R. V. da S.; COSTAMILAN, L. M.; MACIEL, J. L. N.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; DALMAGO, G. A.; FOLONI, J. S. S.; SANTOS, H. P. dos; FAE, G. S.; SANTI, A.; CUNHA, G. R. da; VARGAS, L.; PASINATO, A.; VIEIRA, V; CARAFFA, M.; RIFFEL, C. T.; ALMEIDA, J. D.; SPADER, V.; FOSTIM; STOETZER; MULLER, A.; AIRES, R. F.; PAGANELLA, F. Estratégias de sucessão trigo/cevada/aveia preta-soja para sistemas de produção de grãos no sul do Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 10., 2016, Londrina. Anais... Londrina: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale, 2016. 5 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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