BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Mandioca e Fruticultura.
Data corrente:  12/02/2008
Data da última atualização:  24/07/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; AMARAL, A. M. do; SOUZA, A. A. de; LOCALI-FABRIS, E. C.; DORTA, S. de O.; BORGES, K. M.; SOUZA, J. M. de; RODRIGUES, C. M.; LUCHETA, A. R.; FREITAS-ÁSTUA, J.; MACHADO, M. A.
Afiliação:  Maria Luísa P. Natividade Targon, APTA; Marco Aurélio Takita, APTA; Alexandre M. do Amaral, CENARGEN; Alessandra A. de Souza, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Sílvia de Oliveira Dorta, APTA; Kleber Martins Borges, APTA; Juliana Mendonça de Souza, APTA; Carolina Munari Rodrigues, APTA; Adriano Reis Lucheta, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcos Antonio Machado, APTA.
Título:  CitEST libraries.
Ano de publicação:  2007
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 1019-1023, 2007.
ISSN:  1415-4757
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  In order to obtain a better understanding of what is citrus, 33 cDNA libraries were constructed from different citrus species and genera. Total RNA was extracted from fruits, leaves, flowers, bark, seeds and roots, and subjected or not to different biotic and abiotic stresses (pathogens and drought) and at several developmental stages. To identify putative promoter sequences, as well as molecular markers that could be useful for breeding programs, one shotgun library was prepared from sweet orange (Citrus sinensis var. Olimpia). In addition, EST libraries were also constructed for a citrus pathogen, the oomycete Phythophthora parasitica in either virulent or avirulent form. A total of 286,559 cDNA clones from citrus were sequenced from their 5 end, generating 242,790 valid reads of citrus. A total of 9,504 sequences were produced in the shotgun library and the valid reads were assembled using CAP3. In this procedure, we obtained 1,131 contigs and 4,083 singletons. A total of 19,200 cDNA clones from P. parasitica were sequenced, resulting in 16,400 valid reads. The number of ESTs generated in this project is, to our knowledge, the largest citrus sequence database in the world.
Palavras-Chave:  ESTs; Phytopathogen; Shotgun.
Thesaurus Nal:  Citrus.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF)
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CNPMF24301 - 1UPCAP - DDPublicação digital
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1.Imagem marcado/desmarcadoNICOLAU, M.; TERNES, S.; VISOLI, M. C. Estudo comparativo entre softwares SOC e R: módulo Modlin. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE PROBABILIDADE E ESTATÍSTICA, 2006, Caxambu. [Resumos...]. Caxambu: Associação Brasileira de Estatística, 2006. p. 1-12.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoNICOLAU, M.; FERNANDES, J. M. C. A predictive model for daily inoculum levels of Gibberella zeae in Passo Fundo, Brazil. International Journal of Agronomy, Cairo, 2012. 7 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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3.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, M. I. P. M.; NICOLAU, M. Progress of Fusarium head blight in the wheat cultivars BRS Guamirim and Frontana. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FUSARIUM HEAD BLIGHT, 5.; INTERNATIONAL WORKSHOP ON WHEAT BLAST, 2., 2016, Florianópolis. Book of abstracts... Passo Fundo: Ed. Universidade de Passo Fundo: Embrapa Trigo; Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2016. p. 100, sess. 4, abstr. P53. 5th International Symposium on Fusarium Head Blight.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMIRANDA, M. Z. de; PAIVA, F. F.; NICOLAU, M. Avaliação de conformidade de análises de cor de farinha de trigo em diferentes locais e instituições. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 10., 2016, Londrina. Anais... Londrina: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale, 2016. 5 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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5.Imagem marcado/desmarcadoNICOLAU, M.; PAVAN, W.; FERNANDES, J. M. C. Using a Bayesian model for estimating air borne infection risks: Fusarium head blight. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FUSARIUM HEAD BLIGHT, 5.; INTERNATIONAL WORKSHOP ON WHEAT BLAST, 2., 2016, Florianópolis. Book of abstracts... Passo Fundo: Ed. Universidade de Passo Fundo: Embrapa Trigo; Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2016. p. 82, sess. 4, abst. O16. 5th International Symposium on Fusarium Head Blight.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCOSTAMILAN, L. M.; GODOY, C. V.; NICOLAU, M. Controle de ferrugem de soja, safra 2007/08, em Passo Fundo: [resumo]. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO SUL, 36., 2008, Porto Alegre. Ata e resumos... Porto Alegre: Fepagro, 2008. p. 155.
Tipo: Resumo em Anais de CongressoCirculação/Nível: -- - --
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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7.Imagem marcado/desmarcadoROESLER, E. A.; MORÁS, A.; YAMAZAKI-LAU, E.; NICOLAU, M. Regeneração in vitro a partir de embriões maduros de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 7., 2011, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2011. 20 p. html. Sessão de Melhoramento e Biotecnologia. (Embrapa Trigo. Documentos online, 133).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSPRICIGO, P. C.; FERREIRA, M. D.; NICOLAU, M.; FRUETT, F. Medição de impactos durante a pós-colheita de frutas utilizando duas esferas instrumentadas. In: INAMASU, R. Y.; NAIME, J. de M.; RESENDE, A. V. de; BASSOI, L. H.; BERNARDI, A. de C. (Ed.). Agricultura de precisão: um novo olhar. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2011. p. 87-90.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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9.Imagem marcado/desmarcadoPIRES, P. C.; FERNANDES, J. M. C.; NICOLAU, M. Modelagem do progresso temporal e do padrão espacial de lesões de ferrugem da folha em trigo. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, n. 2, p. 97-107, 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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10.Imagem marcado/desmarcadoMACHADO, V. S.; NICOLAU, M.; PATRICIO, D. I.; CAIERAO, E. Verificação, avaliação e processamento das informações do programa de melhoramento de trigo para acesso e consulta por meio de bancos de dados relacional e grafo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 8.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 5., 2013, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 51. Editores técnicos: Joseani Mesquita Antunes, Ana Lídia Variani Bonato, Márcia Barrocas Moreira Pimentel.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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11.Imagem marcado/desmarcadoDEVOS, R. J. B.; TIBOLA, C. S.; GUARIENTI, E. M.; NICOLAU, M. Avaliação do polimento de trigo na redução dos níveis de deoxinivalenol. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 10., 2018, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 26. Resumos Graduação Pibic/CNPq.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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12.Imagem marcado/desmarcadoCUNHA, G. R. da; SANTI, A.; DALMAGO, G. A.; NICOLAU, M.; PASINATO, A. Análise de tendências na temperatura do ar e na precipitação pluvial na região de Passo Fundo, RS. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2007. 15 p. html. (Embrapa Trigo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento Online, 48).
Tipo: Boletim de Pesquisa e DesenvolvimentoCirculação/Nível: -- - --
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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13.Imagem marcado/desmarcadoMOSCHEN, F.; PRESTES, A. M.; SCHEEREN, P. L.; SANTANA, F. M.; NICOLAU, M.; CLEBSCH, C. C. Análise de Escalonamento Multidimensional (EDM) na comparação entre testes de condições controladas e de campo para identificação de resistência à mancha amarela do trigo. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S202, ago. 2008. Suplemento, ref MEL-013. Edição dos Resumos do XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago. 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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14.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, F. T.; MACIEL, J. L. N.; SCHEEREN, P. L.; NICOLAU, M. Severidade da brusone em uma população de trigo proveniente do cruzamento das cultivares BR-18 e Fontana avaliadas no estádio de planta jovem. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 3., 2007, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2007. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos Online, 82).
Tipo: Resumo em Anais de CongressoCirculação/Nível: -- - --
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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15.Imagem marcado/desmarcadoBAZZANO, C. F.; PEREIRA, B. H.; BARIONI, L. G.; MANCINI, A. L.; NICOLAU, M. sdsim: um pacote para modelagem e simulação de sistemas dinâmicos contínuos em R. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas. Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Campinas: Editora da Unicamp: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. p. 217-226. SBIAgro 2017. Na publicação: Luís Gustavo Barionni.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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16.Imagem marcado/desmarcadoFERNANDES, J. M. C.; DEL PONTE, E.; PAVAN, W.; NICOLAU, M. Risk mapping fusarium head blight of wheat in Brazil. In: NATIONAL FUSARIUM HEAD BLIGHT FORUM, 2009, Orlando. Proceeedings... Lexington: University of Kentucky, 2009. Session 2: FHB Management, p. 46.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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17.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, B. H.; BAZZANO, C. F.; BARIONI, L. G.; MANCINI, A. L.; NICOLAU, M. Uma aplicação desktop interativa para desenvolvedores e usuários de modelos de sistemas dinâmicos em R. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas. Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Campinas: Editora da Unicamp: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. p. 207-216. SBIAgro 2017. Na publicação: Luís Gustavo Barionni.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoNICOLAU, M.; DANELLI, A. L. D.; VIEIRA, A. H.; PAVAN, W.; FERNANDES, J. M. C. Using a bayesian model for estimating air borne infection risks: wheat blast. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FUSARIUM HEAD BLIGHT, 5.; INTERNATIONAL WORKSHOP ON WHEAT BLAST, 2., 2016, Florianópolis. Book of abstracts... Passo Fundo: Ed. Universidade de Passo Fundo: Embrapa Trigo; Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2016. p. 159, abstr. P95. 2nd International Workshop on Wheat Blast.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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19.Imagem marcado/desmarcadoZIMMERMANN, D.; SACCARDO, E.; SOARES, P. T.; MOMBACH, A. A.; BONOW, S.; NICOLAU, M. Caracterização morfológica de espigas e colmos de (Triticum aestivum L. em. Thell). In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 5., 2009, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2009. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos online, 115).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, M. I. P. M.; POLLO, B.; NASCIMENTO JUNIOR, A. do; MANICA, J.; NICOLAU, M. Avaliação de giberela em triticale em 2012. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 7.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 8., 2013, Londrina. Resumos... [S.l.: s.n., 2013. Fitopatologia. 1 CD-ROM.
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