| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
26/11/2009 |
|
Data da última atualização: |
15/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G. |
|
Afiliação: |
JOSÉ AUGUSTO SALIM, Estagiário/CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; FABIO ROGERIO DE MORAES, Bolsista/CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IZABELLA PENA NESHICH, Estagiária/CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
|
Título: |
MSSP: a web-based application for analysis of selected parameter from multiple structures in a graphical manner. |
|
Ano de publicação: |
2009 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. |
|
Páginas: |
Não paginado. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
X-Meeting 2009. |
|
Conteúdo: |
The Blue Star Sting?s module Multiples Structures Selected Parameter (MSSP) is software developed in Java and Perl programming languages. It allows comparing, in a graphical manner, a selected parameter out of a total of 150 parameters in a different protein structures previously aligned in a simple intuitive plot. From a local database containing more than 60,000 proteins structures users can choose a single protein structure or a set of them. First, the structures are aligned using a specific algorithm and than MSSP does a XY plot, where X represents the residues position and Y the selected parameter values for selected aligned structures. The structural alignment is obtained with the Matching Molecular Models Obtained from Theory (MAMMOTH) software using the version able to align multiples structures called MAMMOTH-mult. Observing the alignments in MSSP plot for a selected parameter is possible see how good an alignment is by observation of the incidence of peaks and valleys in the graphic, and so an insertion of gaps can improve the alignment to optimist incidences of this peaks and valleys. Of course a statistical computation is needed to optimize insertion of gaps and an analysis of a set of parameters is also needed. However with a good alignment algorithm and MSSP it is possible to create a more efficient algorithm to make optimized structural alignments. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Estruturas de proteínas; MAMMOTH; Matching Molecular Models Obtained from Theory (MAMMOTH). |
|
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Molecular dynamics; Protein structure. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
Marc: |
null
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 7 | |
| 2. |  | MORAES, E. A.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; PONTES, R. A. M.; FONSECA, J. F. da; MAFFILI, V. V.; PROSPERI, C. P.; CECON, P. R. Parâmetros reprodutivos de cabras da raça Toggenburg em lactação tratadas com somatotropina bovina recombinante (r-bST) e sincronizadas com CIDR reutilizado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 6 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|    |
| 3. | | MOARES, E. A.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; BRUSCHI, J. H.; FONSECA, J. F. da; CECON, P. R.; SILVA, M. R.; PONTES, R. A. M. Produção e composição do leite, parâmetros sanguíneos de cabras da raça Toggenburg tratadas com somatotropina bovina recombinante (r-bST). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. Produção animal e a segurança alimentar: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2004. 5 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 4. | | MORAES, E. A.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; MAFFILI, V. V.; FONSECA, J. F. da; BRUSCHI, J. H.; GUIMARAES, J. D.; CARVALHO, G. R. de. Crescimento folicular no intervalo do início do estro à ovulação de cabras lactantes tratadas com somatotropina bovina recombinante e sincronizadas com CIDR reutilizado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005. 4 f. CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 5. | | AMORIM, L. da S.; TORRES, C. A. A.; SIQUEIRA, L. G. B.; FONSECA, J. F. da; GUIMARÃES, J. D.; CARVALHO, G. R. de; ALVES, N. G.; OLIVEIRA, M. M. N. F. de. Embryo development and follicular status of Toggenburg does fed urea diet. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 40, n. 2, p. 277-285, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 6. | | AMORIM, L. da S.; TORRES, C. A. A.; MOARES, E. A.; SILVA, J. F. da; OLIVEIRA, R. F. M. de; FONSECA, J. F. da; FURST, R.; MAFFILI, V. V.; ALVES, N. G.; MAIA, W. N. P. Performance reprodutiva de coelhas primíparas submetidas ao manejo de demame temporário antes da cópula. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 4 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 7. | | AMORIM, E. A. M.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; FONSECA, J. F. da; GUIMARÃES, J. D.; PONTES, R. A. M.; MAFFILI, V. V.; BORGES, A. M. Dinâmica folicular em cabras da raça Toggenburg em lactação, tratadas com somatotopina bovina recombinante (R-BST). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 6 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| Registros recuperados : 7 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
