BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  26/11/2009
Data da última atualização:  15/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  MAZONI, I.; BORRO, L. C.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G.
Afiliação:  IVAN MAZONI, CNPTIA; L. C. BORRO, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSÉ AUGUSTO SALIM, Estagiário/CNPTIA; FABIO ROGERIO DE MORAES, Bolsista/CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IZABELLA PENA NESHICH, Estagiária/CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA.
Título:  Computational analysis of the secondary structure elements based on the physical chemical and geometrical descriptors and statistics data.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009.
Páginas:  Não paginado
Idioma:  Inglês
Notas:  X-Meeting 2009.
Conteúdo:  JSSD is software developed on the Java programming language, to analyze the secondary structure elements of the proteins. This analysis is based on the information about the amino acids physical chemical and geometrical parameters and allows characterize the functional proteins nanoenvironment, where the nucleation of secondary structure elements (alpha-helix, beta-sheets and loops) occurs (composed by initiation, propagation and termination). JSSD uses a database containing 720 different descriptors for each amino acid in any protein deposited in the PDB. Considering that each protein has 2 chains with 300 amino acids each one and there are more than 60000 structures deposited in the PDB, our database has 720 x 2 x 300 x 60,000 = 25,920,000,000 registers approximately. A first experiment was done with 40,710 proteins. We created data marts (extracts from PDB based on strict rules for selecting a particular characteristic) from these structures for the proteins families: all-alpha, all-beta and alpha + beta. Using only the amino acids sequence matching the initial and final position at selected secondary structure element and that has consensus on all three identifiers PDB, DSSP and Stride, the experiment showed that there are 34,095 alpha-helices on the all-alpha protein family; 8,645 beta-sheets on the all-beta protein family and 306,556 alpha-helices and 250,674 beta-sheets on the alpha + beta protein family (both secondary structure element of variable size starting from... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Análise computacional; Elementos de estrutura secundária; JSSD.
Thesagro:  Dados Estatísticos.
Thesaurus Nal:  Computer software.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA14193 - 2UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Identificação e controle de vírus da videira no Rio Grande do Sul. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 8., 1995, Bento Gonçlves, RS. Programas e Resumos... Novos rumos para a vitivinicultura brasileira. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 25 a 27 set. de 1996. p. 24. p. 24
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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2.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Caracterização do vírus do mosaico do picão (Bidens pilosa L.). 1978. 62 f. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) - Instituto de Ciências Biológicas, Universidade de Brasília, Brasília.
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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3.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. O cultivo da videira informacoes basicas Bento Goncalves: EMBRAPA-UEPAE de Bento Goncalves, RS, 1984. 44p. (EMBRAPA-UEPAE de Bento Goncalves, RS. Circular Tecnica, 10).
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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4.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Produção de mudas de videira. In: SILVEIRA, S. V. da; MONTEIRO, R. (Ed.). Implantação e manejo de vinhedos de base ecológica. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2011. p. 45-54. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 75).
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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5.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Produção de matrizes de produtoras e de porta-enxertos de videira livres de vírus. Bento Gonçalves: UEPAE de Bento Gonçalves, 1984. 4 p. (UEPAE de Bento Gonçalves. Pesquisa em Andamento, 12). Resultados provisórios, sujeitos a confirmação.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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6.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Principais vírus e doenças consideradas de origem viral que ocorrem nos vinhedos do Rio Grande do Sul. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 1992. 27 p. (Embrapa Uva e Vinho. Circular Técnica, 16).
Tipo: Circular Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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7.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Necrose das nervuras e manchas das nervuras da folha da videira, doenças que ocorrem de forma latente nos vinhedos do Rio Grande do Sul. Bento Gonçalves:Embrapa Uva e Vinho, 1996. 26 p. (Embrapa Uva e Vinho. Circular Técnica, 19).
Tipo: Circular Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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8.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. "Mel de Pierce" - doença bacteriana da videira de importância quarentenária para o Brasil. Embrapa Uva e Vinho, Bento Gonçalves, 2006. Publicado na Embrapa Uva e Vinho em 2007, época que o pesquisador ainda trabalhava nesta instituição.
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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9.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Morte de plantas de videira (Vitis spp) devido a ocorrência de fungos causadores de podridões radiculares e doenças vasculares. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho-UEPAE de Bento Gonçalves, 1981. 30 p. (Embrapa Uva e Vinho-UEPAE de Bento Gonçalves. Circular Técnica, 6).
Tipo: Circular Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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10.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Seleção sanitária da videira. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho-UEPAE de Bento Gonçalves, 1981. 16 p. (Embrapa Uva e Vinho-UEPAE de Bento Gonçalves. Circular Técnica, 7).
Tipo: Circular Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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11.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Vírus do intumecimento dos ramos da videira "Cork Bark" associado à morte de plantas de cultivares Européias. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 8., 1996, Bento Gonçalves. Resumos... Novos rumos para a vitivinicultura brasileira. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 25 a 27 set. 1996. p. 63.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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12.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. Vírus do intumescimento dos ramos associado a morte de plantas de cultivares Vitis vinifera. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 1999. 4 p. (Embrapa Uva e Vinho. Comunicado Técnico, 32).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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13.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B. (ed.). Uva para processamento: produção. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2003. 134 p. il. (Frutas do Brasil, 34).
Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais; Embrapa Uva e Vinho.
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14.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B.; NICKEL, O. Viroses e sua importância na viticultura brasileira. Informe Agropecuário, Belo Horizonte, v. 19, n. 194, p. 85-91, 1998. p. 85-91
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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15.Imagem marcado/desmarcadoSÓRIA, S. de J.; KUHN, G. B. Adendo à listagem de insetos, ácaros e nematóides de importância quarentenária para a videira no Brasil. Anais da Sociedade Entomológica do Brasil, Jaboticabal, v. 15, n. 2, p. 381-389, 1986.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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16.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B.; MANCO, G. R. Eficiência de tratamentos à base de produtos sistêmicos no controle do míldio da videira. Bento Gonçalves: EMBRAPA-UEPAE de Bento Gonçalves, 1982. 16 p. (EMBRAPA-UEPAE de Bento Gonçalves. Boletim de Pesquisa, 1).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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17.Imagem marcado/desmarcadoGRIGOLETTI JUNIOR, A.; KUHN, G. B. Considerações sobre alguns fungicidas sistêmicos e recomendações sobre seu uso no controle do míldio da videira. Bento Gonçalves: EMBRAPA-UEPAE de Bento Gonçalves, 1984. 5 p. (EMBRAPA-UEPAE de Bento Gonçalves. Comunicado Técnico, 2).
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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18.Imagem marcado/desmarcadoRIVALDO, O. F.; KUHN, G. B. Controle químico da antracnose da videira Elsinoe ampelina. Bento Gonçalves: EMBRAPA-UEPAE de Bento Gonçalves, 1982. 4 p. (EMBRAPA-UEPAE de Bento Gonçalves. Pesquisa em Andamento, 5).
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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19.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B.; FAJARDO, T. V. M. Doenças de uva. Cultivar Hortaliças e Frutas, Pelotas, v. 1, n. 1, p. 23-27, abr./maio 2000. p. 23-27 il.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - C
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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20.Imagem marcado/desmarcadoFRÁGUAS, J. C.; KUHN, G. B. Diferenças entre sintomas de deficiências minerais e de viroses em videira. Bento Gonçalves: EMBRAPA-CNPUV, 1989. 15 p. (EMBRAPA-CNPUV. Boletim de Pesquisa, 3).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
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