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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/02/2008 |
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Data da última atualização: |
24/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BERGER, I. J.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REIS, M. S.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Irving J. Berger, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcelo S. Reis, APTA; Maria Luísa P.N. Targon, APTA; Marcos A. Machado, APTA. |
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Título: |
In silico prediction of gene expression patterns in Citrus flavedo. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 752-760, 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Out of the 18,942 flavedo expressed sequences (clusters plus singletons) in Citrus sinensis from the Citrus EST Project (CitEST), 25 were statistically supported to be differentially expressed in this tissue after a double in silico hybridization strategy against leaf-, flower-, and bark-derived ESTs. Five of them, two terpene synthases and three O-methyltransferases, are absent in the other citrus tissues with concomitant 2x2 statistics, supporting the hypothesis that they are putative flavedo-specific expressed sequences. The pattern of these differentially expressed sequences during fruit development suggests that most of them are developmentally regulated. Some expressed gene products, including a putative germin-like protein highly expressed in flavedo, are shown to be promising candidates for further characterization. In addition to promoter seeking, this kind of analysis can lead to gene discovery, tissue-specific and tissue-enriched expression pattern predictions (as shown herein) and can also be adopted as an in silico first, and probably reliable approach, for detecting expression profiles from EST sequencing efforts before experimental validation is available or for heuristically guiding that validation. |
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Palavras-Chave: |
EST; Fruit; Orange; Tissue-specific. |
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Thesaurus Nal: |
gene expression. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 3. |  | ARAUJO, V. F.; MESSIAS, R. S.; SILVA, S. D. dos A. e.; PAGEL, I.; OLIVEIRA, T. R.; BERTOLI, R. F. Ocorrência de compostos fitoquímicos bioativos em variedades de milho crioulo da região sul do Brasil. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE MILHO, 53., REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE SORGO, 36., 2008. Pelotas. Atas e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 4. | | VIEIRA, C. L.; BERTOLI, R. F.; PEREIRA, F. B.; VALENTE, G. B.; PEREIRA, A. da S.; CASTRO, C. M. Resistência de clones de batata a Diabrotica speciosa. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 9., 2007, Pelotas. Pesquisa e responsabilidade ambiental: resumos expandidos ... Pelotas: UFPel: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, 2007. 01 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | MELO, M.; SILVA, L. P. da; CUNHA, D. D. da; BERTOLI, R. F.; ALMEIDA, D. X. de; SASSANOVIEZ, F.; GOMES, C. B. Potencial de controle de substâncias de origem vegetal e resíduos orgânicos no controle da mosca-das-frutas Anastrepha fraterculus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: resumos... Viçosa: UFV, 2008. 1 CD-ROM. ResumoID: 1395-1| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | BRESOLIN, A. P. S.; CASTRO, C. M.; HERTER, F. G.; OLIVEIRA, A. C. de; CARVALHO, F. I. F. de; PEREIRA, F. B.; VIEIRA, C. L.; BERTOLI, R. F. Tolerância ao frio do amendoim forrageiro. Ciência Rural, Santa Maria, v. 38, n. 4, p. 1154-1157, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| Registros recuperados : 6 | |
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