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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/02/2008 |
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Data da última atualização: |
24/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BERGER, I. J.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REIS, M. S.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Irving J. Berger, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcelo S. Reis, APTA; Maria Luísa P.N. Targon, APTA; Marcos A. Machado, APTA. |
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Título: |
In silico prediction of gene expression patterns in Citrus flavedo. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 752-760, 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Out of the 18,942 flavedo expressed sequences (clusters plus singletons) in Citrus sinensis from the Citrus EST Project (CitEST), 25 were statistically supported to be differentially expressed in this tissue after a double in silico hybridization strategy against leaf-, flower-, and bark-derived ESTs. Five of them, two terpene synthases and three O-methyltransferases, are absent in the other citrus tissues with concomitant 2x2 statistics, supporting the hypothesis that they are putative flavedo-specific expressed sequences. The pattern of these differentially expressed sequences during fruit development suggests that most of them are developmentally regulated. Some expressed gene products, including a putative germin-like protein highly expressed in flavedo, are shown to be promising candidates for further characterization. In addition to promoter seeking, this kind of analysis can lead to gene discovery, tissue-specific and tissue-enriched expression pattern predictions (as shown herein) and can also be adopted as an in silico first, and probably reliable approach, for detecting expression profiles from EST sequencing efforts before experimental validation is available or for heuristically guiding that validation. |
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Palavras-Chave: |
EST; Fruit; Orange; Tissue-specific. |
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Thesaurus Nal: |
gene expression. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 3. |  | FREITAS, A. C. R. de; CUNHA, L. M. S.; VENDRUSCULO, L. G.; RIBEIRO, M. R. M.; HANASHIRO, M. M.; OLIVEIRA, F. das C.; MACHADO, A. de P. S. Sispaf: ferramenta de comércio eletrônico para a agricultura familiar. Revista Agriculturas, v. 2, n. 2, p. 22-23, jun., 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 4. | | CUNHA, L. M. S.; FREITAS, A. C. R. de; VENDRUSCULO, L. G.; RIBEIRO, M. R. M.; HANASHIRO, M. M.; MACHADO, A. de P. S. SISPAF - Sistema de Informação e Promoção de Produtos e Serviços da Agricultura Familiar. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 5.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE TECNOLOGIA DA INFORMAÇÃO NO AGRONEGÓCIO COOPERATIVO, 2., 2005, Londrina. Agronegócio, tecnologia e inovação: anais. Londrina: Sociedade Brasileira de Informática Aplicada à Agropecuária e Agroindústria, 2005. 6 p. Editado por Augusto Guilherme de Araujo e Marcelo Giovanetti Canteri. Na publicação: Antônio Carlos Reis Freitas. SBI-AGRO 2005.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Meio-Norte. |
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| 5. | | FREITAS, A. C. R. de; CUNHA, L. M. S.; VENDRUSCULO, L. G.; RIBEIRO, M. R. M.; HANASHIRO, M. M.; OLIVEIRA, F. das C.; MACHADO, A. de P. S. Software Sispaf: ferramenta que facilita a comercialização de produtos agropecuários da agricultura familiar. In: OLIVEIRA, F. das C.; SOUSA, V. F. de; OLIVEIRA JÚNIOR, J. O. L. de (Ed.). Estratégias de desenvolvimento rural e alternativas tecnológicas para a agricultura familiar na Região Meio-Norte. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2008. Cap. 12. p. 359-376.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Meio-Norte. |
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| Registros recuperados : 6 | |
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