BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
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Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Soja.
Data corrente:  08/03/2005
Data da última atualização:  09/05/2025
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  BINNECK, E.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L.
Afiliação:  ELISEU BINNECK, CNPSO; JOAO FLAVIO VELOSO SILVA, GPR; NORMAN NEUMAIER, CNPSO; JOSE RENATO BOUCAS FARIAS, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO.
Título:  VSQual: a visual system to assist DNA sequencing quality control.
Ano de publicação:  2004
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Research, v. 3, n. 4, p. 474-482, 2004.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  A lack of plant software tools that support small- to medium-scale DNA sequencing efforts is a major hindrance for recording and using laboratory workflow information to monitor the overall quality of data production. Here we describe VSQual, a set of Perl programs intended to provide simple and powerful tools to check several quality features of the sequencing data generated by automated DNA sequencing machines. The core program of VSQual is a flexible Perl-based pipeline, designed to be accessible and useful for both programmers and non-programmers. This pipeline directs the processing steps and can be easily customized for laboratory needs. Basically, the raw DNA sequencing trace files are processed by Phred and Cross_match, then the outputs are parsed, reformatted into Web-based graphical reports, and added to a Web site structure. The result is a set of real time sequencing reports easily accessible and understood by common laboratory people. These reports facilitate the monitoring of DNA sequencing as well as the management of laboratory workflow, significantly reducing operational costs and ensuring high quality and scientifically reliable results.
Palavras-Chave:  Bioinformática; Sequenciamento de DNA.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Soja (CNPSO)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPSO24812 - 1UPCAP - DD
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Registros recuperados : 91
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1.Imagem marcado/desmarcadoDEMATTÊ, J. A. M.; CAMPOS, R. C.; ALVES, M. C. Avaliação espectral de solos desenvolvidos em uma topossequência de diabásio e folhelho da região de Piracicaba, SP. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 12, p. 2447-60, dez. 2000 Título em inglês: Spectral reflectance of soils developed on a toposequence of diabase and shale in Piracicaba, SP, Brazil.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoTSENG, C. L.; ALVES, M. C.; CRESTANA, S. Quantifying physical and structural soil properties using X-ray microtomography. Geoderma, v. 318, p. 78-87, maio 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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3.Imagem marcado/desmarcadoLING, T. C.; CRESTANA, S.; ALVES, M. C. Microtomografia de raio-x aplicada à análise da qualidade de solos. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 113. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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4.Imagem marcado/desmarcadoLING, T. C.; CRESTANA, S.; ALVES, M. C. O uso da técnica de tomografia computadorizada de raios-x (T.C.) na investigação de alguns atributos físicos de solos agricultáveis. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 29 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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5.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, M. A. B.; ALVES, M. C. S.; SALES JUNIOR, R. Atratividade de coleobrocas associadas a diferentes genótipos comerciais de coqueiro infectados pela resinose no Nordeste. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE ECOLOGIA QUÍMICA, 8., 2013, Natal. Anais... [S.l.]: Embrapa Tabuleiros Costeiros: EMPARN, 2013.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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6.Imagem marcado/desmarcadoALVES, M. C.; GONÇALVES, M. A.; MARCHI, P.; SILVA, M. L.; ANTUNES, L. E. C. Ácido sulfúrico na superação da dormência de sementes de morango. In: ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 6., 2014, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2014. 189 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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7.Imagem marcado/desmarcadoVALPASSOS, M. A. R.; CAVALCANTE, E. G. S.; CASSIOLATO, A. M. R.; ALVES, M. C. Effects of soil management systems on soil microbial activity, bulk density and chemical properties. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 12, p. 1539-1545, dez. 2001 Título em português: Efeitos de sistemas de uso e manejo na atividade microbiana, densidade e propriedades químicas do solo.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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8.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, M. A. B.; ALVES, M. C. S.; CARVALHO, H. W. L. de. Danos e alternativas de controle do percevejo-de-renda na cultura da mandioca no estado do Rio Grande do Norte. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2007.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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9.Imagem marcado/desmarcadoALVES, M. C.; GONÇALVES, M. A.; PICOLOTTO, L.; HOHN, D.; ANTUNES, L. E. C. Doses de GA3 na germinação de sementes de pitangueira. In: ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 6., 2014, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2014. 189 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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10.Imagem marcado/desmarcadoALVES, M. C. S.; ARAGÃO, W. M.; OLIVEIRA, J. S. F. de. Caracterizaçõ de população de coqueiro gigante do Brasil no Rio Grande do Norte. In: FEIRA INTERNACIONAL DE FRUTICULTURA - EXPOFRUIT, 2008, Mossoró. Anais... Mossoró: COEX, 2008. Melhoramento genético de plantas. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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11.Imagem marcado/desmarcadoMARCHI, P. M.; GONÇALVES, M. A.; ALVES, M. C.; MOREIRA, R. M.; ANTUNES, L. E. C. Fenologia de cultivares de mirtileiro nas condições edafoclimáticas de Pelotas/RS. In: ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 6., 2014, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2014. 189 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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12.Imagem marcado/desmarcadoTSENG, C. L.; ALVES, M. C.; MILORI, D. M. B. P.; CRESTANA, S. Geometric characterization of soil structure through unconventional analytical tools. Soil & Tillage Research, v. 181, p. 37-45, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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13.Imagem marcado/desmarcadoALVES, R. C.; ALVES, M. C.; REICHERT, L. J.; MERHEB, M.; FERNANDES, L. A. de O. O Fórum de Agricultura Familiar na Região Sul do RS: Agriculturas de base ecológica - Espaços rurais potenciais para o desenvolvimento do turismo rural sustentável no território. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO, 11., 2016, Pelotas. Abordagem sistêmica e sustentabilidade: produção agropecuária, consumo e saúde: anais. Pelotas: Sociedade Brasileira de Sistemas de Produção, 2016. 1615 p.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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14.Imagem marcado/desmarcadoTAVARES, A. N. G.; ALVES, M. C.; CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A. Genetic transformation of immature maize embryos mediated by Agrobacterium rhizogenes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 35.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.
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15.Imagem marcado/desmarcadoTSENG, C. L., ALVES, M. C., SOUTO-FILHO, S. N., SOUZA, E. J.; CRESTANA, S. Microtomografia de raios-X aplicada ao estudo da qualidade física do solo. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 281-284. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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16.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, M. A. B.; LIRA, M. A.; ALVES, M. C. S.; TALAMINI, V. Ocorrência de doenças fúngicas na cultura do girassol no Rio Grande do Norte. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2009. 4 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Comunicado Técnico, 95).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, M. A. B.; LIRA, M. A.; ALVES, M. C. S.; ESPÍNOLA SOBRINHO, E.; OLIVEIRA, J. S. F. de. Avaliação de diferentes genótipos quanto a infecção fúngica na cultura do girassol no Rio Grande do Norte. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4., 2010, João Pessoa. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010. 1 CD-ROM. p. 1558 Artigo em anais. MEG 22 pdf.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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18.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, M. A. B.; FARIAS, A. R. de; ALVES, M. C. S.; CARVALHO, H. W. L. de. Alternativas para o controle da mosca-branca Aleurothrixus aepim na cultura da mandioca em Sergipe. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2006. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Comunicado Técnico, 56).
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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19.Imagem marcado/desmarcadoCARVALHO, M. A. C. de; ATHAYDE, M. L. F.; SORATTO, R. P.; ALVES, M. C.; SÁ, M. E. de. Adubação verde e sistemas de manejo do solo na produtividade do algodoeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 12, p. 1205-1211, dezembro 2004 Título em inglês: Green manure and soil management systems on cotton yield.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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20.Imagem marcado/desmarcadoPINHEIRO, J. B.; POZZA, E. A.; POZZA, A. A. A.; MOREIRA, A. de S.; ALVES, M. C. Severidade da ferruagem da soja em função do suprimento de potássio e cálcio em solução nutritiva. Revista Ceres, Viçosa, MG, v. 58, n. 1, p. 43-50, jan./fev. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.
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