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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
26/03/2009 |
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Data da última atualização: |
15/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECILIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; LUIZ CÉSAR BORRO; DANIEL ALVARENGA; PABLO LIRA CECÍLIO; THAÍS VITAL PELLIGRINELLI; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
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Título: |
Structure descriptors of chameleon sequences. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile, 2008. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
RIB 2008. |
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Conteúdo: |
It has been know since the early work by Sander and Kabsch in 1984 that some identical sequence motifs make completely different local (but extented) folds. In that work, Sander and Kabsch showed the existence of a number of pentapeptides, capable of nucleating both alpha helix and beta strand in different sequence and structure constellations. However, the authors had at that time a very limited universe on which to base their conclusions; namely, the size of the PDB at that time (1984) was only 154 protein structure available. In 2008 the number of available structure is 51,079 (May 27th), 47137containing proteins only. Consequenly, the database is 306 times larger and we took full advantage of this fact. In order to analyze chameleon sequences, we established very strict rules and considered only those ones that passed the test of consensus among HSSP and STRIDE definitions for the Secondary Structure Elements. This is a major difference in our approach versus that of Sander and Kabsch. We then created a data mart of sequences and respective structures with variable size and subjected them to analysis of structure descriptors stored in STING_RDB. Results are discussed in terms of the influence that a local 3D environment has on SSE necleation. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Proteinas. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Proteins. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 9 | |
| 3. |  | FERREIRA, K. S. M.; ELOY, A. M. X.; SANTOS, F. C. P.; SILVA, N. M. da; FURTADO, J. R. Utilização da cromatografia líquida de Alta eficiência (HPLC) para purificação de Proteínas do plasma seminal de caprinos Moxotó. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 1., 2012, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2012. p. 38-39. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 104).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 4. | | SANTOS, F. C. P.; PEREIRA, E. P.; ELOY, A. M. X.; VALLE, R. V.; FERREIRA, K. S. M.; FURTADO, J. R. Variação sazonal dos picos cromatográficos das proteínas com afinidade à heparina no plasma seminal de caprinos Moxotó. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 20., 2013, Uberlandia. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2013. p. 305.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | SANTOS, F. C. P. dos; VALLE, R. V. do; SILVA, N. M. M.; BARBOSA, M. de M.; PERES, M. C. R.; ELOY, A. M. X.; FURTADO, J. R. Caracterização dos perfis eletroforéticos de proteínas do plasma seminal e sanguíneo de caprinos da raça Moxotó. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ, 7., 2010, Sobral. Iniciação para o semiárido: [Resumos]. Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2010. 1 CD ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | BRITO, R. L. L. de; RODRIGUES, A. de S.; SANTOS, F. C. P. dos; ANDRIOLI, A.; ALVES, F. S. F.; PINHEIRO, R. R. Implicações do Vírus da Artrite-Encefalite Caprina na qualidade físico-química do leite de cabras mestiças. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009. 3 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | SANTOS, F. C. P. dos; MELO, F. C. C. de; ARAGÃO, A. A.; SOUZA, T. S. de; PINHEIRO, R. R.; CARVALHO, F. C. de. Perfil metabólico de ovelhas Rabo Largo criadas em dois sistemas de alimentação. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 f.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | SANTOS, F. C. P. dos; ELOY, A. M. X.; FERREIRA, K. S. de M.; SILVA, N. M. M.; FURTADO, J. R.; LIMA, F. R. G. Proteínas dos espermatozoides de ovinos Morada Nova. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM. Título em inglês: Sperm proteins of Morada Nova sheep.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 9. | | ÁVILA, A. A.; MELO, F. C. C. de; SANTOS, F. C. P. dos; SANTOS, C. M. dos; ANDRIOLI, A.; SANTOS, V. W. S. dos; PINHEIRO, R. R.; COSTA, A. P. da. Enquete sorológica do Maedi-Visna em rebanho de ovelhas Rabo Largo no Norte do Ceará. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012. 3 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Registros recuperados : 9 | |
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